RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498284.1

PTPRK-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-215ENST00000498284 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-215ENST00000498284 COPS5Q92905 334 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-215ENST00000498284 GPRC5CQ9NQ84 441 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-215ENST00000498284 TRAV20A0A0B4J274 112 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-215ENST00000498284 FITM1A5D6W6 292 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-215ENST00000498284 FADS2P1A8MWK0 482 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-215ENST00000498284 USP2O75604 605 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
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PTPRK-215ENST00000498284 LONRF2Q1L5Z9 754 aa6.66□□□□□ -1.34
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PTPRK-215ENST00000498284 C19orf44Q9H6X5 657 aa6.66□□□□□ -1.34
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PTPRK-215ENST00000498284 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa6.65□□□□□ -1.34
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PTPRK-215ENST00000498284 PAMP19021 973 aa6.65□□□□□ -1.34
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PTPRK-215ENST00000498284 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
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PTPRK-215ENST00000498284 CLEC1BQ9P126 229 aa6.65□□□□□ -1.34
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PTPRK-215ENST00000498284 FYB2Q5VWT5 728 aa6.64□□□□□ -1.35
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PTPRK-215ENST00000498284 SCUBE1Q8IWY4 988 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-215ENST00000498284 LILRA2Q8N149 483 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-215ENST00000498284 C1orf159Q96HA4 380 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-215ENST00000498284 JMJD8Q96S16 334 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-215ENST00000498284 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa6.64□□□□□ -1.35
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PTPRK-215ENST00000498284 TIGD5Q53EQ6 642 aa6.63□□□□□ -1.35
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PTPRK-215ENST00000498284 SLC26A8Q96RN1 970 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-215ENST00000498284 MMP19Q99542 508 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-215ENST00000498284 TAF6LQ9Y6J9 622 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-215ENST00000498284 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-215ENST00000498284 ARNTLO00327 626 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-215ENST00000498284 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-215ENST00000498284 PSPNO60542 156 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-215ENST00000498284 L1CAMP32004 1257 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-215ENST00000498284 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-215ENST00000498284 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-215ENST00000498284 IQCEQ6IPM2 695 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-215ENST00000498284 PPIL6Q8IXY8 311 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-215ENST00000498284 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-215ENST00000498284 EXOC2Q96KP1 924 aa6.62□□□□□ -1.35
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