RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492730.1

C4BPB-208, Transcript of complement component 4 binding protein beta, human

TSL 4

Gene C4BPB, Length 564 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
C4BPB-208	ENST00000492730	VEZT	Q9HBM0	779 aa		6.69	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	6.69	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	6.69	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	MYH1	P12882	1939 aa		6.68	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	ADM5	C9JUS6	153 aa		6.68	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	PTMA	P06454	111 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	SMPD1	P17405	629 aa		6.68	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	GSTO1	P78417	241 aa		6.68	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	PDE4B	Q07343	736 aa		6.68	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	TCP10	Q12799	353 aa		6.68	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	TROAP	Q12815	778 aa		6.68	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	LRMP	Q12912	555 aa		6.68	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	NCAPH	Q15003	741 aa		6.68	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	STX1A	Q16623	288 aa		6.68	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		6.68	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	SPECC1	Q5M775	1068 aa		6.68	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	LCE3B	Q5TA77	95 aa		6.68	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	RESP18	Q5W5W9	173 aa		6.68	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	USP49	Q70CQ1	688 aa		6.68	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		6.68	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		6.68	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		6.68	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		6.68	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		6.68	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	GGA3	Q9NZ52	723 aa		6.68	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		6.68	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		6.68	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		6.68	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		6.68	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	SCN9A	Q15858	1988 aa		6.68	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	UTRN	P46939	3433 aa		6.67	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730		A0A087X0B3	334 aa		6.67	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		6.67	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	BIN1	O00499	593 aa		6.67	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	CTAGE5	O15320	804 aa		6.67	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	PPP6R2	O75170	966 aa		6.67	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	CDKL5	O76039	1030 aa		6.67	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	DEXI	O95424	95 aa		6.67	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	BMP6	P22004	513 aa		6.67	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	MSN	P26038	577 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	MLLT3	P42568	568 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	BTD	P43251	543 aa		6.67	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	RCAN1	P53805	252 aa		6.67	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	HTRA3	P83110	453 aa		6.67	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	PRKG1	Q13976	671 aa		6.67	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	RASA3	Q14644	834 aa		6.67	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	LONRF3	Q496Y0	759 aa		6.67	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	SWT1	Q5T5J6	900 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	C12orf60	Q5U649	245 aa		6.67	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	CST9	Q5W186	159 aa		6.67	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	ISM2	Q6H9L7	571 aa		6.67	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		6.67	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	SARM1	Q6SZW1	724 aa		6.67	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		6.67	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		6.67	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		6.67	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		6.67	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		6.67	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		6.67	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	KIAA1524	Q8TCG1	905 aa		6.67	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		6.67	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		6.67	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	ESR2	Q92731	530 aa		6.67	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	NAP1L5	Q96NT1	182 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	MED15	Q96RN5	788 aa		6.67	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		6.67	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	SPTLC3	Q9NUV7	552 aa		6.67	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		6.67	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		6.67	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	WDR90	Q96KV7	1748 aa		6.67	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	TTC24	A2A3L6	582 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	CUTA	O60888	179 aa		6.66	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	BAG3	O95817	575 aa		6.66	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	ADH1B	P00325	375 aa		6.66	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	TNNI2	P48788	182 aa		6.66	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	PLCD1	P51178	756 aa		6.66	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	RHBDL3	P58872	404 aa		6.66	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	NLRP12	P59046	1061 aa		6.66	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	PICALM	Q13492	652 aa		6.66	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	PNOC	Q13519	176 aa		6.66	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	IL17A	Q16552	155 aa		6.66	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		6.66	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		6.66	□□□□□ -1.34
C4BPB-208	ENST00000492730	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34

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