RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 SASS6Q6UVJ0 657 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-212ENST00000591041 SLF1Q9BQI6 1058 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-212ENST00000591041 USP25Q9UHP3 1055 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-212ENST00000591041 NR1I2O75469 434 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-212ENST00000591041 PTPRAP18433 802 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-212ENST00000591041 MCM7P33993 719 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-212ENST00000591041 PRPHP41219 470 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-212ENST00000591041 BACE1P56817 501 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-212ENST00000591041 KIFC2Q96AC6 838 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-212ENST00000591041 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-212ENST00000591041 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-212ENST00000591041 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-212ENST00000591041 ZBED4O75132 1171 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-212ENST00000591041 LONP1P36776 959 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-212ENST00000591041 PTGDRQ13258 359 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-212ENST00000591041 INF2Q27J81 1249 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-212ENST00000591041 SAMD3Q8N6K7 520 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-212ENST00000591041 RAB34Q9BZG1 259 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-212ENST00000591041 TANGO6Q9C0B7 1094 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-212ENST00000591041 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-212ENST00000591041 SPDYE3A6NKU9 549 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-212ENST00000591041 PFKFB1P16118 471 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-212ENST00000591041 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-212ENST00000591041 DTHD1Q6ZMT9 781 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-212ENST00000591041 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-212ENST00000591041 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP25.72■■□□□ 1.718e-20■■□□□ 14.3
CAPNS1-212ENST00000591041 C12orf42Q96LP6 360 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-212ENST00000591041 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-212ENST00000591041 A0A1B0GVL5 298 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-212ENST00000591041 FSD2A1L4K1 749 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-212ENST00000591041 UNCXA6NJT0 531 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-212ENST00000591041 SPP2Q13103 211 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-212ENST00000591041 MTMR2Q13614 643 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-212ENST00000591041 ARMC9Q7Z3E5 817 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-212ENST00000591041 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-212ENST00000591041 ENGASEQ8NFI3 743 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-212ENST00000591041 TBCKQ8TEA7 893 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-212ENST00000591041 KCNH3Q9ULD8 1083 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-212ENST00000591041 ZHX2Q9Y6X8 837 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-212ENST00000591041 NEMFO60524 1076 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF202O95125 648 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 NDUFA8P51970 172 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM266Q2M3C6 531 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 LETM2Q2VYF4 491 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 MCF2L2Q86YR7 1114 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 RASGRP4Q8TDF6 673 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM205CA6NFA0 338 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 DEKP35659 375 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 CLK2P49760 499 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 USP11P51784 963 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 USH1GQ495M9 461 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 AK8Q96MA6 479 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 GRPEL1Q9HAV7 217 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 HPSEQ9Y251 543 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 PIK3CDO00329 1044 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 MARCH6O60337 910 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 USP2O75604 605 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 FLOT1O75955 427 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 PPP4R3AQ6IN85 833 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 CDCA5Q96FF9 252 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 MAF1Q9H063 256 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 CLEC11AQ9Y240 323 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 MYPNQ86TC9 1320 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 ADM5C9JUS6 153 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 ICAM1P05362 532 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 OR52Z1P0C646 297 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 POLR2MP0CAP2 368 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 VCAM1P19320 739 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 SHC4Q6S5L8 630 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 MOXD1Q6UVY6 613 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 CNNM3Q8NE01 707 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 VWA3AA6NCI4 1184 aa25.66■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 CAMK4Q16566 473 aa25.66■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC174Q6PII3 467 aa25.66■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 CEP57L1Q8IYX8 460 aa25.66■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 CSRNP2Q9H175 543 aa25.66■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC39Q9UFE4 941 aa25.66■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa25.66■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 USP17L15C9J2P7 530 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 USP17L13C9JLJ4 530 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 USP17L11C9JVI0 530 aa25.65■■□□□ 1.7
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