RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531129.5

GPATCH4-215, Transcript of G-patch domain containing 4, human

TSL 5

Gene GPATCH4, Length 532 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPATCH4-215	ENST00000531129	ZNF576	Q9H609	170 aa		13.8	□□□□□ -0.2
GPATCH4-215	ENST00000531129	STX8	Q9UNK0	236 aa		13.8	□□□□□ -0.2
GPATCH4-215	ENST00000531129	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	13.8	□□□□□ -0.2
GPATCH4-215	ENST00000531129	VCAN	P13611	3396 aa		13.8	□□□□□ -0.2
GPATCH4-215	ENST00000531129	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		13.79	□□□□□ -0.2
GPATCH4-215	ENST00000531129	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		13.79	□□□□□ -0.2
GPATCH4-215	ENST00000531129	ERC2	O15083	957 aa		13.79	□□□□□ -0.2
GPATCH4-215	ENST00000531129	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
GPATCH4-215	ENST00000531129	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
GPATCH4-215	ENST00000531129	FDX1	P10109	184 aa		13.79	□□□□□ -0.2
GPATCH4-215	ENST00000531129	SMPD1	P17405	629 aa		13.79	□□□□□ -0.2
GPATCH4-215	ENST00000531129	NKX3-2	P78367	333 aa		13.79	□□□□□ -0.2
GPATCH4-215	ENST00000531129	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	13.79	□□□□□ -0.2
GPATCH4-215	ENST00000531129	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
GPATCH4-215	ENST00000531129	TIFA	Q96CG3	184 aa		13.79	□□□□□ -0.2
GPATCH4-215	ENST00000531129	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		13.79	□□□□□ -0.2
GPATCH4-215	ENST00000531129	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
GPATCH4-215	ENST00000531129	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		13.79	□□□□□ -0.2
GPATCH4-215	ENST00000531129	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		13.79	□□□□□ -0.2
GPATCH4-215	ENST00000531129	TSPY2	A6NKD2	308 aa		13.78	□□□□□ -0.2
GPATCH4-215	ENST00000531129	CD4	P01730	458 aa		13.78	□□□□□ -0.2
GPATCH4-215	ENST00000531129	MX1	P20591	662 aa		13.78	□□□□□ -0.2
GPATCH4-215	ENST00000531129	RASIP1	Q5U651	963 aa		13.78	□□□□□ -0.2
GPATCH4-215	ENST00000531129	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		13.78	□□□□□ -0.2
GPATCH4-215	ENST00000531129	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		13.78	□□□□□ -0.2
GPATCH4-215	ENST00000531129	TMEM199	Q8N511	208 aa		13.78	□□□□□ -0.2
GPATCH4-215	ENST00000531129	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		13.78	□□□□□ -0.2
GPATCH4-215	ENST00000531129	PBX4	Q9BYU1	374 aa		13.78	□□□□□ -0.2
GPATCH4-215	ENST00000531129	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		13.78	□□□□□ -0.2
GPATCH4-215	ENST00000531129	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		13.78	□□□□□ -0.2
GPATCH4-215	ENST00000531129	GRIN2D	O15399	1336 aa		13.78	□□□□□ -0.2
GPATCH4-215	ENST00000531129	ASB14	A6NK59	587 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GPATCH4-215	ENST00000531129	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
GPATCH4-215	ENST00000531129	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
GPATCH4-215	ENST00000531129	PLA2G6	O60733	806 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GPATCH4-215	ENST00000531129	SLC16A2	P36021	539 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GPATCH4-215	ENST00000531129	PSMC6	P62333	389 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GPATCH4-215	ENST00000531129	ITGA7	Q13683	1181 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GPATCH4-215	ENST00000531129	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
GPATCH4-215	ENST00000531129	TKFC	Q3LXA3	575 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GPATCH4-215	ENST00000531129	NSMF	Q6X4W1	530 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GPATCH4-215	ENST00000531129	TLK2	Q86UE8	772 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GPATCH4-215	ENST00000531129	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
GPATCH4-215	ENST00000531129	PPM1E	Q8WY54	764 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GPATCH4-215	ENST00000531129	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GPATCH4-215	ENST00000531129	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GPATCH4-215	ENST00000531129	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
GPATCH4-215	ENST00000531129	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
GPATCH4-215	ENST00000531129	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GPATCH4-215	ENST00000531129	CCL23	P55773	120 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GPATCH4-215	ENST00000531129	PRDM12	Q9H4Q4	367 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GPATCH4-215	ENST00000531129	IL23A	Q9NPF7	189 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GPATCH4-215	ENST00000531129	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GPATCH4-215	ENST00000531129	NOV	P48745	357 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GPATCH4-215	ENST00000531129	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
GPATCH4-215	ENST00000531129	CCDC96	Q2M329	555 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GPATCH4-215	ENST00000531129	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GPATCH4-215	ENST00000531129	IQSEC1	Q6DN90	963 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GPATCH4-215	ENST00000531129	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GPATCH4-215	ENST00000531129	HIPK3	Q9H422	1215 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GPATCH4-215	ENST00000531129	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GPATCH4-215	ENST00000531129	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GPATCH4-215	ENST00000531129	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
GPATCH4-215	ENST00000531129	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GPATCH4-215	ENST00000531129	NFIB	O00712	420 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GPATCH4-215	ENST00000531129	B4GALT4	O60513	344 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GPATCH4-215	ENST00000531129	FGB	P02675	491 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GPATCH4-215	ENST00000531129	ICAM1	P05362	532 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GPATCH4-215	ENST00000531129	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
GPATCH4-215	ENST00000531129	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
GPATCH4-215	ENST00000531129	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GPATCH4-215	ENST00000531129	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GPATCH4-215	ENST00000531129	HERVK_113	Q902F9	699 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GPATCH4-215	ENST00000531129	FAM227B	Q96M60	508 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GPATCH4-215	ENST00000531129	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
GPATCH4-215	ENST00000531129	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GPATCH4-215	ENST00000531129	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
GPATCH4-215	ENST00000531129	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GPATCH4-215	ENST00000531129	TOMM22	Q9NS69	142 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GPATCH4-215	ENST00000531129	LCT	P09848	1927 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GPATCH4-215	ENST00000531129	ORC4	O43929	436 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GPATCH4-215	ENST00000531129	CABYR	O75952	493 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GPATCH4-215	ENST00000531129	FGA	P02671	866 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GPATCH4-215	ENST00000531129	FGR	P09769	529 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GPATCH4-215	ENST00000531129	ADGRE1	Q14246	886 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GPATCH4-215	ENST00000531129	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
GPATCH4-215	ENST00000531129	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GPATCH4-215	ENST00000531129	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GPATCH4-215	ENST00000531129	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GPATCH4-215	ENST00000531129	MORC4	Q8TE76	937 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GPATCH4-215	ENST00000531129	DCAF4	Q8WV16	495 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GPATCH4-215	ENST00000531129	EVI5L	Q96CN4	794 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GPATCH4-215	ENST00000531129	VWCE	Q96DN2	955 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GPATCH4-215	ENST00000531129	SCLY	Q96I15	445 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GPATCH4-215	ENST00000531129	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GPATCH4-215	ENST00000531129	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
GPATCH4-215	ENST00000531129		A0A0D9SFI3	127 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GPATCH4-215	ENST00000531129	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GPATCH4-215	ENST00000531129	ZEB2	O60315	1214 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GPATCH4-215	ENST00000531129	MYOG	P15173	224 aa		13.72	□□□□□ -0.21

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