RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531857.1

PKP3-208, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

TSL 4

Gene PKP3, Length 687 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-208ENST00000531857 TJAP1Q5JTD0 557 aa20.58■□□□□ 0.89
PKP3-208ENST00000531857 TMEM63BQ5T3F8 832 aa20.58■□□□□ 0.89
PKP3-208ENST00000531857 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
PKP3-208ENST00000531857 RASGRP2Q7LDG7 609 aa20.58■□□□□ 0.89
PKP3-208ENST00000531857 SLC43A3Q8NBI5 491 aa20.58■□□□□ 0.89
PKP3-208ENST00000531857 STAG1Q8WVM7 1258 aa20.58■□□□□ 0.89
PKP3-208ENST00000531857 PPM1EQ8WY54 764 aa20.58■□□□□ 0.89
PKP3-208ENST00000531857 GMCL1Q96IK5 515 aa20.58■□□□□ 0.89
PKP3-208ENST00000531857 IL23AQ9NPF7 189 aa20.58■□□□□ 0.89
PKP3-208ENST00000531857 GRIN2DO15399 1336 aa20.57■□□□□ 0.88
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PKP3-208ENST00000531857 SLC1A4P43007 532 aa20.57■□□□□ 0.88
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PKP3-208ENST00000531857 KCTD1Q719H9 257 aa20.57■□□□□ 0.88
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PKP3-208ENST00000531857 FAM160B2Q86V87 743 aa20.57■□□□□ 0.88
PKP3-208ENST00000531857 CHURC1Q8WUH1 139 aa20.57■□□□□ 0.88
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PKP3-208ENST00000531857 NACAP1Q9BZK3 213 aa20.57■□□□□ 0.88
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PKP3-208ENST00000531857 PDGFCQ9NRA1 345 aa20.57■□□□□ 0.88
PKP3-208ENST00000531857 ASB14A6NK59 587 aa20.56■□□□□ 0.88
PKP3-208ENST00000531857 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
PKP3-208ENST00000531857 ITGA7Q13683 1181 aa20.56■□□□□ 0.88
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PKP3-208ENST00000531857 HERVK_113Q902F9 699 aa20.56■□□□□ 0.88
PKP3-208ENST00000531857 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
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PKP3-208ENST00000531857 HIPK3Q9H422 1215 aa20.56■□□□□ 0.88
PKP3-208ENST00000531857 SCN5AQ14524 2016 aa20.56■□□□□ 0.88
PKP3-208ENST00000531857 MUC3AQ02505 3323 aa20.55■□□□□ 0.88
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PKP3-208ENST00000531857 ADGRE1Q14246 886 aa20.55■□□□□ 0.88
PKP3-208ENST00000531857 TKFCQ3LXA3 575 aa20.55■□□□□ 0.88
PKP3-208ENST00000531857 TAPT1Q6NXT6 567 aa20.55■□□□□ 0.88
PKP3-208ENST00000531857 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
PKP3-208ENST00000531857 PI4K2BQ8TCG2 481 aa20.55■□□□□ 0.88
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PKP3-208ENST00000531857 CHD7Q9P2D1 2997 aa20.55■□□□□ 0.88
PKP3-208ENST00000531857 PRR12Q9ULL5 1215 aa20.55■□□□□ 0.88
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PKP3-208ENST00000531857 CABYRO75952 493 aa20.54■□□□□ 0.88
PKP3-208ENST00000531857 FGBP02675 491 aa20.54■□□□□ 0.88
PKP3-208ENST00000531857 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
PKP3-208ENST00000531857 CCL23P55773 120 aa20.54■□□□□ 0.88
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PKP3-208ENST00000531857 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa20.54■□□□□ 0.88
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PKP3-208ENST00000531857 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa20.54■□□□□ 0.88
PKP3-208ENST00000531857 STX8Q9UNK0 236 aa20.54■□□□□ 0.88
PKP3-208ENST00000531857 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP20.54■□□□□ 0.882e-6■■■■□ 20.8
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PKP3-208ENST00000531857 B4GALT4O60513 344 aa20.53■□□□□ 0.88
PKP3-208ENST00000531857 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
PKP3-208ENST00000531857 AKNAD1Q5T1N1 836 aa20.53■□□□□ 0.88
PKP3-208ENST00000531857 IQSEC1Q6DN90 963 aa20.53■□□□□ 0.88
PKP3-208ENST00000531857 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
PKP3-208ENST00000531857 WNT8AQ9H1J5 351 aa20.53■□□□□ 0.88
PKP3-208ENST00000531857 MSRAQ9UJ68 235 aa20.53■□□□□ 0.88
PKP3-208ENST00000531857 MTMR7Q9Y216 660 aa20.53■□□□□ 0.88
PKP3-208ENST00000531857 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
PKP3-208ENST00000531857 TSPY2A6NKD2 308 aa20.52■□□□□ 0.88
PKP3-208ENST00000531857 TNFRSF10AO00220 468 aa20.52■□□□□ 0.88
PKP3-208ENST00000531857 RAB30Q15771 203 aa20.52■□□□□ 0.88
PKP3-208ENST00000531857 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
PKP3-208ENST00000531857 VWCEQ96DN2 955 aa20.52■□□□□ 0.88
PKP3-208ENST00000531857 RABGGTBP53611 331 aa20.51■□□□□ 0.87
PKP3-208ENST00000531857 NSMFQ6X4W1 530 aa20.51■□□□□ 0.87
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PKP3-208ENST00000531857 Q9Y3F1 56 aa20.51■□□□□ 0.87
PKP3-208ENST00000531857 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
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PKP3-208ENST00000531857 ZEB2O60315 1214 aa20.5■□□□□ 0.87
PKP3-208ENST00000531857 IGFBP4P22692 258 aa20.5■□□□□ 0.87
PKP3-208ENST00000531857 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa20.5■□□□□ 0.87
PKP3-208ENST00000531857 MORC4Q8TE76 937 aa20.5■□□□□ 0.87
PKP3-208ENST00000531857 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PKP3-208ENST00000531857 SCLYQ96I15 445 aa20.5■□□□□ 0.87
PKP3-208ENST00000531857 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PKP3-208ENST00000531857 SLC28A3Q9HAS3 691 aa20.5■□□□□ 0.87
PKP3-208ENST00000531857 MYOGP15173 224 aa20.49■□□□□ 0.87
PKP3-208ENST00000531857 SLC16A2P36021 539 aa20.49■□□□□ 0.87
PKP3-208ENST00000531857 TTBK2Q6IQ55 1244 aa20.49■□□□□ 0.87
PKP3-208ENST00000531857 ASB2Q96Q27 587 aa20.49■□□□□ 0.87
PKP3-208ENST00000531857 VTA1Q9NP79 307 aa20.49■□□□□ 0.87
PKP3-208ENST00000531857 THEGQ9P2T0 379 aa20.49■□□□□ 0.87
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