RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475330.1

CBX1P5-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 5, humanhuman

BASIC

Gene CBX1P5, Length 559 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P5-201ENST00000475330 NSD2O96028 1365 aa7.59□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa7.58□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 QRICH2Q9H0J4 1663 aa7.58□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 SLC22A31A6NKX4 558 aa7.58□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 DNAJA2O60884 412 aa7.58□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 IL2RBP14784 551 aa7.58□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 CHRNA4P43681 627 aa7.58□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 NKG7Q16617 165 aa7.58□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 SGO2Q562F6 1265 aa7.58□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 NBPF6Q5VWK0 638 aa7.58□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 RUFY4Q6ZNE9 571 aa7.58□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 NLRC3Q7RTR2 1065 aa7.58□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 UBE3DQ7Z6J8 389 aa7.58□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP7.58□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 NBPF4Q96M43 638 aa7.58□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 TRIM55Q9BYV6 548 aa7.58□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa7.57□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 TOMM70O94826 608 aa7.57□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 BMP3P12645 472 aa7.57□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 RAG1P15918 1043 aa7.57□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 GUCY2CP25092 1073 aa7.57□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 PPP2R5EQ16537 467 aa7.57□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 ARSHQ5FYA8 562 aa7.57□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 SLC6A19Q695T7 634 aa7.57□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 CDPF1Q6NVV7 123 aa7.57□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 CD163Q86VB7 1156 aa7.57□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 KCNH5Q8NCM2 988 aa7.57□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 FBLIM1Q8WUP2 373 aa7.57□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 ATG4CQ96DT6 458 aa7.57□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 MYRFLQ96LU7 910 aa7.57□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 SEMA6CQ9H3T2 930 aa7.57□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 ACTR10Q9NZ32 417 aa7.57□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa7.57□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 DOT1LQ8TEK3 1739 aa7.57□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 LTN1O94822 1766 aa7.56□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa7.56□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 UPK3BL1B0FP48 263 aa7.56□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 UPK3BL2E5RIL1 263 aa7.56□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 NME1P15531 152 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP7.56□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa7.56□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 CDCP2Q5VXM1 449 aa7.56□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 ARMCX6Q7L4S7 300 aa7.56□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 DPH6Q7L8W6 267 aa7.56□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 AMIGO3Q86WK7 504 aa7.56□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 SLFN12Q8IYM2 578 aa7.56□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 LNPKQ9C0E8 428 aa7.56□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 CNNM2Q9H8M5 875 aa7.56□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 NMRK2Q9NPI5 230 aa7.56□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 TAF1LQ8IZX4 1826 aa7.56□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 USP54Q70EL1 1684 aa7.56□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 IGSF1Q8N6C5 1336 aa7.55□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa7.55□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 KLF4O43474 513 aa7.55□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 CST3P01034 146 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 NFICP08651 508 aa7.55□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 CAP2P40123 477 aa7.55□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 MAP7Q14244 749 aa7.55□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 SMIM5Q71RC9 77 aa7.55□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 FAM20CQ8IXL6 584 aa7.55□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 PHACTR4Q8IZ21 702 aa7.55□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 ARMC10Q8N2F6 343 aa7.55□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 FOXQ1Q9C009 403 aa7.55□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 KCNF1Q9H3M0 494 aa7.55□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa7.55□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa7.55□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 C5P01031 1676 aa7.54□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 TNFRSF10CO14798 259 aa7.54□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 DHX15O43143 795 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 LRIG2O94898 1065 aa7.54□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 CASP7P55210 303 aa7.54□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 RAB33AQ14088 237 aa7.54□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 TTC6Q86TZ1 520 aa7.54□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 OSBPL2Q9H1P3 480 aa7.54□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 LGR6Q9HBX8 967 aa7.54□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa7.54□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 RGPD2P0DJD1 1756 aa7.54□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa7.53□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 FAM86C2PA6NEL3 165 aa7.53□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 ACRP10323 421 aa7.53□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 CCDC144BQ3MJ40 725 aa7.53□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 PAOXQ6QHF9 649 aa7.53□□□□□ -1.2
CBX1P5-201ENST00000475330 XAGE3Q8WTP9 111 aa7.53□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms