RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492539.5

NELFE-212, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 583 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-212ENST00000492539 ALAS1P13196 640 aa23.56■■□□□ 1.36
NELFE-212ENST00000492539 DNAJB2P25686 324 aa23.56■■□□□ 1.36
NELFE-212ENST00000492539 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP23.56■■□□□ 1.361e-7■■■■■ 27.7
NELFE-212ENST00000492539 C16orf59Q7L2K0 433 aa23.56■■□□□ 1.36
NELFE-212ENST00000492539 VTI1AQ96AJ9 217 aa23.56■■□□□ 1.36
NELFE-212ENST00000492539 CHMP4CQ96CF2 233 aa23.56■■□□□ 1.36
NELFE-212ENST00000492539 TLR3O15455 904 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
NELFE-212ENST00000492539 CD4P01730 458 aa23.55■■□□□ 1.36
NELFE-212ENST00000492539 FGRP09769 529 aa23.55■■□□□ 1.36
NELFE-212ENST00000492539 BEX3Q00994 111 aa23.55■■□□□ 1.36
NELFE-212ENST00000492539 MUM1L1Q5H9M0 696 aa23.55■■□□□ 1.36
NELFE-212ENST00000492539 TMEM240Q5SV17 173 aa23.55■■□□□ 1.36
NELFE-212ENST00000492539 RASIP1Q5U651 963 aa23.55■■□□□ 1.36
NELFE-212ENST00000492539 VPS53Q5VIR6 699 aa23.55■■□□□ 1.36
NELFE-212ENST00000492539 CCDC174Q6PII3 467 aa23.55■■□□□ 1.36
NELFE-212ENST00000492539 SLC43A3Q8NBI5 491 aa23.55■■□□□ 1.36
NELFE-212ENST00000492539 CYP39A1Q9NYL5 469 aa23.55■■□□□ 1.36
NELFE-212ENST00000492539 ORC4O43929 436 aa23.54■■□□□ 1.36
NELFE-212ENST00000492539 SNAP25P60880 206 aa23.54■■□□□ 1.36
NELFE-212ENST00000492539 TLK2Q86UE8 772 aa23.54■■□□□ 1.36
NELFE-212ENST00000492539 TMEM199Q8N511 208 aa23.54■■□□□ 1.36
NELFE-212ENST00000492539 CSF2RAP15509 400 aa23.53■■□□□ 1.36
NELFE-212ENST00000492539 GRIN2CQ14957 1233 aa23.53■■□□□ 1.36
NELFE-212ENST00000492539 ALX1Q15699 326 aa23.53■■□□□ 1.36
NELFE-212ENST00000492539 TAPT1Q6NXT6 567 aa23.53■■□□□ 1.36
NELFE-212ENST00000492539 DCAF4Q8WV16 495 aa23.53■■□□□ 1.36
NELFE-212ENST00000492539 EVI5LQ96CN4 794 aa23.53■■□□□ 1.36
NELFE-212ENST00000492539 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa23.53■■□□□ 1.36
NELFE-212ENST00000492539 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
NELFE-212ENST00000492539 CABYRO75952 493 aa23.52■■□□□ 1.36
NELFE-212ENST00000492539 SMPD1P17405 629 aa23.52■■□□□ 1.36
NELFE-212ENST00000492539 CXCL17Q6UXB2 119 aa23.52■■□□□ 1.36
NELFE-212ENST00000492539 MORC4Q8TE76 937 aa23.52■■□□□ 1.36
NELFE-212ENST00000492539 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
NELFE-212ENST00000492539 PDGFCQ9NRA1 345 aa23.52■■□□□ 1.36
NELFE-212ENST00000492539 HELLSQ9NRZ9 838 aa23.52■■□□□ 1.36
NELFE-212ENST00000492539 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
NELFE-212ENST00000492539 GBF1Q92538 1859 aa23.51■■□□□ 1.35
NELFE-212ENST00000492539 CHD9Q3L8U1 2897 aa23.51■■□□□ 1.35
NELFE-212ENST00000492539 ICAM1P05362 532 aa23.51■■□□□ 1.35
NELFE-212ENST00000492539 AAMPQ13685 434 aa23.51■■□□□ 1.35
NELFE-212ENST00000492539 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
NELFE-212ENST00000492539 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
NELFE-212ENST00000492539 BTNL9Q6UXG8 535 aa23.51■■□□□ 1.35
NELFE-212ENST00000492539 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
NELFE-212ENST00000492539 TIFAQ96CG3 184 aa23.51■■□□□ 1.35
NELFE-212ENST00000492539 ZNF576Q9H609 170 aa23.51■■□□□ 1.35
NELFE-212ENST00000492539 CCPG1Q9ULG6 757 aa23.51■■□□□ 1.35
NELFE-212ENST00000492539 Q9Y3F1 56 aa23.51■■□□□ 1.35
NELFE-212ENST00000492539 PTGS1P23219 599 aa23.5■■□□□ 1.35
NELFE-212ENST00000492539 ITGA7Q13683 1181 aa23.5■■□□□ 1.35
NELFE-212ENST00000492539 IQSEC1Q6DN90 963 aa23.5■■□□□ 1.35
NELFE-212ENST00000492539 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
NELFE-212ENST00000492539 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa23.5■■□□□ 1.35
NELFE-212ENST00000492539 PBX4Q9BYU1 374 aa23.5■■□□□ 1.35
NELFE-212ENST00000492539 AP5M1Q9H0R1 490 aa23.5■■□□□ 1.35
NELFE-212ENST00000492539 VTA1Q9NP79 307 aa23.5■■□□□ 1.35
NELFE-212ENST00000492539 GRIN2DO15399 1336 aa23.5■■□□□ 1.35
NELFE-212ENST00000492539 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
NELFE-212ENST00000492539 ACRP10323 421 aa23.49■■□□□ 1.35
NELFE-212ENST00000492539 CCDC96Q2M329 555 aa23.49■■□□□ 1.35
NELFE-212ENST00000492539 ANKRD45Q5TZF3 282 aa23.49■■□□□ 1.35
NELFE-212ENST00000492539 TTBK2Q6IQ55 1244 aa23.49■■□□□ 1.35
NELFE-212ENST00000492539 NSMFQ6X4W1 530 aa23.49■■□□□ 1.35
NELFE-212ENST00000492539 ZNF365Q70YC5 407 aa23.49■■□□□ 1.35
NELFE-212ENST00000492539 EEPD1Q7L9B9 569 aa23.49■■□□□ 1.35
NELFE-212ENST00000492539 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
NELFE-212ENST00000492539 IL23AQ9NPF7 189 aa23.49■■□□□ 1.35
NELFE-212ENST00000492539 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa23.49■■□□□ 1.35
NELFE-212ENST00000492539 MTMR7Q9Y216 660 aa23.49■■□□□ 1.35
NELFE-212ENST00000492539 ZEB2O60315 1214 aa23.48■■□□□ 1.35
NELFE-212ENST00000492539 FGAP02671 866 aa23.48■■□□□ 1.35
NELFE-212ENST00000492539 CYP2C18P33260 490 aa23.48■■□□□ 1.35
NELFE-212ENST00000492539 PDE1AP54750 535 aa23.48■■□□□ 1.35
NELFE-212ENST00000492539 TMEM63BQ5T3F8 832 aa23.48■■□□□ 1.35
NELFE-212ENST00000492539 TICAM2Q86XR7 235 aa23.48■■□□□ 1.35
NELFE-212ENST00000492539 ZMYM6O95789 1325 aa23.48■■□□□ 1.35
NELFE-212ENST00000492539 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa23.47■■□□□ 1.35
NELFE-212ENST00000492539 A0A0D9SFI3 127 aa23.47■■□□□ 1.35
NELFE-212ENST00000492539 GRXCR1A8MXD5 290 aa23.47■■□□□ 1.35
NELFE-212ENST00000492539 TOP1P11387 765 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
NELFE-212ENST00000492539 SLC16A2P36021 539 aa23.47■■□□□ 1.35
NELFE-212ENST00000492539 PBX2P40425 430 aa23.47■■□□□ 1.35
NELFE-212ENST00000492539 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
NELFE-212ENST00000492539 SYDE2Q5VT97 1194 aa23.47■■□□□ 1.35
NELFE-212ENST00000492539 HERVK_113Q902F9 699 aa23.47■■□□□ 1.35
NELFE-212ENST00000492539 FAM227BQ96M60 508 aa23.47■■□□□ 1.35
NELFE-212ENST00000492539 TMEM47Q9BQJ4 181 aa23.47■■□□□ 1.35
NELFE-212ENST00000492539 HIPK3Q9H422 1215 aa23.47■■□□□ 1.35
NELFE-212ENST00000492539 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
NELFE-212ENST00000492539 UMODL1Q5DID0 1318 aa23.47■■□□□ 1.35
NELFE-212ENST00000492539 MYO9BQ13459 2157 aa23.47■■□□□ 1.35
NELFE-212ENST00000492539 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
NELFE-212ENST00000492539 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
NELFE-212ENST00000492539 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa23.46■■□□□ 1.35
NELFE-212ENST00000492539 NFIBO00712 420 aa23.45■■□□□ 1.34
NELFE-212ENST00000492539 B4GALT4O60513 344 aa23.45■■□□□ 1.34
NELFE-212ENST00000492539 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
NELFE-212ENST00000492539 DUSP28Q4G0W2 176 aa23.45■■□□□ 1.34
NELFE-212ENST00000492539 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms