RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494468.1

XPO1-223, Transcript of exportin 1, human

TSL 3

Gene XPO1, Length 562 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
XPO1-223	ENST00000494468	ECI1	P42126	302 aa		4.83	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	GRIA2	P42262	883 aa		4.83	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	SCRN1	Q12765	414 aa		4.83	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	LONRF2	Q1L5Z9	754 aa		4.83	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	C2orf27A	Q580R0	203 aa		4.83	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	ZC3H12B	Q5HYM0	836 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	CYP2R1	Q6VVX0	501 aa		4.83	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	LILRB2	Q8N423	598 aa		4.83	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	KCTD13	Q8WZ19	329 aa		4.83	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	PTCHD1	Q96NR3	888 aa		4.83	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		4.83	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	CDC6	Q99741	560 aa		4.83	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	IER2	Q9BTL4	223 aa		4.83	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	ERVK13-1	Q9NX77	482 aa		4.83	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	TRBV23OR9-2	A0A075B6M9	112 aa		4.82	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		4.82	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	BIN1	O00499	593 aa		4.82	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	TBC1D8	O95759	1140 aa		4.82	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	SCG5	P05408	212 aa		4.82	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	THBD	P07204	575 aa		4.82	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	FAM153B	P0C7A2	387 aa		4.82	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	PABPC1	P11940	636 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	RAC2	P15153	192 aa		4.82	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	PAM	P19021	973 aa		4.82	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	GDNF	P39905	211 aa		4.82	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	KIR2DL1	P43626	348 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	KIR2DL2	P43627	348 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	GFRA1	P56159	465 aa		4.82	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	CHRNE	Q04844	493 aa		4.82	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	SF1	Q15637	639 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	NSMF	Q6X4W1	530 aa		4.82	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	SPPL2C	Q8IUH8	684 aa		4.82	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	OXR1	Q8N573	874 aa		4.82	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		4.82	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	TMEM145	Q8NBT3	493 aa		4.82	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		4.82	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	PDZD8	Q8NEN9	1154 aa		4.82	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		4.82	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	LINC01599	Q8WXQ3	324 aa		4.82	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		4.82	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	G6PC3	Q9BUM1	346 aa		4.82	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	TNFRSF10D	Q9UBN6	386 aa		4.82	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	FITM1	A5D6W6	292 aa		4.81	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	CAPNS1	P04632	268 aa		4.81	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	PLS3	P13797	630 aa		4.81	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	MAP4K2	Q12851	820 aa		4.81	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	LAPTM5	Q13571	262 aa		4.81	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	SLC14A2	Q15849	920 aa		4.81	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	YOD1	Q5VVQ6	348 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	HLA-DQA1	Q5Y7H0	255 aa		4.81	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	CEP128	Q6ZU80	1094 aa		4.81	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	JAML	Q86YT9	394 aa		4.81	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	SCUBE1	Q8IWY4	988 aa		4.81	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	JMY	Q8N9B5	988 aa		4.81	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	COPS5	Q92905	334 aa		4.81	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	OSBP2	Q969R2	916 aa		4.81	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		4.81	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	CLEC1B	Q9P126	229 aa		4.81	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		4.81	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		4.8	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468		A0A1W2PQ45	241 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468		A0A1W2PQY0	241 aa		4.8	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	FADS2P1	A8MWK0	482 aa		4.8	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	DLX3	O60479	287 aa		4.8	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	RTP1	P59025	263 aa		4.8	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	PRSS53	Q2L4Q9	553 aa		4.8	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		4.8	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	FAM209A	Q5JX71	171 aa		4.8	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		4.8	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		4.8	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	JAZF1	Q86VZ6	243 aa		4.8	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		4.8	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		4.8	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		4.8	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	FRS2	Q8WU20	508 aa		4.8	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		4.8	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	EBF1	Q9UH73	591 aa		4.8	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	CTNND2	Q9UQB3	1225 aa		4.8	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		4.8	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		4.79	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	HPX	P02790	462 aa		4.79	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	LTBR	P36941	435 aa		4.79	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	AFM	P43652	599 aa		4.79	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	ERVFC1	P60507	584 aa		4.79	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	CYP4F3	Q08477	520 aa		4.79	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	KCNAB2	Q13303	367 aa		4.79	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	NR0B2	Q15466	257 aa		4.79	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	SLC35F1	Q5T1Q4	408 aa		4.79	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	IQCE	Q6IPM2	695 aa		4.79	□□□□□ -1.64

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