RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 ADAM17P78536 824 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 KRTAP1-1Q07627 177 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 TCTN2Q96GX1 697 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 MAF1Q9H063 256 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 COMMD10Q9Y6G5 202 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 FANCIQ9NVI1 1328 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 IRS2Q9Y4H2 1338 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 PRR36Q9H6K5 1346 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 GOLGA6CA6NDK9 693 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 GOLGA6BA6NDN3 693 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 FADS2P1A8MWK0 482 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 OVOL3O00110 214 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 MATN3O15232 486 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 STK10O94804 968 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 ITGB3P05106 788 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 GOLGA6DP0CG33 693 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 SSR1P43307 286 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 RNF4P78317 190 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 NR1I3Q14994 352 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 TAF3Q5VWG9 929 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 SLC16A11Q8NCK7 471 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 PMM1Q92871 262 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 SORCS2Q96PQ0 1159 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 SMPD4Q9NXE4 827 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 A0A1W2PQY0 241 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 NUDT19A8MXV4 375 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 PARNO95453 639 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 BPNT1O95861 308 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 FSHBP01225 129 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 SYPP08247 313 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 PRKCAP17252 672 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 SCP2P22307 547 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 COPB2P35606 906 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 MAPKAPK2P49137 400 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 NCKAP1LP55160 1127 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 CYP4F8P98187 520 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 MAP3K11Q16584 847 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 BBS9Q3SYG4 887 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 NT5DC1Q5TFE4 455 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 NBPF6Q5VWK0 638 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 LIPIQ6XZB0 460 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 FERMT3Q86UX7 667 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 CREBRFQ8IUR6 639 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP3.81□□□□□ -1.81e-7■■□□□ 14.3
PTPRM-204ENST00000577468 AMOTL1Q8IY63 956 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 NBPF4Q96M43 638 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 ACSL6Q9UKU0 697 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 FKTNO75072 461 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 MSL3P1P0C860 447 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 GNA15P30679 374 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 GBP1P32455 592 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 IGBP1P78318 339 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 VWA3BQ502W6 1294 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 C4orf46Q504U0 113 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 CPZQ66K79 652 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 RPTNQ6XPR3 784 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 PHACTR4Q8IZ21 702 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 ASB16Q96NS5 453 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 SENP7Q9BQF6 1050 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM51Q9NW97 253 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 REV1Q9UBZ9 1251 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 SUSD2Q9UGT4 822 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 SH3D21A4FU49 640 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 RGS13O14921 159 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 BDNFP23560 247 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 LIMS1P48059 325 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 HMGA2P52926 109 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 MTA1Q13330 715 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRM-204ENST00000577468 KIR3DS1Q14943 382 aa3.79□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.9 ms