RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550734.5

CS-221, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-221ENST00000550734 HIP1O00291 1037 aa13.63□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 CTAGE5O15320 804 aa13.63□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 CD4P01730 458 aa13.63□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 PCP11498 1178 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 CCDC144BQ3MJ40 725 aa13.63□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 ZNF365Q70YC5 407 aa13.63□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 HERVK_113Q902F9 699 aa13.63□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 RILPL2Q969X0 211 aa13.63□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 GMCL1Q96IK5 515 aa13.63□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 KATNBL1Q9H079 304 aa13.63□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 PRDM12Q9H4Q4 367 aa13.63□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 SPC25Q9HBM1 224 aa13.63□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa13.63□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 CCDC171Q6TFL3 1326 aa13.63□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 GBF1Q92538 1859 aa13.62□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 RAD21O60216 631 aa13.62□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 PLA2G6O60733 806 aa13.62□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 FDX1P10109 184 aa13.62□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 NT5C2P49902 561 aa13.62□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 CTDSPL2Q05D32 466 aa13.62□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 ADGRE1Q14246 886 aa13.62□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 GNASQ5JWF2 1037 aa13.62□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 SLC43A3Q8NBI5 491 aa13.62□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 CHST13Q8NET6 341 aa13.62□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 IL23AQ9NPF7 189 aa13.62□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 IL17RBQ9NRM6 502 aa13.62□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 THEGQ9P2T0 379 aa13.62□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 FBXO40Q9UH90 709 aa13.62□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 FEM1BQ9UK73 627 aa13.62□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 TLR3O15455 904 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 ZBED4O75132 1171 aa13.61□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 ACRP10323 421 aa13.61□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 OAZ1P54368 228 aa13.61□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 RAB30Q15771 203 aa13.61□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 ARMCX2Q7L311 632 aa13.61□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 ANKRD35Q8N283 1001 aa13.61□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa13.61□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 TSPY2A6NKD2 308 aa13.6□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 BMP3P12645 472 aa13.6□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 SLFN13Q68D06 897 aa13.6□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa13.6□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 CPXCR1Q8N123 301 aa13.6□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa13.6□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 PPM1EQ8WY54 764 aa13.6□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 VTI1AQ96AJ9 217 aa13.6□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa13.6□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa13.6□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 INCENPQ9NQS7 918 aa13.6□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 MSRAQ9UJ68 235 aa13.6□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 PDE4AP27815 886 aa13.59□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 CYP2C18P33260 490 aa13.59□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 FAM133AQ8N9E0 248 aa13.59□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 CHURC1Q8WUH1 139 aa13.59□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 STAG1Q8WVM7 1258 aa13.59□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 KIFC2Q96AC6 838 aa13.59□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 TTC14Q96N46 770 aa13.59□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa13.59□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 ASTN1O14525 1302 aa13.59□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 NMT2O60551 498 aa13.58□□□□□ -0.24
CS-221ENST00000550734 CABYRO75952 493 aa13.58□□□□□ -0.24
CS-221ENST00000550734 FGBP02675 491 aa13.58□□□□□ -0.24
CS-221ENST00000550734 RCSD1Q6JBY9 416 aa13.58□□□□□ -0.24
CS-221ENST00000550734 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
CS-221ENST00000550734 FAM160B2Q86V87 743 aa13.58□□□□□ -0.24
CS-221ENST00000550734 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
CS-221ENST00000550734 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
CS-221ENST00000550734 DSCC1Q9BVC3 393 aa13.58□□□□□ -0.24
CS-221ENST00000550734 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
CS-221ENST00000550734 SLC28A3Q9HAS3 691 aa13.58□□□□□ -0.24
CS-221ENST00000550734 STX8Q9UNK0 236 aa13.58□□□□□ -0.24
CS-221ENST00000550734 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
CS-221ENST00000550734 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
CS-221ENST00000550734 GRIN2DO15399 1336 aa13.58□□□□□ -0.24
CS-221ENST00000550734 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
CS-221ENST00000550734 SLC1A4P43007 532 aa13.57□□□□□ -0.24
CS-221ENST00000550734 SLC4A3P48751 1232 aa13.57□□□□□ -0.24
CS-221ENST00000550734 STAT2P52630 851 aa13.57□□□□□ -0.24
CS-221ENST00000550734 BEX3Q00994 111 aa13.57□□□□□ -0.24
CS-221ENST00000550734 CNTN2Q02246 1040 aa13.57□□□□□ -0.24
CS-221ENST00000550734 TNFAIP2Q03169 654 aa13.57□□□□□ -0.24
CS-221ENST00000550734 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
CS-221ENST00000550734 TTC22Q5TAA0 569 aa13.57□□□□□ -0.24
CS-221ENST00000550734 CXCL17Q6UXB2 119 aa13.57□□□□□ -0.24
CS-221ENST00000550734 MFSD6Q6ZSS7 791 aa13.57□□□□□ -0.24
CS-221ENST00000550734 VWCEQ96DN2 955 aa13.57□□□□□ -0.24
CS-221ENST00000550734 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa13.57□□□□□ -0.24
CS-221ENST00000550734 HIPK3Q9H422 1215 aa13.57□□□□□ -0.24
CS-221ENST00000550734 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
CS-221ENST00000550734 UMODL1Q5DID0 1318 aa13.57□□□□□ -0.24
CS-221ENST00000550734 LRRC37A2A6NM11 1700 aa13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms