RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584328.1

NF1-223, Transcript of neurofibromin 1, human

TSL 2

Gene NF1, Length 566 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NF1-223	ENST00000584328	GUCY2C	P25092	1073 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	POU5F2	Q8N7G0	328 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	ABHD4	Q8TB40	342 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	MYLIP	Q8WY64	445 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	LIN37	Q96GY3	246 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	CRBN	Q96SW2	442 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	TGIF2	Q9GZN2	237 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	FBXL21	Q9UKT6	434 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	PCDHB12	Q9Y5F1	795 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	PTPRT	O14522	1441 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	ERVK-7	P63135	1459 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	TET3	O43151	1660 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	IQCJ-SCHIP1	C9J366	451 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	HPX	P02790	462 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	GJA8	P48165	433 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	UNC5A	Q6ZN44	842 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	RNF111	Q6ZNA4	994 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	PDZD8	Q8NEN9	1154 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	FOXP3	Q9BZS1	431 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	ACBD3	Q9H3P7	528 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	CCSER2	Q9H7U1	834 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	CHST7	Q9NS84	486 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	FAM120A	Q9NZB2	1118 aa	Known RBP eCLIP	7.48	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	NUP155	O75694	1391 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	KANK1	Q14678	1352 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328		C9IYK1	514 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	RPL10	P27635	214 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	TRHR	P34981	398 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	PCBP3	P57721	371 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	MLANA	Q16655	118 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	MPZL3	Q6UWV2	235 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	OXR1	Q8N573	874 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	ZNF428	Q96B54	188 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	TCFL5	Q9UL49	500 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	PLA2R1	Q13018	1463 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	CEP152	O94986	1710 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	SYNM	O15061	1565 aa		7.46	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	MEIS1	O00470	390 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NF1-223	ENST00000584328	SYP	P08247	313 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NF1-223	ENST00000584328	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
NF1-223	ENST00000584328	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
NF1-223	ENST00000584328	DUSP4	Q13115	394 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NF1-223	ENST00000584328	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NF1-223	ENST00000584328	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
NF1-223	ENST00000584328	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NF1-223	ENST00000584328	EBF1	Q9UH73	591 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NF1-223	ENST00000584328	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NF1-223	ENST00000584328	PIK3C2B	O00750	1634 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NF1-223	ENST00000584328		E9PCH4	1651 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NF1-223	ENST00000584328	NLRP1	Q9C000	1473 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NF1-223	ENST00000584328	FITM1	A5D6W6	292 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NF1-223	ENST00000584328	FKTN	O75072	461 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NF1-223	ENST00000584328	FARP2	O94887	1054 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
NF1-223	ENST00000584328	ZNF648	Q5T619	568 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
NF1-223	ENST00000584328	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NF1-223	ENST00000584328	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NF1-223	ENST00000584328	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NF1-223	ENST00000584328	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
NF1-223	ENST00000584328	SP110	Q9HB58	689 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NF1-223	ENST00000584328	FAM86C1	Q9NVL1	165 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NF1-223	ENST00000584328	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NF1-223	ENST00000584328	ZNF281	Q9Y2X9	895 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NF1-223	ENST00000584328	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NF1-223	ENST00000584328	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
NF1-223	ENST00000584328	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		7.44	□□□□□ -1.22
NF1-223	ENST00000584328	TRPM2	O94759	1503 aa		7.44	□□□□□ -1.22
NF1-223	ENST00000584328	SHOX	O15266	292 aa		7.44	□□□□□ -1.22
NF1-223	ENST00000584328	TP53	P04637	393 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
NF1-223	ENST00000584328	GIPR	P48546	466 aa		7.44	□□□□□ -1.22
NF1-223	ENST00000584328	BBS9	Q3SYG4	887 aa		7.44	□□□□□ -1.22
NF1-223	ENST00000584328	PRR23B	Q6ZRT6	265 aa		7.44	□□□□□ -1.22
NF1-223	ENST00000584328	KRTAP19-1	Q8IUB9	90 aa		7.44	□□□□□ -1.22
NF1-223	ENST00000584328	SPPL2C	Q8IUH8	684 aa		7.44	□□□□□ -1.22
NF1-223	ENST00000584328	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		7.44	□□□□□ -1.22
NF1-223	ENST00000584328	OR6P1	Q8NGX9	317 aa		7.44	□□□□□ -1.22
NF1-223	ENST00000584328	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		7.44	□□□□□ -1.22
NF1-223	ENST00000584328	LINC01599	Q8WXQ3	324 aa		7.44	□□□□□ -1.22
NF1-223	ENST00000584328	PRR13	Q9NZ81	148 aa		7.44	□□□□□ -1.22
NF1-223	ENST00000584328	TNR	Q92752	1358 aa		7.44	□□□□□ -1.22
NF1-223	ENST00000584328	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NF1-223	ENST00000584328	TMEM82	A0PJX8	343 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NF1-223	ENST00000584328	C8A	P07357	584 aa		7.43	□□□□□ -1.22

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