RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489581.1

TOP3B-217, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 789 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-217ENST00000489581 NACAP1Q9BZK3 213 aa20.17■□□□□ 0.82
TOP3B-217ENST00000489581 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
TOP3B-217ENST00000489581 ZNF536O15090 1300 aa20.17■□□□□ 0.82
TOP3B-217ENST00000489581 ASB14A6NK59 587 aa20.16■□□□□ 0.82
TOP3B-217ENST00000489581 ALAS1P13196 640 aa20.16■□□□□ 0.82
TOP3B-217ENST00000489581 NKX3-2P78367 333 aa20.16■□□□□ 0.82
TOP3B-217ENST00000489581 TLK2Q86UE8 772 aa20.16■□□□□ 0.82
TOP3B-217ENST00000489581 NAPBQ9H115 298 aa20.16■□□□□ 0.82
TOP3B-217ENST00000489581 IL23AQ9NPF7 189 aa20.16■□□□□ 0.82
TOP3B-217ENST00000489581 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
TOP3B-217ENST00000489581 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
TOP3B-217ENST00000489581 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
TOP3B-217ENST00000489581 PPARAQ07869 468 aa20.15■□□□□ 0.82
TOP3B-217ENST00000489581 ITGA7Q13683 1181 aa20.15■□□□□ 0.82
TOP3B-217ENST00000489581 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
TOP3B-217ENST00000489581 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
TOP3B-217ENST00000489581 KCTD1Q719H9 257 aa20.15■□□□□ 0.82
TOP3B-217ENST00000489581 EEPD1Q7L9B9 569 aa20.15■□□□□ 0.82
TOP3B-217ENST00000489581 SLC43A3Q8NBI5 491 aa20.15■□□□□ 0.82
TOP3B-217ENST00000489581 HERVK_113Q902F9 699 aa20.15■□□□□ 0.82
TOP3B-217ENST00000489581 GMCL1Q96IK5 515 aa20.15■□□□□ 0.82
TOP3B-217ENST00000489581 AP5M1Q9H0R1 490 aa20.15■□□□□ 0.82
TOP3B-217ENST00000489581 HIPK3Q9H422 1215 aa20.15■□□□□ 0.82
TOP3B-217ENST00000489581 PDGFCQ9NRA1 345 aa20.15■□□□□ 0.82
TOP3B-217ENST00000489581 MSRAQ9UJ68 235 aa20.15■□□□□ 0.82
TOP3B-217ENST00000489581 UMODL1Q5DID0 1318 aa20.15■□□□□ 0.82
TOP3B-217ENST00000489581 LCTP09848 1927 aa20.15■□□□□ 0.82
TOP3B-217ENST00000489581 LRRC37A2A6NM11 1700 aa20.14■□□□□ 0.81
TOP3B-217ENST00000489581 CABYRO75952 493 aa20.14■□□□□ 0.81
TOP3B-217ENST00000489581 FGBP02675 491 aa20.14■□□□□ 0.81
TOP3B-217ENST00000489581 SMPD1P17405 629 aa20.14■□□□□ 0.81
TOP3B-217ENST00000489581 TKFCQ3LXA3 575 aa20.14■□□□□ 0.81
TOP3B-217ENST00000489581 MUM1L1Q5H9M0 696 aa20.14■□□□□ 0.81
TOP3B-217ENST00000489581 INCENPQ9NQS7 918 aa20.14■□□□□ 0.81
TOP3B-217ENST00000489581 MTMR7Q9Y216 660 aa20.14■□□□□ 0.81
TOP3B-217ENST00000489581 MUC3AQ02505 3323 aa20.14■□□□□ 0.81
TOP3B-217ENST00000489581 GRIN2DO15399 1336 aa20.13■□□□□ 0.81
TOP3B-217ENST00000489581 IGFBP4P22692 258 aa20.13■□□□□ 0.81
TOP3B-217ENST00000489581 CCL23P55773 120 aa20.13■□□□□ 0.81
TOP3B-217ENST00000489581 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
TOP3B-217ENST00000489581 TMEM63BQ5T3F8 832 aa20.13■□□□□ 0.81
TOP3B-217ENST00000489581 RASGRP2Q7LDG7 609 aa20.13■□□□□ 0.81
TOP3B-217ENST00000489581 OTOP2Q7RTS6 562 aa20.13■□□□□ 0.81
TOP3B-217ENST00000489581 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
TOP3B-217ENST00000489581 FSD1Q9BTV5 496 aa20.13■□□□□ 0.81
TOP3B-217ENST00000489581 TRPV6Q9H1D0 765 aa20.13■□□□□ 0.81
TOP3B-217ENST00000489581 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa20.13■□□□□ 0.81
TOP3B-217ENST00000489581 STX8Q9UNK0 236 aa20.13■□□□□ 0.81
TOP3B-217ENST00000489581 TSPY2A6NKD2 308 aa20.12■□□□□ 0.81
TOP3B-217ENST00000489581 ZEB2O60315 1214 aa20.12■□□□□ 0.81
TOP3B-217ENST00000489581 NMT2O60551 498 aa20.12■□□□□ 0.81
TOP3B-217ENST00000489581 PSMC6P62333 389 aa20.12■□□□□ 0.81
TOP3B-217ENST00000489581 CTDSPL2Q05D32 466 aa20.12■□□□□ 0.81
TOP3B-217ENST00000489581 ADGRE1Q14246 886 aa20.12■□□□□ 0.81
TOP3B-217ENST00000489581 RAB30Q15771 203 aa20.12■□□□□ 0.81
TOP3B-217ENST00000489581 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa20.12■□□□□ 0.81
TOP3B-217ENST00000489581 AKNAD1Q5T1N1 836 aa20.12■□□□□ 0.81
TOP3B-217ENST00000489581 IQSEC1Q6DN90 963 aa20.12■□□□□ 0.81
TOP3B-217ENST00000489581 RCSD1Q6JBY9 416 aa20.12■□□□□ 0.81
TOP3B-217ENST00000489581 TAPT1Q6NXT6 567 aa20.12■□□□□ 0.81
TOP3B-217ENST00000489581 NSMFQ6X4W1 530 aa20.12■□□□□ 0.81
TOP3B-217ENST00000489581 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
TOP3B-217ENST00000489581 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
TOP3B-217ENST00000489581 CYP39A1Q9NYL5 469 aa20.12■□□□□ 0.81
TOP3B-217ENST00000489581 PRR12Q9ULL5 1215 aa20.12■□□□□ 0.81
TOP3B-217ENST00000489581 TNFRSF10AO00220 468 aa20.11■□□□□ 0.81
TOP3B-217ENST00000489581 B4GALT4O60513 344 aa20.11■□□□□ 0.81
TOP3B-217ENST00000489581 PLA2G6O60733 806 aa20.11■□□□□ 0.81
TOP3B-217ENST00000489581 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
TOP3B-217ENST00000489581 PI4K2BQ8TCG2 481 aa20.11■□□□□ 0.81
TOP3B-217ENST00000489581 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
TOP3B-217ENST00000489581 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
TOP3B-217ENST00000489581 IL17RBQ9NRM6 502 aa20.11■□□□□ 0.81
TOP3B-217ENST00000489581 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP20.11■□□□□ 0.81
TOP3B-217ENST00000489581 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
TOP3B-217ENST00000489581 CHD9Q3L8U1 2897 aa20.1■□□□□ 0.81
TOP3B-217ENST00000489581 TTC41PQ6P2S7 1318 aa20.1■□□□□ 0.81
TOP3B-217ENST00000489581 ERC2O15083 957 aa20.1■□□□□ 0.81
TOP3B-217ENST00000489581 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa20.1■□□□□ 0.81
TOP3B-217ENST00000489581 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa20.1■□□□□ 0.81
TOP3B-217ENST00000489581 SLC28A3Q9HAS3 691 aa20.1■□□□□ 0.81
TOP3B-217ENST00000489581 CCPG1Q9ULG6 757 aa20.1■□□□□ 0.81
TOP3B-217ENST00000489581 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
TOP3B-217ENST00000489581 SCN5AQ14524 2016 aa20.09■□□□□ 0.81
TOP3B-217ENST00000489581 RABGGTBP53611 331 aa20.09■□□□□ 0.81
TOP3B-217ENST00000489581 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
TOP3B-217ENST00000489581 SCLYQ96I15 445 aa20.09■□□□□ 0.81
TOP3B-217ENST00000489581 WNT8AQ9H1J5 351 aa20.09■□□□□ 0.81
TOP3B-217ENST00000489581 THEGQ9P2T0 379 aa20.09■□□□□ 0.81
TOP3B-217ENST00000489581 Q9Y3F1 56 aa20.09■□□□□ 0.81
TOP3B-217ENST00000489581 FOXP2O15409 715 aa20.08■□□□□ 0.81
TOP3B-217ENST00000489581 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
TOP3B-217ENST00000489581 CCDC96Q2M329 555 aa20.08■□□□□ 0.81
TOP3B-217ENST00000489581 ASB2Q96Q27 587 aa20.08■□□□□ 0.81
TOP3B-217ENST00000489581 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa20.08■□□□□ 0.81
TOP3B-217ENST00000489581 VTA1Q9NP79 307 aa20.08■□□□□ 0.81
TOP3B-217ENST00000489581 ICAM1P05362 532 aa20.07■□□□□ 0.8
TOP3B-217ENST00000489581 SLC16A2P36021 539 aa20.07■□□□□ 0.8
TOP3B-217ENST00000489581 TTBK2Q6IQ55 1244 aa20.07■□□□□ 0.8
TOP3B-217ENST00000489581 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
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