RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472108.1

USP20-204, Transcript of ubiquitin specific peptidase 20, humanhuman

TSL 2

Gene USP20, Length 1,811 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20-204ENST00000472108 TERF1P54274 439 aa18.63■□□□□ 0.57
USP20-204ENST00000472108 USP14P54578 494 aa18.63■□□□□ 0.57
USP20-204ENST00000472108 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP18.63■□□□□ 0.57
USP20-204ENST00000472108 SPECC1Q5M775 1068 aa18.63■□□□□ 0.57
USP20-204ENST00000472108 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
USP20-204ENST00000472108 AS3MTQ9HBK9 375 aa18.63■□□□□ 0.57
USP20-204ENST00000472108 SSC5DA1L4H1 1573 aa18.62■□□□□ 0.57
USP20-204ENST00000472108 LAD1O00515 517 aa18.62■□□□□ 0.57
USP20-204ENST00000472108 EPHX2P34913 555 aa18.62■□□□□ 0.57
USP20-204ENST00000472108 ZSCAN30Q86W11 494 aa18.62■□□□□ 0.57
USP20-204ENST00000472108 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
USP20-204ENST00000472108 KIFC2Q96AC6 838 aa18.62■□□□□ 0.57
USP20-204ENST00000472108 FZD1Q9UP38 647 aa18.62■□□□□ 0.57
USP20-204ENST00000472108 DOCK1Q14185 1865 aa18.61■□□□□ 0.57
USP20-204ENST00000472108 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
USP20-204ENST00000472108 USP2O75604 605 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
USP20-204ENST00000472108 SPP2Q13103 211 aa18.61■□□□□ 0.57
USP20-204ENST00000472108 UBE2SQ16763 222 aa18.61■□□□□ 0.57
USP20-204ENST00000472108 LETM2Q2VYF4 491 aa18.61■□□□□ 0.57
USP20-204ENST00000472108 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
USP20-204ENST00000472108 VWA3AA6NCI4 1184 aa18.6■□□□□ 0.57
USP20-204ENST00000472108 BACE1P56817 501 aa18.6■□□□□ 0.57
USP20-204ENST00000472108 MTMR2Q13614 643 aa18.6■□□□□ 0.57
USP20-204ENST00000472108 IL17AQ16552 155 aa18.6■□□□□ 0.57
USP20-204ENST00000472108 USH1GQ495M9 461 aa18.6■□□□□ 0.57
USP20-204ENST00000472108 MCTP2Q6DN12 878 aa18.6■□□□□ 0.57
USP20-204ENST00000472108 SASS6Q6UVJ0 657 aa18.6■□□□□ 0.57
USP20-204ENST00000472108 ZNF280CQ8ND82 737 aa18.6■□□□□ 0.57
USP20-204ENST00000472108 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP18.6■□□□□ 0.573e-7■□□□□ 10.9
USP20-204ENST00000472108 PDLIM2Q96JY6 352 aa18.6■□□□□ 0.57
USP20-204ENST00000472108 EMILIN3Q9NT22 766 aa18.6■□□□□ 0.57
USP20-204ENST00000472108 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa18.6■□□□□ 0.57
USP20-204ENST00000472108 PRPHP41219 470 aa18.6■□□□□ 0.57
USP20-204ENST00000472108 TYRO3Q06418 890 aa18.6■□□□□ 0.57
USP20-204ENST00000472108 KRT26Q7Z3Y9 468 aa18.6■□□□□ 0.57
USP20-204ENST00000472108 TEX2Q8IWB9 1127 aa18.6■□□□□ 0.57
USP20-204ENST00000472108 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
USP20-204ENST00000472108 FBXO28Q9NVF7 368 aa18.6■□□□□ 0.57
USP20-204ENST00000472108 USP17L15C9J2P7 530 aa18.59■□□□□ 0.57
USP20-204ENST00000472108 USP17L13C9JLJ4 530 aa18.59■□□□□ 0.57
USP20-204ENST00000472108 ADM5C9JUS6 153 aa18.59■□□□□ 0.57
USP20-204ENST00000472108 USP17L11C9JVI0 530 aa18.59■□□□□ 0.57
USP20-204ENST00000472108 USP17L18D6R9N7 530 aa18.59■□□□□ 0.57
USP20-204ENST00000472108 USP17L22D6RA61 530 aa18.59■□□□□ 0.57
USP20-204ENST00000472108 USP17L17D6RBQ6 530 aa18.59■□□□□ 0.57
USP20-204ENST00000472108 USP17L19D6RCP7 530 aa18.59■□□□□ 0.57
USP20-204ENST00000472108 USP17L20D6RJB6 530 aa18.59■□□□□ 0.57
USP20-204ENST00000472108 MEIS2O14770 477 aa18.59■□□□□ 0.57
USP20-204ENST00000472108 LONP1P36776 959 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
USP20-204ENST00000472108 USP17L24Q0WX57 530 aa18.59■□□□□ 0.57
USP20-204ENST00000472108 USP17L6PQ6QN14 398 aa18.59■□□□□ 0.57
USP20-204ENST00000472108 USP49Q70CQ1 688 aa18.59■□□□□ 0.57
USP20-204ENST00000472108 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
USP20-204ENST00000472108 EPSTI1Q96J88 318 aa18.59■□□□□ 0.57
USP20-204ENST00000472108 TMEM60Q9H2L4 133 aa18.59■□□□□ 0.57
USP20-204ENST00000472108 ZHX2Q9Y6X8 837 aa18.59■□□□□ 0.57
USP20-204ENST00000472108 EDIL3O43854 480 aa18.58■□□□□ 0.57
USP20-204ENST00000472108 AP3B2Q13367 1082 aa18.58■□□□□ 0.57
USP20-204ENST00000472108 LONRF3Q496Y0 759 aa18.58■□□□□ 0.57
USP20-204ENST00000472108 DTHD1Q6ZMT9 781 aa18.58■□□□□ 0.57
USP20-204ENST00000472108 KRBA2Q6ZNG9 492 aa18.58■□□□□ 0.57
USP20-204ENST00000472108 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.57
USP20-204ENST00000472108 SLF1Q9BQI6 1058 aa18.58■□□□□ 0.57
USP20-204ENST00000472108 C19orf81C9J6K1 198 aa18.58■□□□□ 0.56
USP20-204ENST00000472108 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
USP20-204ENST00000472108 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
USP20-204ENST00000472108 NEMFO60524 1076 aa18.58■□□□□ 0.56
USP20-204ENST00000472108 VCAM1P19320 739 aa18.58■□□□□ 0.56
USP20-204ENST00000472108 MAP3K9P80192 1104 aa18.58■□□□□ 0.56
USP20-204ENST00000472108 PRKG1Q13976 671 aa18.58■□□□□ 0.56
USP20-204ENST00000472108 PPP4R3AQ6IN85 833 aa18.58■□□□□ 0.56
USP20-204ENST00000472108 CCDC174Q6PII3 467 aa18.58■□□□□ 0.56
USP20-204ENST00000472108 DLK2Q6UY11 383 aa18.58■□□□□ 0.56
USP20-204ENST00000472108 KIAA1468Q9P260 1216 aa18.58■□□□□ 0.56
USP20-204ENST00000472108 IQCA1LA6NCM1 817 aa18.57■□□□□ 0.56
USP20-204ENST00000472108 PIK3CDO00329 1044 aa18.57■□□□□ 0.56
USP20-204ENST00000472108 OPLAHO14841 1288 aa18.57■□□□□ 0.56
USP20-204ENST00000472108 RNF214Q8ND24 703 aa18.57■□□□□ 0.56
USP20-204ENST00000472108 CNNM3Q8NE01 707 aa18.57■□□□□ 0.56
USP20-204ENST00000472108 FOSP01100 380 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
USP20-204ENST00000472108 OR52Z1P0C646 297 aa18.56■□□□□ 0.56
USP20-204ENST00000472108 USP11P51784 963 aa18.56■□□□□ 0.56
USP20-204ENST00000472108 DGKZQ13574 1117 aa18.56■□□□□ 0.56
USP20-204ENST00000472108 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
USP20-204ENST00000472108 C12orf42Q96LP6 360 aa18.56■□□□□ 0.56
USP20-204ENST00000472108 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
USP20-204ENST00000472108 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
USP20-204ENST00000472108 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
USP20-204ENST00000472108 ANO3Q9BYT9 981 aa18.56■□□□□ 0.56
USP20-204ENST00000472108 TANGO6Q9C0B7 1094 aa18.56■□□□□ 0.56
USP20-204ENST00000472108 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
USP20-204ENST00000472108 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa18.56■□□□□ 0.56
USP20-204ENST00000472108 POTECB2RU33 542 aa18.55■□□□□ 0.56
USP20-204ENST00000472108 ICAM1P05362 532 aa18.55■□□□□ 0.56
USP20-204ENST00000472108 TPM2P07951 284 aa18.55■□□□□ 0.56
USP20-204ENST00000472108 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
USP20-204ENST00000472108 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
USP20-204ENST00000472108 KANK3Q6NY19 840 aa18.55■□□□□ 0.56
USP20-204ENST00000472108 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
USP20-204ENST00000472108 LDHDQ86WU2 507 aa18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms