RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560962.5

USP3-AS1-208, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene USP3-AS1, Length 1,807 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-208ENST00000560962 SOCS7O14512 581 aa20.29■□□□□ 0.84
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USP3-AS1-208ENST00000560962 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa20.29■□□□□ 0.84
USP3-AS1-208ENST00000560962 VWA3AA6NCI4 1184 aa20.28■□□□□ 0.84
USP3-AS1-208ENST00000560962 USP14P54578 494 aa20.28■□□□□ 0.84
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USP3-AS1-208ENST00000560962 C4orf32Q8N8J7 132 aa20.28■□□□□ 0.84
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USP3-AS1-208ENST00000560962 EPSTI1Q96J88 318 aa20.27■□□□□ 0.84
USP3-AS1-208ENST00000560962 PSTPIP2Q9H939 334 aa20.27■□□□□ 0.84
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USP3-AS1-208ENST00000560962 USH1GQ495M9 461 aa20.26■□□□□ 0.83
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USP3-AS1-208ENST00000560962 PDILTQ8N807 584 aa20.26■□□□□ 0.83
USP3-AS1-208ENST00000560962 KIFC2Q96AC6 838 aa20.26■□□□□ 0.83
USP3-AS1-208ENST00000560962 TMEM60Q9H2L4 133 aa20.26■□□□□ 0.83
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZHX2Q9Y6X8 837 aa20.26■□□□□ 0.83
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USP3-AS1-208ENST00000560962 PRKG1Q13976 671 aa20.25■□□□□ 0.83
USP3-AS1-208ENST00000560962 KRBA2Q6ZNG9 492 aa20.25■□□□□ 0.83
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USP3-AS1-208ENST00000560962 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
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USP3-AS1-208ENST00000560962 C19orf81C9J6K1 198 aa20.25■□□□□ 0.83
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USP3-AS1-208ENST00000560962 USP17L11C9JVI0 530 aa20.24■□□□□ 0.83
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USP3-AS1-208ENST00000560962 USP17L22D6RA61 530 aa20.24■□□□□ 0.83
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USP3-AS1-208ENST00000560962 USP17L20D6RJB6 530 aa20.24■□□□□ 0.83
USP3-AS1-208ENST00000560962 NF2P35240 595 aa20.24■□□□□ 0.83
USP3-AS1-208ENST00000560962 USP17L24Q0WX57 530 aa20.24■□□□□ 0.83
USP3-AS1-208ENST00000560962 VGLL4Q14135 290 aa20.24■□□□□ 0.83
USP3-AS1-208ENST00000560962 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
USP3-AS1-208ENST00000560962 USP17L6PQ6QN14 398 aa20.24■□□□□ 0.83
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USP3-AS1-208ENST00000560962 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
USP3-AS1-208ENST00000560962 DNAJC25Q9H1X3 360 aa20.24■□□□□ 0.83
USP3-AS1-208ENST00000560962 SERTAD1Q9UHV2 236 aa20.24■□□□□ 0.83
USP3-AS1-208ENST00000560962 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa20.24■□□□□ 0.83
USP3-AS1-208ENST00000560962 DGKZQ13574 1117 aa20.23■□□□□ 0.83
USP3-AS1-208ENST00000560962 SLF1Q9BQI6 1058 aa20.23■□□□□ 0.83
USP3-AS1-208ENST00000560962 A0A087X0B3 334 aa20.23■□□□□ 0.83
USP3-AS1-208ENST00000560962 IREB2P48200 963 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
USP3-AS1-208ENST00000560962 STX1AQ16623 288 aa20.23■□□□□ 0.83
USP3-AS1-208ENST00000560962 CCDC174Q6PII3 467 aa20.23■□□□□ 0.83
USP3-AS1-208ENST00000560962 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
USP3-AS1-208ENST00000560962 PNOCQ13519 176 aa20.22■□□□□ 0.83
USP3-AS1-208ENST00000560962 UVSSAQ2YD98 709 aa20.22■□□□□ 0.83
USP3-AS1-208ENST00000560962 MCTP2Q6DN12 878 aa20.22■□□□□ 0.83
USP3-AS1-208ENST00000560962 DTHD1Q6ZMT9 781 aa20.22■□□□□ 0.83
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAM200AQ8TCP9 573 aa20.22■□□□□ 0.83
USP3-AS1-208ENST00000560962 DHX58Q96C10 678 aa20.22■□□□□ 0.83
USP3-AS1-208ENST00000560962 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
USP3-AS1-208ENST00000560962 CSADQ9Y600 493 aa20.22■□□□□ 0.83
USP3-AS1-208ENST00000560962 BIN1O00499 593 aa20.21■□□□□ 0.83
USP3-AS1-208ENST00000560962 MEIS2O14770 477 aa20.21■□□□□ 0.83
USP3-AS1-208ENST00000560962 FOXN1O15353 648 aa20.21■□□□□ 0.83
USP3-AS1-208ENST00000560962 EDIL3O43854 480 aa20.21■□□□□ 0.83
USP3-AS1-208ENST00000560962 TANGO6Q9C0B7 1094 aa20.21■□□□□ 0.83
USP3-AS1-208ENST00000560962 CBX8Q9HC52 389 aa20.21■□□□□ 0.83
USP3-AS1-208ENST00000560962 SMCHD1A6NHR9 2005 aa20.21■□□□□ 0.83
USP3-AS1-208ENST00000560962 LAD1O00515 517 aa20.2■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 OPLAHO14841 1288 aa20.2■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 NEMFO60524 1076 aa20.2■□□□□ 0.82
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