RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa11.41□□□□□ -0.58
CS-217ENST00000550044 TACC3Q9Y6A5 838 aa11.41□□□□□ -0.58
CS-217ENST00000550044 BDP1A6H8Y1 2624 aa11.4□□□□□ -0.58
CS-217ENST00000550044 GRXCR2A6NFK2 248 aa11.4□□□□□ -0.58
CS-217ENST00000550044 RAD21O60216 631 aa11.4□□□□□ -0.58
CS-217ENST00000550044 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
CS-217ENST00000550044 RGS2P41220 211 aa11.4□□□□□ -0.58
CS-217ENST00000550044 USP14P54578 494 aa11.4□□□□□ -0.58
CS-217ENST00000550044 TFAP4Q01664 338 aa11.4□□□□□ -0.58
CS-217ENST00000550044 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
CS-217ENST00000550044 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa11.4□□□□□ -0.58
CS-217ENST00000550044 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
CS-217ENST00000550044 SPICE1Q8N0Z3 855 aa11.4□□□□□ -0.58
CS-217ENST00000550044 APBA2Q99767 749 aa11.4□□□□□ -0.58
CS-217ENST00000550044 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa11.4□□□□□ -0.58
CS-217ENST00000550044 TXNRD2Q9NNW7 524 aa11.4□□□□□ -0.58
CS-217ENST00000550044 TOMM22Q9NS69 142 aa11.4□□□□□ -0.58
CS-217ENST00000550044 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
CS-217ENST00000550044 ROBO3Q96MS0 1386 aa11.4□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 RLFQ13129 1914 aa11.39□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 USP17L15C9J2P7 530 aa11.39□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 USP17L13C9JLJ4 530 aa11.39□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 USP17L11C9JVI0 530 aa11.39□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 USP17L18D6R9N7 530 aa11.39□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 USP17L22D6RA61 530 aa11.39□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 USP17L17D6RBQ6 530 aa11.39□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 USP17L19D6RCP7 530 aa11.39□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 USP17L20D6RJB6 530 aa11.39□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 TSPY3P0CV98 308 aa11.39□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 TSPY8P0CW00 308 aa11.39□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 VCAM1P19320 739 aa11.39□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 USP17L24Q0WX57 530 aa11.39□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 GPIHBP1Q8IV16 184 aa11.39□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa11.39□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 RUFY2Q8WXA3 655 aa11.39□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 BADQ92934 168 aa11.39□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 C12orf42Q96LP6 360 aa11.39□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 PPP4R2Q9NY27 417 aa11.39□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 CLIP2Q9UDT6 1046 aa11.39□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 ANAPC4Q9UJX5 808 aa11.39□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 TMX2Q9Y320 296 aa11.39□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 NCOR1O75376 2440 aa11.39□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 TSPY2A6NKD2 308 aa11.38□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 ZNF213O14771 459 aa11.38□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 CNGA1P29973 690 aa11.38□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 MAPK4P31152 587 aa11.38□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 HERVK_113P62684 666 aa11.38□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 GRIN2CQ14957 1233 aa11.38□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa11.38□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 GPR142Q7Z601 462 aa11.38□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 NEDD1Q8NHV4 660 aa11.38□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 PPM1EQ8WY54 764 aa11.38□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 USP6NLQ92738 828 aa11.38□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 CHMP4CQ96CF2 233 aa11.38□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 CEP95Q96GE4 821 aa11.38□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 PAGR1Q9BTK6 254 aa11.38□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 DSCC1Q9BVC3 393 aa11.38□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 PORCNQ9H237 461 aa11.38□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 VCPKMTQ9H867 229 aa11.38□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 AAASQ9NRG9 546 aa11.38□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP11.38□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 DNM1LO00429 736 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 ST8SIA5O15466 376 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 NMT2O60551 498 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 WFS1O76024 890 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 PTH1RQ03431 593 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 Q3C1V9 767 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 MORN1Q5T089 497 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 AKNAD1Q5T1N1 836 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 MFSD6Q6ZSS7 791 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 PLEKHH3Q7Z736 793 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 TANGO6Q9C0B7 1094 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 SH2D4AQ9H788 454 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 IL17RBQ9NRM6 502 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 MTMR4Q9NYA4 1195 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 NYAP2Q9P242 653 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 RBPJLQ9UBG7 517 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 F5H6K3 240 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 SGSM2O43147 1006 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 GDF9O60383 454 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 FGRP09769 529 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 ERVK-9P63128 1117 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 ERVK-24P63145 666 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 KLRC3Q07444 240 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 COG2Q14746 738 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 TRIM60Q495X7 471 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 BMP2KLQ5H9B9 411 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 MFSD14CQ5VZR4 134 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 ERICH6BQ5W0A0 696 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-217ENST00000550044 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms