RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508100.1

ITGA3-211, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 4

Gene ITGA3, Length 549 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-211ENST00000508100 CCDC96Q2M329 555 aa19.35■□□□□ 0.69
ITGA3-211ENST00000508100 TMEM240Q5SV17 173 aa19.35■□□□□ 0.69
ITGA3-211ENST00000508100 CXCL17Q6UXB2 119 aa19.35■□□□□ 0.69
ITGA3-211ENST00000508100 TLK2Q86UE8 772 aa19.35■□□□□ 0.69
ITGA3-211ENST00000508100 TIFAQ96CG3 184 aa19.35■□□□□ 0.69
ITGA3-211ENST00000508100 ZNF576Q9H609 170 aa19.35■□□□□ 0.69
ITGA3-211ENST00000508100 INCENPQ9NQS7 918 aa19.35■□□□□ 0.69
ITGA3-211ENST00000508100 IL17RBQ9NRM6 502 aa19.35■□□□□ 0.69
ITGA3-211ENST00000508100 TOMM22Q9NS69 142 aa19.35■□□□□ 0.69
ITGA3-211ENST00000508100 CCPG1Q9ULG6 757 aa19.35■□□□□ 0.69
ITGA3-211ENST00000508100 UNC80Q8N2C7 3258 aa19.35■□□□□ 0.69
ITGA3-211ENST00000508100 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
ITGA3-211ENST00000508100 MUM1L1Q5H9M0 696 aa19.34■□□□□ 0.69
ITGA3-211ENST00000508100 IQSEC1Q6DN90 963 aa19.34■□□□□ 0.69
ITGA3-211ENST00000508100 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
ITGA3-211ENST00000508100 NSMFQ6X4W1 530 aa19.34■□□□□ 0.69
ITGA3-211ENST00000508100 C16orf59Q7L2K0 433 aa19.34■□□□□ 0.69
ITGA3-211ENST00000508100 EVI5LQ96CN4 794 aa19.34■□□□□ 0.69
ITGA3-211ENST00000508100 CYP39A1Q9NYL5 469 aa19.34■□□□□ 0.69
ITGA3-211ENST00000508100 ANAPC4Q9UJX5 808 aa19.34■□□□□ 0.69
ITGA3-211ENST00000508100 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP19.34■□□□□ 0.69
ITGA3-211ENST00000508100 ACRP10323 421 aa19.33■□□□□ 0.68
ITGA3-211ENST00000508100 SMPD1P17405 629 aa19.33■□□□□ 0.68
ITGA3-211ENST00000508100 ANKRD45Q5TZF3 282 aa19.33■□□□□ 0.68
ITGA3-211ENST00000508100 ZNF365Q70YC5 407 aa19.33■□□□□ 0.68
ITGA3-211ENST00000508100 EEPD1Q7L9B9 569 aa19.33■□□□□ 0.68
ITGA3-211ENST00000508100 DCAF4Q8WV16 495 aa19.33■□□□□ 0.68
ITGA3-211ENST00000508100 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa19.33■□□□□ 0.68
ITGA3-211ENST00000508100 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP19.33■□□□□ 0.68
ITGA3-211ENST00000508100 ASTN1O14525 1302 aa19.32■□□□□ 0.68
ITGA3-211ENST00000508100 FOXP2O15409 715 aa19.32■□□□□ 0.68
ITGA3-211ENST00000508100 ORC4O43929 436 aa19.32■□□□□ 0.68
ITGA3-211ENST00000508100 CD4P01730 458 aa19.32■□□□□ 0.68
ITGA3-211ENST00000508100 ICAM1P05362 532 aa19.32■□□□□ 0.68
ITGA3-211ENST00000508100 CYP2C18P33260 490 aa19.32■□□□□ 0.68
ITGA3-211ENST00000508100 ITGA7Q13683 1181 aa19.32■□□□□ 0.68
ITGA3-211ENST00000508100 HIPK3Q9H422 1215 aa19.32■□□□□ 0.68
ITGA3-211ENST00000508100 IL23AQ9NPF7 189 aa19.32■□□□□ 0.68
ITGA3-211ENST00000508100 PDGFCQ9NRA1 345 aa19.32■□□□□ 0.68
ITGA3-211ENST00000508100 Q9Y3F1 56 aa19.32■□□□□ 0.68
ITGA3-211ENST00000508100 ALX1Q15699 326 aa19.31■□□□□ 0.68
ITGA3-211ENST00000508100 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP19.31■□□□□ 0.68
ITGA3-211ENST00000508100 VPS53Q5VIR6 699 aa19.31■□□□□ 0.68
ITGA3-211ENST00000508100 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa19.31■□□□□ 0.68
ITGA3-211ENST00000508100 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP19.31■□□□□ 0.68
ITGA3-211ENST00000508100 SLC43A3Q8NBI5 491 aa19.31■□□□□ 0.68
ITGA3-211ENST00000508100 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP19.31■□□□□ 0.68
ITGA3-211ENST00000508100 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP19.31■□□□□ 0.68
ITGA3-211ENST00000508100 VTA1Q9NP79 307 aa19.31■□□□□ 0.68
ITGA3-211ENST00000508100 HELLSQ9NRZ9 838 aa19.31■□□□□ 0.68
ITGA3-211ENST00000508100 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP19.31■□□□□ 0.68
ITGA3-211ENST00000508100 MSRAQ9UJ68 235 aa19.31■□□□□ 0.68
ITGA3-211ENST00000508100 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP19.31■□□□□ 0.68
ITGA3-211ENST00000508100 GRXCR1A8MXD5 290 aa19.3■□□□□ 0.68
ITGA3-211ENST00000508100 FGBP02675 491 aa19.3■□□□□ 0.68
ITGA3-211ENST00000508100 TOP1P11387 765 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
ITGA3-211ENST00000508100 SLC16A2P36021 539 aa19.3■□□□□ 0.68
ITGA3-211ENST00000508100 RASIP1Q5U651 963 aa19.3■□□□□ 0.68
ITGA3-211ENST00000508100 TAPT1Q6NXT6 567 aa19.3■□□□□ 0.68
ITGA3-211ENST00000508100 RASGRP2Q7LDG7 609 aa19.3■□□□□ 0.68
ITGA3-211ENST00000508100 PBX4Q9BYU1 374 aa19.3■□□□□ 0.68
ITGA3-211ENST00000508100 MYO9BQ13459 2157 aa19.29■□□□□ 0.68
ITGA3-211ENST00000508100 PBX2P40425 430 aa19.29■□□□□ 0.68
ITGA3-211ENST00000508100 NOVP48745 357 aa19.29■□□□□ 0.68
ITGA3-211ENST00000508100 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP19.29■□□□□ 0.68
ITGA3-211ENST00000508100 RAB30Q15771 203 aa19.29■□□□□ 0.68
ITGA3-211ENST00000508100 SYDE2Q5VT97 1194 aa19.29■□□□□ 0.68
ITGA3-211ENST00000508100 TTBK2Q6IQ55 1244 aa19.29■□□□□ 0.68
ITGA3-211ENST00000508100 HERVK_113Q902F9 699 aa19.29■□□□□ 0.68
ITGA3-211ENST00000508100 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
ITGA3-211ENST00000508100 GPCPD1Q9NPB8 672 aa19.29■□□□□ 0.68
ITGA3-211ENST00000508100 SALL3Q9BXA9 1300 aa19.28■□□□□ 0.68
ITGA3-211ENST00000508100 PTPDC1A2A3K4 754 aa19.28■□□□□ 0.68
ITGA3-211ENST00000508100 FGAP02671 866 aa19.28■□□□□ 0.68
ITGA3-211ENST00000508100 FGRP09769 529 aa19.28■□□□□ 0.68
ITGA3-211ENST00000508100 PTGS1P23219 599 aa19.28■□□□□ 0.68
ITGA3-211ENST00000508100 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa19.28■□□□□ 0.68
ITGA3-211ENST00000508100 BTNL9Q6UXG8 535 aa19.28■□□□□ 0.68
ITGA3-211ENST00000508100 MORC4Q8TE76 937 aa19.28■□□□□ 0.68
ITGA3-211ENST00000508100 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP19.28■□□□□ 0.68
ITGA3-211ENST00000508100 TMEM47Q9BQJ4 181 aa19.28■□□□□ 0.68
ITGA3-211ENST00000508100 TRPV6Q9H1D0 765 aa19.28■□□□□ 0.68
ITGA3-211ENST00000508100 PNMA2Q9UL42 364 aa19.28■□□□□ 0.68
ITGA3-211ENST00000508100 GRIN2DO15399 1336 aa19.27■□□□□ 0.68
ITGA3-211ENST00000508100 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP19.27■□□□□ 0.68
ITGA3-211ENST00000508100 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa19.27■□□□□ 0.68
ITGA3-211ENST00000508100 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP19.27■□□□□ 0.68
ITGA3-211ENST00000508100 PDE1AP54750 535 aa19.27■□□□□ 0.68
ITGA3-211ENST00000508100 CCL23P55773 120 aa19.27■□□□□ 0.68
ITGA3-211ENST00000508100 PSMC6P62333 389 aa19.27■□□□□ 0.68
ITGA3-211ENST00000508100 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP19.27■□□□□ 0.68
ITGA3-211ENST00000508100 DUSP28Q4G0W2 176 aa19.27■□□□□ 0.68
ITGA3-211ENST00000508100 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP19.27■□□□□ 0.68
ITGA3-211ENST00000508100 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP19.27■□□□□ 0.68
ITGA3-211ENST00000508100 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP19.27■□□□□ 0.68
ITGA3-211ENST00000508100 WDR11Q9BZH6 1224 aa19.27■□□□□ 0.68
ITGA3-211ENST00000508100 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa19.27■□□□□ 0.68
ITGA3-211ENST00000508100 NFIBO00712 420 aa19.26■□□□□ 0.67
ITGA3-211ENST00000508100 B4GALT4O60513 344 aa19.26■□□□□ 0.67
ITGA3-211ENST00000508100 TMEM63BQ5T3F8 832 aa19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms