RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489601.1

SH3BP4-210, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 638 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-210ENST00000489601 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
SH3BP4-210ENST00000489601 SNAP25P60880 206 aa19.59■□□□□ 0.73
SH3BP4-210ENST00000489601 MUM1L1Q5H9M0 696 aa19.59■□□□□ 0.73
SH3BP4-210ENST00000489601 MFSD5Q6N075 450 aa19.59■□□□□ 0.73
SH3BP4-210ENST00000489601 BTNL9Q6UXG8 535 aa19.59■□□□□ 0.73
SH3BP4-210ENST00000489601 RASGRP2Q7LDG7 609 aa19.59■□□□□ 0.73
SH3BP4-210ENST00000489601 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
SH3BP4-210ENST00000489601 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
SH3BP4-210ENST00000489601 ASTN1O14525 1302 aa19.58■□□□□ 0.73
SH3BP4-210ENST00000489601 ZMYM6O95789 1325 aa19.58■□□□□ 0.73
SH3BP4-210ENST00000489601 A0A0D9SFI3 127 aa19.58■□□□□ 0.72
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SH3BP4-210ENST00000489601 IQSEC1Q6DN90 963 aa19.58■□□□□ 0.72
SH3BP4-210ENST00000489601 FAM126BQ8IXS8 530 aa19.58■□□□□ 0.72
SH3BP4-210ENST00000489601 FAM227BQ96M60 508 aa19.58■□□□□ 0.72
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SH3BP4-210ENST00000489601 CCPG1Q9ULG6 757 aa19.58■□□□□ 0.72
SH3BP4-210ENST00000489601 MTMR7Q9Y216 660 aa19.58■□□□□ 0.72
SH3BP4-210ENST00000489601 EYSQ5T1H1 3165 aa19.58■□□□□ 0.72
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SH3BP4-210ENST00000489601 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP19.57■□□□□ 0.72
SH3BP4-210ENST00000489601 CABYRO75952 493 aa19.57■□□□□ 0.72
SH3BP4-210ENST00000489601 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP19.57■□□□□ 0.72
SH3BP4-210ENST00000489601 TOP1P11387 765 aaKnown RBP19.57■□□□□ 0.72
SH3BP4-210ENST00000489601 BEX3Q00994 111 aa19.57■□□□□ 0.72
SH3BP4-210ENST00000489601 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP19.57■□□□□ 0.72
SH3BP4-210ENST00000489601 CCDC96Q2M329 555 aa19.57■□□□□ 0.72
SH3BP4-210ENST00000489601 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP19.57■□□□□ 0.72
SH3BP4-210ENST00000489601 MORC4Q8TE76 937 aa19.57■□□□□ 0.72
SH3BP4-210ENST00000489601 TOMM22Q9NS69 142 aa19.57■□□□□ 0.72
SH3BP4-210ENST00000489601 Q9Y3F1 56 aa19.57■□□□□ 0.72
SH3BP4-210ENST00000489601 TLR3O15455 904 aaKnown RBP19.56■□□□□ 0.72
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SH3BP4-210ENST00000489601 AAMPQ13685 434 aa19.56■□□□□ 0.72
SH3BP4-210ENST00000489601 TTBK2Q6IQ55 1244 aa19.56■□□□□ 0.72
SH3BP4-210ENST00000489601 TAPT1Q6NXT6 567 aa19.56■□□□□ 0.72
SH3BP4-210ENST00000489601 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP19.56■□□□□ 0.72
SH3BP4-210ENST00000489601 TLK2Q86UE8 772 aa19.56■□□□□ 0.72
SH3BP4-210ENST00000489601 SLC43A3Q8NBI5 491 aa19.56■□□□□ 0.72
SH3BP4-210ENST00000489601 TMEM47Q9BQJ4 181 aa19.56■□□□□ 0.72
SH3BP4-210ENST00000489601 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP19.56■□□□□ 0.72
SH3BP4-210ENST00000489601 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa19.55■□□□□ 0.72
SH3BP4-210ENST00000489601 PCP11498 1178 aaKnown RBP19.55■□□□□ 0.72
SH3BP4-210ENST00000489601 SMPD1P17405 629 aa19.55■□□□□ 0.72
SH3BP4-210ENST00000489601 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP19.55■□□□□ 0.72
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SH3BP4-210ENST00000489601 SYDE2Q5VT97 1194 aa19.55■□□□□ 0.72
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SH3BP4-210ENST00000489601 NSMFQ6X4W1 530 aa19.55■□□□□ 0.72
SH3BP4-210ENST00000489601 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP19.55■□□□□ 0.72
SH3BP4-210ENST00000489601 TMEM199Q8N511 208 aa19.55■□□□□ 0.72
SH3BP4-210ENST00000489601 TTC14Q96N46 770 aa19.55■□□□□ 0.72
SH3BP4-210ENST00000489601 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa19.55■□□□□ 0.72
SH3BP4-210ENST00000489601 AP5M1Q9H0R1 490 aa19.55■□□□□ 0.72
SH3BP4-210ENST00000489601 VTA1Q9NP79 307 aa19.55■□□□□ 0.72
SH3BP4-210ENST00000489601 PDGFCQ9NRA1 345 aa19.55■□□□□ 0.72
SH3BP4-210ENST00000489601 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP19.54■□□□□ 0.72
SH3BP4-210ENST00000489601 ZEB2O60315 1214 aa19.54■□□□□ 0.72
SH3BP4-210ENST00000489601 SLC16A2P36021 539 aa19.54■□□□□ 0.72
SH3BP4-210ENST00000489601 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
SH3BP4-210ENST00000489601 TMEM240Q5SV17 173 aa19.54■□□□□ 0.72
SH3BP4-210ENST00000489601 C16orf59Q7L2K0 433 aa19.54■□□□□ 0.72
SH3BP4-210ENST00000489601 MYLIPQ8WY64 445 aa19.54■□□□□ 0.72
SH3BP4-210ENST00000489601 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
SH3BP4-210ENST00000489601 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
SH3BP4-210ENST00000489601 MYO9BQ13459 2157 aa19.54■□□□□ 0.72
SH3BP4-210ENST00000489601 CCDC171Q6TFL3 1326 aa19.53■□□□□ 0.72
SH3BP4-210ENST00000489601 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa19.53■□□□□ 0.72
SH3BP4-210ENST00000489601 PDHBP11177 359 aa19.53■□□□□ 0.72
SH3BP4-210ENST00000489601 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
SH3BP4-210ENST00000489601 AKNAD1Q5T1N1 836 aa19.53■□□□□ 0.72
SH3BP4-210ENST00000489601 RASIP1Q5U651 963 aa19.53■□□□□ 0.72
SH3BP4-210ENST00000489601 EEPD1Q7L9B9 569 aa19.53■□□□□ 0.72
SH3BP4-210ENST00000489601 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
SH3BP4-210ENST00000489601 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
SH3BP4-210ENST00000489601 LNPKQ9C0E8 428 aa19.53■□□□□ 0.72
SH3BP4-210ENST00000489601 PNMA2Q9UL42 364 aa19.53■□□□□ 0.72
SH3BP4-210ENST00000489601 VCANP13611 3396 aa19.53■□□□□ 0.72
SH3BP4-210ENST00000489601 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP19.52■□□□□ 0.72
SH3BP4-210ENST00000489601 CSF2RAP15509 400 aa19.52■□□□□ 0.72
SH3BP4-210ENST00000489601 DNAJB2P25686 324 aa19.52■□□□□ 0.72
SH3BP4-210ENST00000489601 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP19.52■□□□□ 0.72
SH3BP4-210ENST00000489601 HAND2P61296 217 aa19.52■□□□□ 0.72
SH3BP4-210ENST00000489601 ITGA7Q13683 1181 aa19.52■□□□□ 0.72
SH3BP4-210ENST00000489601 MFSD6Q6ZSS7 791 aa19.52■□□□□ 0.72
SH3BP4-210ENST00000489601 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa19.52■□□□□ 0.72
SH3BP4-210ENST00000489601 SMC5Q8IY18 1101 aa19.52■□□□□ 0.72
SH3BP4-210ENST00000489601 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
SH3BP4-210ENST00000489601 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa19.52■□□□□ 0.72
SH3BP4-210ENST00000489601 GPCPD1Q9NPB8 672 aa19.52■□□□□ 0.72
SH3BP4-210ENST00000489601 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa19.52■□□□□ 0.71
SH3BP4-210ENST00000489601 GRIN2DO15399 1336 aa19.51■□□□□ 0.71
SH3BP4-210ENST00000489601 NFIBO00712 420 aa19.51■□□□□ 0.71
SH3BP4-210ENST00000489601 SNHG28P0DPA3 235 aa19.51■□□□□ 0.71
SH3BP4-210ENST00000489601 FOSL2P15408 326 aa19.51■□□□□ 0.71
SH3BP4-210ENST00000489601 PTGS1P23219 599 aa19.51■□□□□ 0.71
SH3BP4-210ENST00000489601 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
SH3BP4-210ENST00000489601 DUSP28Q4G0W2 176 aa19.51■□□□□ 0.71
SH3BP4-210ENST00000489601 TMEM63BQ5T3F8 832 aa19.51■□□□□ 0.71
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