RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569773.1

GDE1-204, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

TSL 3

Gene GDE1, Length 739 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-204ENST00000569773 TNNI2P48788 182 aa7.43□□□□□ -1.22
GDE1-204ENST00000569773 CDK8P49336 464 aa7.43□□□□□ -1.22
GDE1-204ENST00000569773 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa7.43□□□□□ -1.22
GDE1-204ENST00000569773 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
GDE1-204ENST00000569773 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
GDE1-204ENST00000569773 PHACTR3Q96KR7 559 aa7.43□□□□□ -1.22
GDE1-204ENST00000569773 SUGCTQ9HAC7 445 aa7.43□□□□□ -1.22
GDE1-204ENST00000569773 NMRK2Q9NPI5 230 aa7.43□□□□□ -1.22
GDE1-204ENST00000569773 KCNQ5Q9NR82 932 aa7.43□□□□□ -1.22
GDE1-204ENST00000569773 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa7.43□□□□□ -1.22
GDE1-204ENST00000569773 AP4E1Q9UPM8 1137 aa7.43□□□□□ -1.22
GDE1-204ENST00000569773 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa7.43□□□□□ -1.22
GDE1-204ENST00000569773 GNAT3A8MTJ3 354 aa7.42□□□□□ -1.22
GDE1-204ENST00000569773 DCDC2CA8MYV0 355 aa7.42□□□□□ -1.22
GDE1-204ENST00000569773 TMPRSS2O15393 492 aa7.42□□□□□ -1.22
GDE1-204ENST00000569773 GREM1O60565 184 aa7.42□□□□□ -1.22
GDE1-204ENST00000569773 TOMM70O94826 608 aa7.42□□□□□ -1.22
GDE1-204ENST00000569773 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
GDE1-204ENST00000569773 PAK2Q13177 524 aa7.42□□□□□ -1.22
GDE1-204ENST00000569773 INPP5AQ14642 412 aa7.42□□□□□ -1.22
GDE1-204ENST00000569773 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
GDE1-204ENST00000569773 ANKRD34AQ69YU3 496 aa7.42□□□□□ -1.22
GDE1-204ENST00000569773 ZNF790Q6PG37 636 aa7.42□□□□□ -1.22
GDE1-204ENST00000569773 Q6ZS46 218 aa7.42□□□□□ -1.22
GDE1-204ENST00000569773 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
GDE1-204ENST00000569773 TXNRD3Q86VQ6 643 aa7.42□□□□□ -1.22
GDE1-204ENST00000569773 FBXO27Q8NI29 283 aa7.42□□□□□ -1.22
GDE1-204ENST00000569773 GATAD2BQ8WXI9 593 aa7.42□□□□□ -1.22
GDE1-204ENST00000569773 MEGF10Q96KG7 1140 aa7.42□□□□□ -1.22
GDE1-204ENST00000569773 UBP1Q9NZI7 540 aa7.42□□□□□ -1.22
GDE1-204ENST00000569773 CSADQ9Y600 493 aa7.42□□□□□ -1.22
GDE1-204ENST00000569773 FAM221AA4D161 298 aa7.41□□□□□ -1.22
GDE1-204ENST00000569773 TLR3O15455 904 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
GDE1-204ENST00000569773 KCNQ3O43525 872 aa7.41□□□□□ -1.22
GDE1-204ENST00000569773 TIAF1O95411 115 aa7.41□□□□□ -1.22
GDE1-204ENST00000569773 SERPINB2P05120 415 aa7.41□□□□□ -1.22
GDE1-204ENST00000569773 PREPP48147 710 aa7.41□□□□□ -1.22
GDE1-204ENST00000569773 ID3Q02535 119 aa7.41□□□□□ -1.22
GDE1-204ENST00000569773 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
GDE1-204ENST00000569773 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
GDE1-204ENST00000569773 LRFN4Q6PJG9 635 aa7.41□□□□□ -1.22
GDE1-204ENST00000569773 PLPPR2Q96GM1 343 aa7.41□□□□□ -1.22
GDE1-204ENST00000569773 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
GDE1-204ENST00000569773 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
GDE1-204ENST00000569773 CEP41Q9BYV8 373 aa7.41□□□□□ -1.22
GDE1-204ENST00000569773 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa7.41□□□□□ -1.22
GDE1-204ENST00000569773 SART1O43290 800 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
GDE1-204ENST00000569773 CILPO75339 1184 aa7.4□□□□□ -1.22
GDE1-204ENST00000569773 BPNT1O95861 308 aa7.4□□□□□ -1.22
GDE1-204ENST00000569773 CANXP27824 592 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
GDE1-204ENST00000569773 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
GDE1-204ENST00000569773 CRKP46108 304 aa7.4□□□□□ -1.22
GDE1-204ENST00000569773 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
GDE1-204ENST00000569773 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa7.4□□□□□ -1.22
GDE1-204ENST00000569773 TBC1D9BQ66K14 1250 aa7.4□□□□□ -1.22
GDE1-204ENST00000569773 DYMQ7RTS9 669 aa7.4□□□□□ -1.22
GDE1-204ENST00000569773 C12orf40Q86WS4 652 aa7.4□□□□□ -1.22
GDE1-204ENST00000569773 ELMO3Q96BJ8 720 aa7.4□□□□□ -1.22
GDE1-204ENST00000569773 CAPN10Q9HC96 672 aa7.4□□□□□ -1.22
GDE1-204ENST00000569773 CRIM1Q9NZV1 1036 aa7.4□□□□□ -1.22
GDE1-204ENST00000569773 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa7.4□□□□□ -1.22
GDE1-204ENST00000569773 SCN4AP35499 1836 aa7.39□□□□□ -1.23
GDE1-204ENST00000569773 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
GDE1-204ENST00000569773 CAMTA2O94983 1202 aa7.39□□□□□ -1.23
GDE1-204ENST00000569773 STARD3NLO95772 234 aa7.39□□□□□ -1.23
GDE1-204ENST00000569773 A1BGP04217 495 aa7.39□□□□□ -1.23
GDE1-204ENST00000569773 PPP2R1AP30153 589 aa7.39□□□□□ -1.23
GDE1-204ENST00000569773 PRKAR2BP31323 418 aa7.39□□□□□ -1.23
GDE1-204ENST00000569773 APOBRQ0VD83 1088 aa7.39□□□□□ -1.23
GDE1-204ENST00000569773 MPP2Q14168 576 aa7.39□□□□□ -1.23
GDE1-204ENST00000569773 PPM1JQ5JR12 505 aa7.39□□□□□ -1.23
GDE1-204ENST00000569773 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
GDE1-204ENST00000569773 PRR5LQ6MZQ0 368 aa7.39□□□□□ -1.23
GDE1-204ENST00000569773 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
GDE1-204ENST00000569773 FANCD2OSQ96PS1 177 aa7.39□□□□□ -1.23
GDE1-204ENST00000569773 NT5C1AQ9BXI3 368 aa7.39□□□□□ -1.23
GDE1-204ENST00000569773 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
GDE1-204ENST00000569773 RNF181Q9P0P0 153 aa7.39□□□□□ -1.23
GDE1-204ENST00000569773 HIF3AQ9Y2N7 669 aa7.39□□□□□ -1.23
GDE1-204ENST00000569773 ACTL7BQ9Y614 415 aa7.39□□□□□ -1.23
GDE1-204ENST00000569773 A0A087WZG4 1122 aa7.38□□□□□ -1.23
GDE1-204ENST00000569773 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa7.38□□□□□ -1.23
GDE1-204ENST00000569773 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa7.38□□□□□ -1.23
GDE1-204ENST00000569773 GAS2O43903 313 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
GDE1-204ENST00000569773 ADAM23O75077 832 aa7.38□□□□□ -1.23
GDE1-204ENST00000569773 ITGB2P05107 769 aa7.38□□□□□ -1.23
GDE1-204ENST00000569773 ERVK-24P63145 666 aa7.38□□□□□ -1.23
GDE1-204ENST00000569773 TEFQ10587 303 aa7.38□□□□□ -1.23
GDE1-204ENST00000569773 SEZ6Q53EL9 994 aa7.38□□□□□ -1.23
GDE1-204ENST00000569773 HDXQ7Z353 690 aa7.38□□□□□ -1.23
GDE1-204ENST00000569773 REC114Q7Z4M0 266 aa7.38□□□□□ -1.23
GDE1-204ENST00000569773 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
GDE1-204ENST00000569773 TTC5Q8N0Z6 440 aa7.38□□□□□ -1.23
GDE1-204ENST00000569773 TTLL6Q8N841 843 aa7.38□□□□□ -1.23
GDE1-204ENST00000569773 GPRASP2Q96D09 838 aa7.38□□□□□ -1.23
GDE1-204ENST00000569773 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
GDE1-204ENST00000569773 FMNL2Q96PY5 1086 aa7.38□□□□□ -1.23
GDE1-204ENST00000569773 TINF2Q9BSI4 451 aa7.38□□□□□ -1.23
GDE1-204ENST00000569773 DISC1Q9NRI5 854 aa7.38□□□□□ -1.23
GDE1-204ENST00000569773 USP16Q9Y5T5 823 aa7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms