RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		14.19	□□□□□ -0.14
TTLL3-233	ENST00000602338	NAPB	Q9H115	298 aa		14.19	□□□□□ -0.14
TTLL3-233	ENST00000602338	SPC25	Q9HBM1	224 aa		14.19	□□□□□ -0.14
TTLL3-233	ENST00000602338	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		14.19	□□□□□ -0.14
TTLL3-233	ENST00000602338	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	14.19	□□□□□ -0.14
TTLL3-233	ENST00000602338	GRIN2D	O15399	1336 aa		14.18	□□□□□ -0.14
TTLL3-233	ENST00000602338	ALAS1	P13196	640 aa		14.18	□□□□□ -0.14
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC1A4	P43007	532 aa		14.18	□□□□□ -0.14
TTLL3-233	ENST00000602338	TNFAIP2	Q03169	654 aa		14.18	□□□□□ -0.14
TTLL3-233	ENST00000602338	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		14.18	□□□□□ -0.14
TTLL3-233	ENST00000602338	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	14.18	□□□□□ -0.14
TTLL3-233	ENST00000602338	CCDC174	Q6PII3	467 aa		14.18	□□□□□ -0.14
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF365	Q70YC5	407 aa		14.18	□□□□□ -0.14
TTLL3-233	ENST00000602338	TLK2	Q86UE8	772 aa		14.18	□□□□□ -0.14
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM160B2	Q86V87	743 aa		14.18	□□□□□ -0.14
TTLL3-233	ENST00000602338	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	14.18	□□□□□ -0.14
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		14.18	□□□□□ -0.14
TTLL3-233	ENST00000602338	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		14.18	□□□□□ -0.14
TTLL3-233	ENST00000602338	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		14.18	□□□□□ -0.14
TTLL3-233	ENST00000602338	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	14.18	□□□□□ -0.14
TTLL3-233	ENST00000602338	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		14.18	□□□□□ -0.14
TTLL3-233	ENST00000602338	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		14.18	□□□□□ -0.14
TTLL3-233	ENST00000602338	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	14.18	□□□□□ -0.14
TTLL3-233	ENST00000602338	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		14.18	□□□□□ -0.14
TTLL3-233	ENST00000602338	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		14.17	□□□□□ -0.14
TTLL3-233	ENST00000602338	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		14.17	□□□□□ -0.14
TTLL3-233	ENST00000602338	FDX1	P10109	184 aa		14.17	□□□□□ -0.14
TTLL3-233	ENST00000602338	SMPD1	P17405	629 aa		14.17	□□□□□ -0.14
TTLL3-233	ENST00000602338	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	14.17	□□□□□ -0.14
TTLL3-233	ENST00000602338	VPS53	Q5VIR6	699 aa		14.17	□□□□□ -0.14
TTLL3-233	ENST00000602338	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	14.17	□□□□□ -0.14
TTLL3-233	ENST00000602338	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		14.17	□□□□□ -0.14
TTLL3-233	ENST00000602338	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		14.17	□□□□□ -0.14
TTLL3-233	ENST00000602338	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		14.17	□□□□□ -0.14
TTLL3-233	ENST00000602338	STX8	Q9UNK0	236 aa		14.17	□□□□□ -0.14
TTLL3-233	ENST00000602338	TRANK1	O15050	2925 aa		14.17	□□□□□ -0.14
TTLL3-233	ENST00000602338	SCN5A	Q14524	2016 aa		14.17	□□□□□ -0.14
TTLL3-233	ENST00000602338	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		14.16	□□□□□ -0.14
TTLL3-233	ENST00000602338	ASB14	A6NK59	587 aa		14.16	□□□□□ -0.14
TTLL3-233	ENST00000602338	PLA2G6	O60733	806 aa		14.16	□□□□□ -0.14
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	14.16	□□□□□ -0.14
TTLL3-233	ENST00000602338	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	14.16	□□□□□ -0.14
TTLL3-233	ENST00000602338	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		14.16	□□□□□ -0.14
TTLL3-233	ENST00000602338	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	14.16	□□□□□ -0.14
TTLL3-233	ENST00000602338	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		14.16	□□□□□ -0.14
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM199	Q8N511	208 aa		14.16	□□□□□ -0.14
TTLL3-233	ENST00000602338	PRDM12	Q9H4Q4	367 aa		14.16	□□□□□ -0.14
TTLL3-233	ENST00000602338	MTMR7	Q9Y216	660 aa		14.16	□□□□□ -0.14
TTLL3-233	ENST00000602338	BDP1	A6H8Y1	2624 aa		14.15	□□□□□ -0.14
TTLL3-233	ENST00000602338	TSPY2	A6NKD2	308 aa		14.15	□□□□□ -0.14
TTLL3-233	ENST00000602338	ERC2	O15083	957 aa		14.15	□□□□□ -0.14
TTLL3-233	ENST00000602338	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	14.15	□□□□□ -0.14
TTLL3-233	ENST00000602338	MX1	P20591	662 aa		14.15	□□□□□ -0.14
TTLL3-233	ENST00000602338	PSMC6	P62333	389 aa		14.15	□□□□□ -0.14
TTLL3-233	ENST00000602338	TKFC	Q3LXA3	575 aa		14.15	□□□□□ -0.14
TTLL3-233	ENST00000602338	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		14.15	□□□□□ -0.14
TTLL3-233	ENST00000602338	VWCE	Q96DN2	955 aa		14.15	□□□□□ -0.14
TTLL3-233	ENST00000602338	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	14.15	□□□□□ -0.14
TTLL3-233	ENST00000602338	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		14.15	□□□□□ -0.14
TTLL3-233	ENST00000602338	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		14.15	□□□□□ -0.14
TTLL3-233	ENST00000602338	HIPK3	Q9H422	1215 aa		14.15	□□□□□ -0.14
TTLL3-233	ENST00000602338	IL23A	Q9NPF7	189 aa		14.15	□□□□□ -0.14
TTLL3-233	ENST00000602338	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		14.15	□□□□□ -0.14
TTLL3-233	ENST00000602338	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		14.14	□□□□□ -0.15
TTLL3-233	ENST00000602338	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	14.14	□□□□□ -0.15
TTLL3-233	ENST00000602338	B4GALT4	O60513	344 aa		14.14	□□□□□ -0.15
TTLL3-233	ENST00000602338	NOV	P48745	357 aa		14.14	□□□□□ -0.15
TTLL3-233	ENST00000602338	ITGA7	Q13683	1181 aa		14.14	□□□□□ -0.15
TTLL3-233	ENST00000602338	ADGRE1	Q14246	886 aa		14.14	□□□□□ -0.15
TTLL3-233	ENST00000602338	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		14.14	□□□□□ -0.15
TTLL3-233	ENST00000602338	NSMF	Q6X4W1	530 aa		14.14	□□□□□ -0.15
TTLL3-233	ENST00000602338	HERVK_113	Q902F9	699 aa		14.14	□□□□□ -0.15
TTLL3-233	ENST00000602338	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	14.14	□□□□□ -0.15
TTLL3-233	ENST00000602338	NCOR1	O75376	2440 aa		14.14	□□□□□ -0.15
TTLL3-233	ENST00000602338	LAMA4	Q16363	1823 aa		14.13	□□□□□ -0.15
TTLL3-233	ENST00000602338	NFIB	O00712	420 aa		14.13	□□□□□ -0.15
TTLL3-233	ENST00000602338	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	14.13	□□□□□ -0.15
TTLL3-233	ENST00000602338	CABYR	O75952	493 aa		14.13	□□□□□ -0.15
TTLL3-233	ENST00000602338	ICAM1	P05362	532 aa		14.13	□□□□□ -0.15
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC16A2	P36021	539 aa		14.13	□□□□□ -0.15
TTLL3-233	ENST00000602338	CCL23	P55773	120 aa		14.13	□□□□□ -0.15
TTLL3-233	ENST00000602338	CCDC96	Q2M329	555 aa		14.13	□□□□□ -0.15
TTLL3-233	ENST00000602338	TJAP1	Q5JTD0	557 aa		14.13	□□□□□ -0.15
TTLL3-233	ENST00000602338	MORC4	Q8TE76	937 aa		14.13	□□□□□ -0.15
TTLL3-233	ENST00000602338	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		14.13	□□□□□ -0.15
TTLL3-233	ENST00000602338	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	14.13	□□□□□ -0.15
TTLL3-233	ENST00000602338	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		14.13	□□□□□ -0.15
TTLL3-233	ENST00000602338	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		14.13	□□□□□ -0.15
TTLL3-233	ENST00000602338	PTPRS	Q13332	1948 aa		14.12	□□□□□ -0.15
TTLL3-233	ENST00000602338	ORC4	O43929	436 aa		14.12	□□□□□ -0.15
TTLL3-233	ENST00000602338	FGR	P09769	529 aa		14.12	□□□□□ -0.15
TTLL3-233	ENST00000602338	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		14.12	□□□□□ -0.15
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		14.12	□□□□□ -0.15
TTLL3-233	ENST00000602338	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		14.12	□□□□□ -0.15
TTLL3-233	ENST00000602338	DCAF4	Q8WV16	495 aa		14.12	□□□□□ -0.15
TTLL3-233	ENST00000602338	PPM1E	Q8WY54	764 aa		14.12	□□□□□ -0.15
TTLL3-233	ENST00000602338	GAS2L1	Q99501	681 aa	Predicted RBP	14.12	□□□□□ -0.15
TTLL3-233	ENST00000602338	VTA1	Q9NP79	307 aa		14.12	□□□□□ -0.15
TTLL3-233	ENST00000602338	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	14.12	□□□□□ -0.15
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A0D9SFI3	127 aa		14.11	□□□□□ -0.15

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