RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549007.1

APAF1-208, Transcript of apoptotic peptidase activating factor 1, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene APAF1, Length 3,492 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
APAF1-208	ENST00000549007	ADAMTS2	O95450	1211 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	NEFM	P07197	916 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	ARL4D	P49703	201 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	ZBTB37	Q5TC79	503 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	BTN2A2	Q8WVV5	523 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	ITSN1	Q15811	1721 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	KCNQ2	O43526	872 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	GUCY2F	P51841	1108 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	DHRS4	Q9BTZ2	278 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	KIF1A	Q12756	1690 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	LCE2B	O14633	110 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	TMPRSS2	O15393	492 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	GBP1	P32455	592 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	ID4	P47928	161 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	PPP2R5D	Q14738	602 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	CEP89	Q96ST8	783 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	CAAP1	Q9H8G2	361 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	DISC1	Q9NRI5	854 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	TBX4	P57082	545 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	RING1	Q06587	406 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	TMEM201	Q5SNT2	666 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	MSL1	Q68DK7	614 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	BRAP	Q7Z569	592 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	MCAT	Q8IVS2	390 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	RIN3	Q8TB24	985 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	SUCO	Q9UBS9	1254 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	DNAJC8	O75937	253 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	ALAS2	P22557	587 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	MTMR1	Q13613	665 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	GMCL1	Q96IK5	515 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	TRIM8	Q9BZR9	551 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	KRT82	Q9NSB4	513 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	ZNF451	Q9Y4E5	1061 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	TNPO3	Q9Y5L0	923 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	AGRP	O00253	132 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	MEIS1	O00470	390 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	FYB1	O15117	783 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	SHOX	O15266	292 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	CLEC3A	O75596	197 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	RASGRP1	O95267	797 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	EPX	P11678	715 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	NEK4	P51957	841 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	CHRNA2	Q15822	529 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	AARSD1	Q9BTE6	412 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	KLHL25	Q9H0H3	589 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	SOX17	Q9H6I2	414 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	SENP2	Q9HC62	589 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	SSH2	Q76I76	1423 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	AKAP12	Q02952	1782 aa		4.85	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	SHTN1	A0MZ66	631 aa		4.85	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	FAM229A	H3BQW9	127 aa		4.85	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	RNGTT	O60942	597 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	TMPRSS15	P98073	1019 aa		4.85	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	SLFN12	Q8IYM2	578 aa		4.85	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		4.85	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	TAB3	Q8N5C8	712 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	GALNT6	Q8NCL4	622 aa		4.85	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		4.85	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		4.85	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	PIK3C2A	O00443	1686 aa		4.85	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		4.85	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	SHISA8	B8ZZ34	492 aa		4.85	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	KCNH1	O95259	989 aa		4.85	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	JMJD7	P0C870	316 aa		4.85	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	CD68	P34810	354 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63

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