RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520132.1

RBM22-204, Transcript of RNA binding motif protein 22, human

TSL 2

Gene RBM22, Length 2,067 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM22-204	ENST00000520132	EHD4	Q9H223	541 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM22-204	ENST00000520132	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM22-204	ENST00000520132	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM22-204	ENST00000520132	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM22-204	ENST00000520132	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RBM22-204	ENST00000520132	KLRC4	O43908	158 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM22-204	ENST00000520132	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RBM22-204	ENST00000520132	SYT10	Q6XYQ8	523 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM22-204	ENST00000520132	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM22-204	ENST00000520132	USP17L10	C9JJH3	530 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM22-204	ENST00000520132	ARHGAP6	O43182	974 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM22-204	ENST00000520132	CCP110	O43303	1012 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM22-204	ENST00000520132	EDIL3	O43854	480 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM22-204	ENST00000520132	TDP2	O95551	362 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM22-204	ENST00000520132	PBX1	P40424	430 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM22-204	ENST00000520132	TXK	P42681	527 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM22-204	ENST00000520132	KRT31	Q15323	416 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM22-204	ENST00000520132	UBE2S	Q16763	222 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM22-204	ENST00000520132	AOC3	Q16853	763 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM22-204	ENST00000520132	FILIP1L	Q4L180	1135 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM22-204	ENST00000520132	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM22-204	ENST00000520132	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RBM22-204	ENST00000520132	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM22-204	ENST00000520132	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM22-204	ENST00000520132	MAP7D2	Q96T17	732 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM22-204	ENST00000520132	TRIM49B	A6NDI0	452 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM22-204	ENST00000520132	AKR1B15	C9JRZ8	316 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RBM22-204	ENST00000520132	SLC37A4	O43826	429 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM22-204	ENST00000520132	RAD21	O60216	631 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM22-204	ENST00000520132	TNNI2	P48788	182 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM22-204	ENST00000520132	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RBM22-204	ENST00000520132	RBL2	Q08999	1139 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM22-204	ENST00000520132	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RBM22-204	ENST00000520132	KCNB1	Q14721	858 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM22-204	ENST00000520132	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RBM22-204	ENST00000520132	CALCRL	Q16602	461 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM22-204	ENST00000520132	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM22-204	ENST00000520132	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM22-204	ENST00000520132	ADSSL1	Q8N142	457 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM22-204	ENST00000520132	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM22-204	ENST00000520132	CCDC17	Q96LX7	622 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM22-204	ENST00000520132	MTMR9	Q96QG7	549 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM22-204	ENST00000520132	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RBM22-204	ENST00000520132	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM22-204	ENST00000520132	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RBM22-204	ENST00000520132	KCNJ18	B7U540	433 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM22-204	ENST00000520132	STX10	O60499	249 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM22-204	ENST00000520132	MYL1	P05976	194 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM22-204	ENST00000520132	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RBM22-204	ENST00000520132	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RBM22-204	ENST00000520132	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RBM22-204	ENST00000520132	KCNJ12	Q14500	433 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM22-204	ENST00000520132	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RBM22-204	ENST00000520132	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM22-204	ENST00000520132	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM22-204	ENST00000520132	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM22-204	ENST00000520132	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM22-204	ENST00000520132	ANKRD7	Q92527	254 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM22-204	ENST00000520132	MRI	Q9BWK5	157 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM22-204	ENST00000520132	IDI2	Q9BXS1	227 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM22-204	ENST00000520132	VPS16	Q9H269	839 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM22-204	ENST00000520132	CUEDC2	Q9H467	287 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM22-204	ENST00000520132	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM22-204	ENST00000520132	PPP2R2C	Q9Y2T4	447 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM22-204	ENST00000520132	N4BP3	O15049	544 aa		11.15	□□□□□ -0.63
RBM22-204	ENST00000520132	RHOBTB3	O94955	611 aa		11.15	□□□□□ -0.63
RBM22-204	ENST00000520132	RXRB	P28702	533 aa		11.15	□□□□□ -0.63
RBM22-204	ENST00000520132	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.63
RBM22-204	ENST00000520132	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.63
RBM22-204	ENST00000520132	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.63
RBM22-204	ENST00000520132	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		11.15	□□□□□ -0.63
RBM22-204	ENST00000520132	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.63
RBM22-204	ENST00000520132	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.63
RBM22-204	ENST00000520132	CNKSR1	Q969H4	720 aa		11.15	□□□□□ -0.63
RBM22-204	ENST00000520132	ARID3A	Q99856	593 aa		11.15	□□□□□ -0.63
RBM22-204	ENST00000520132	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.63
RBM22-204	ENST00000520132	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		11.15	□□□□□ -0.63
RBM22-204	ENST00000520132	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		11.15	□□□□□ -0.63
RBM22-204	ENST00000520132	ZBTB5	O15062	677 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM22-204	ENST00000520132	ZSCAN12	O43309	604 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM22-204	ENST00000520132	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RBM22-204	ENST00000520132	ETF1	P62495	437 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RBM22-204	ENST00000520132	SPAG1	Q07617	926 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM22-204	ENST00000520132	GRB10	Q13322	594 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM22-204	ENST00000520132	MTF1	Q14872	753 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM22-204	ENST00000520132	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM22-204	ENST00000520132	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM22-204	ENST00000520132	CUL5	Q93034	780 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM22-204	ENST00000520132	MTMR8	Q96EF0	704 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM22-204	ENST00000520132	PANX2	Q96RD6	677 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM22-204	ENST00000520132	DESI2	Q9BSY9	194 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM22-204	ENST00000520132	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM22-204	ENST00000520132	TRIM9	Q9C026	710 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM22-204	ENST00000520132	DNAI1	Q9UI46	699 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM22-204	ENST00000520132	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RBM22-204	ENST00000520132	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM22-204	ENST00000520132	SOWAHD	A6NJG2	315 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM22-204	ENST00000520132		H7C1D1	291 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM22-204	ENST00000520132	GDF11	O95390	407 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM22-204	ENST00000520132	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	11.13	□□□□□ -0.63

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