RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564123.6

BBS2-208, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 2, human

TSL 3

Gene BBS2, Length 395 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS2-208	ENST00000564123	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	SPATA9	Q9BWV2	254 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	DUSP15	Q9H1R2	295 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123		A0A1W2PQU0	124 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	NUAK1	O60285	661 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	VAMP4	O75379	141 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	CD3E	P07766	207 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	HOXA5	P20719	270 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	TPP2	P29144	1249 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	LTK	P29376	864 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	CTSK	P43235	329 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	GALK1	P51570	392 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	CTSW	P56202	376 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	PPP2R2A	P63151	447 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	TSPYL5	Q86VY4	417 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	BTN2A2	Q8WVV5	523 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	TCTN2	Q96GX1	697 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	RNF32	Q9H0A6	362 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	SP110	Q9HB58	689 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	PRR13	Q9NZ81	148 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	DUSP13	Q9UII6	198 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	TMEM59L	Q9UK28	342 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	TBX22	Q9Y458	520 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123		A0A087WZG4	1122 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	SRF	P11831	508 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	RAC2	P15153	192 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	LINC00310	P59036	64 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	C2orf27A	Q580R0	203 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	POMZP3	Q6PJE2	187 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	THAP5	Q7Z6K1	395 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	ARHGEF39	Q8N4T4	335 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	AARSD1	Q9BTE6	412 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	SGPP1	Q9BX95	441 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	FOXP3	Q9BZS1	431 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	GPR55	Q9Y2T6	319 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	EMC9	Q9Y3B6	208 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	TLDC2	A0PJX2	215 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	STXBP3	O00186	592 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	FKTN	O75072	461 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	HPX	P02790	462 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	GSN	P06396	782 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	SYP	P08247	313 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	FAM153B	P0C7A2	387 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	MED14OS	P0DP75	135 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	IFNGR1	P15260	489 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	BMP7	P18075	431 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	GLDC	P23378	1020 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	AMPD2	Q01433	879 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	YOD1	Q5VVQ6	348 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	GTF2IRD2B	Q6EKJ0	949 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	SDE2	Q6IQ49	451 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	GTF2IRD2	Q86UP8	949 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	ZNF655	Q8N720	491 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	THAP3	Q8WTV1	239 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	SGSM3	Q96HU1	749 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	MRGPRX3	Q96LB0	322 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS2-208	ENST00000564123	MYOCOS	A0A1B0GUC4	107 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS2-208	ENST00000564123	ESYT3	A0FGR9	886 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS2-208	ENST00000564123	ADCY3	O60266	1144 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS2-208	ENST00000564123	BMP8B	P34820	402 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS2-208	ENST00000564123	GRIA2	P42262	883 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS2-208	ENST00000564123	KCNJ6	P48051	423 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS2-208	ENST00000564123	PCBP3	P57721	371 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
BBS2-208	ENST00000564123	POU4F1	Q01851	419 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS2-208	ENST00000564123	EGR3	Q06889	387 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS2-208	ENST00000564123	SCRN1	Q12765	414 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS2-208	ENST00000564123	GRB10	Q13322	594 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS2-208	ENST00000564123	SQSTM1	Q13501	440 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS2-208	ENST00000564123	ZNF605	Q86T29	641 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS2-208	ENST00000564123	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
BBS2-208	ENST00000564123	CCDC120	Q96HB5	630 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS2-208	ENST00000564123	CDC6	Q99741	560 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS2-208	ENST00000564123	IER2	Q9BTL4	223 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS2-208	ENST00000564123	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS2-208	ENST00000564123	EBF1	Q9UH73	591 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS2-208	ENST00000564123	TCFL5	Q9UL49	500 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS2-208	ENST00000564123	PRODH	O43272	600 aa		4.82	□□□□□ -1.64

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