RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503638.1

PGGT1B-204, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 579 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-204ENST00000503638 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
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PGGT1B-204ENST00000503638 RAET1EQ8TD07 263 aa15.51■□□□□ 0.07
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PGGT1B-204ENST00000503638 SLC5A4Q9NY91 659 aa15.47■□□□□ 0.07
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PGGT1B-204ENST00000503638 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa15.46■□□□□ 0.07
PGGT1B-204ENST00000503638 NID2Q14112 1375 aa15.46■□□□□ 0.07
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PGGT1B-204ENST00000503638 CCDC83Q8IWF9 413 aa15.45■□□□□ 0.06
PGGT1B-204ENST00000503638 GTF3C6Q969F1 213 aa15.45■□□□□ 0.06
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PGGT1B-204ENST00000503638 APBA2Q99767 749 aa15.45■□□□□ 0.06
PGGT1B-204ENST00000503638 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
PGGT1B-204ENST00000503638 PLXNB2O15031 1838 aa15.45■□□□□ 0.06
PGGT1B-204ENST00000503638 POTEB2H3BUK9 544 aa15.44■□□□□ 0.06
PGGT1B-204ENST00000503638 HAX1O00165 279 aa15.44■□□□□ 0.06
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