RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515965.1

RNU6-377P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 377, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-377P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-377P-201ENST00000515965 C19orf73Q9NVV2 129 aa4.04□□□□□ -1.76
RNU6-377P-201ENST00000515965 ERVK13-1Q9NX77 482 aa4.04□□□□□ -1.76
RNU6-377P-201ENST00000515965 TMEM260Q9NX78 707 aa4.04□□□□□ -1.76
RNU6-377P-201ENST00000515965 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa4.04□□□□□ -1.76
RNU6-377P-201ENST00000515965 TMEM59LQ9UK28 342 aa4.04□□□□□ -1.76
RNU6-377P-201ENST00000515965 BACE2Q9Y5Z0 518 aa4.04□□□□□ -1.76
RNU6-377P-201ENST00000515965 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
RNU6-377P-201ENST00000515965 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-377P-201ENST00000515965 NOTOA8MTQ0 251 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-377P-201ENST00000515965 STXBP3O00186 592 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-377P-201ENST00000515965 THBDP07204 575 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-377P-201ENST00000515965 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
RNU6-377P-201ENST00000515965 GDNFP39905 211 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-377P-201ENST00000515965 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
RNU6-377P-201ENST00000515965 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
RNU6-377P-201ENST00000515965 SEPHS1P49903 392 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-377P-201ENST00000515965 GP2P55259 537 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
RNU6-377P-201ENST00000515965 PLCL1Q15111 1095 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-377P-201ENST00000515965 NR0B2Q15466 257 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-377P-201ENST00000515965 TMEM67Q5HYA8 995 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-377P-201ENST00000515965 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
RNU6-377P-201ENST00000515965 CBLL1Q75N03 491 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-377P-201ENST00000515965 TMEM145Q8NBT3 493 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-377P-201ENST00000515965 NLGN2Q8NFZ4 835 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-377P-201ENST00000515965 KCTD13Q8WZ19 329 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-377P-201ENST00000515965 MAP6Q96JE9 813 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-377P-201ENST00000515965 HHIPL1Q96JK4 782 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-377P-201ENST00000515965 EXOC2Q96KP1 924 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-377P-201ENST00000515965 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
RNU6-377P-201ENST00000515965 MMP19Q99542 508 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-377P-201ENST00000515965 CDADC1Q9BWV3 514 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-377P-201ENST00000515965 GPRC5CQ9NQ84 441 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-377P-201ENST00000515965 SLAMF8Q9P0V8 285 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-377P-201ENST00000515965 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-377P-201ENST00000515965 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-377P-201ENST00000515965 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-377P-201ENST00000515965 SCO2A0A1W2PP80 73 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-377P-201ENST00000515965 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
RNU6-377P-201ENST00000515965 A0A1W2PQY0 241 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-377P-201ENST00000515965 ENPP3O14638 875 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-377P-201ENST00000515965 KCNQ2O43526 872 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-377P-201ENST00000515965 TBC1D8O95759 1140 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-377P-201ENST00000515965 HPXP02790 462 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-377P-201ENST00000515965 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
RNU6-377P-201ENST00000515965 PLS3P13797 630 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-377P-201ENST00000515965 L1CAMP32004 1257 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-377P-201ENST00000515965 ECI1P42126 302 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-377P-201ENST00000515965 DUSP4Q13115 394 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-377P-201ENST00000515965 NTRK3Q16288 839 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZNF792Q3KQV3 632 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-377P-201ENST00000515965 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-377P-201ENST00000515965 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
RNU6-377P-201ENST00000515965 IQCEQ6IPM2 695 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-377P-201ENST00000515965 CYP2R1Q6VVX0 501 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-377P-201ENST00000515965 SPPL2CQ8IUH8 684 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-377P-201ENST00000515965 ABI1Q8IZP0 508 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-377P-201ENST00000515965 PDZD8Q8NEN9 1154 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-377P-201ENST00000515965 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
RNU6-377P-201ENST00000515965 ASIC4Q96FT7 647 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-377P-201ENST00000515965 CDC6Q99741 560 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-377P-201ENST00000515965 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
RNU6-377P-201ENST00000515965 CTNND2Q9UQB3 1225 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-377P-201ENST00000515965 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
RNU6-377P-201ENST00000515965 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
RNU6-377P-201ENST00000515965 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
RNU6-377P-201ENST00000515965 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-377P-201ENST00000515965 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-377P-201ENST00000515965 ESYT3A0FGR9 886 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-377P-201ENST00000515965 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
RNU6-377P-201ENST00000515965 PAMP19021 973 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-377P-201ENST00000515965 KCNJ6P48051 423 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-377P-201ENST00000515965 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
RNU6-377P-201ENST00000515965 CHRNEQ04844 493 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-377P-201ENST00000515965 PRSS53Q2L4Q9 553 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-377P-201ENST00000515965 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-377P-201ENST00000515965 SDE2Q6IQ49 451 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-377P-201ENST00000515965 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
RNU6-377P-201ENST00000515965 SLCO6A1Q86UG4 719 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-377P-201ENST00000515965 HOMER1Q86YM7 354 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-377P-201ENST00000515965 CCDC103Q8IW40 242 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-377P-201ENST00000515965 SYNPOQ8N3V7 929 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-377P-201ENST00000515965 OXR1Q8N573 874 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-377P-201ENST00000515965 ANKS4BQ8N8V4 417 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-377P-201ENST00000515965 DCAF4Q8WV16 495 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-377P-201ENST00000515965 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
RNU6-377P-201ENST00000515965 CLEC1BQ9P126 229 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-377P-201ENST00000515965 ADGRE2Q9UHX3 823 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-377P-201ENST00000515965 FITM1A5D6W6 292 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-377P-201ENST00000515965 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
RNU6-377P-201ENST00000515965 NRDCO43847 1150 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-377P-201ENST00000515965 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
RNU6-377P-201ENST00000515965 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
RNU6-377P-201ENST00000515965 RFPL3O75679 317 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-377P-201ENST00000515965 HSD3B2P26439 372 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-377P-201ENST00000515965 LTBRP36941 435 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-377P-201ENST00000515965 HK2P52789 917 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-377P-201ENST00000515965 RTP1P59025 263 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-377P-201ENST00000515965 SNX17Q15036 470 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-377P-201ENST00000515965 INF2Q27J81 1249 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-377P-201ENST00000515965 TRIM61Q5EBN2 209 aa4□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.9 ms