RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458961.1

SNORD109B-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 109B, humanhuman

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Gene SNORD109B, Length 67 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleolus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD109B-201ENST00000458961 MKL1Q969V6 931 aa3.23□□□□□ -1.89
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SNORD109B-201ENST00000458961 TRERF1Q96PN7 1200 aa3.23□□□□□ -1.89
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SNORD109B-201ENST00000458961 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 PLIN4Q96Q06 1357 aa3.22□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 MUC3AQ02505 3323 aa3.22□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 XIRP2A4UGR9 3374 aa3.21□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 TTC28Q96AY4 2481 aa3.21□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 PTPDC1A2A3K4 754 aa3.21□□□□□ -1.9
SNORD109B-201ENST00000458961 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa3.21□□□□□ -1.9
SNORD109B-201ENST00000458961 RFXAPO00287 272 aa3.21□□□□□ -1.9
SNORD109B-201ENST00000458961 NFIBO00712 420 aa3.21□□□□□ -1.9
SNORD109B-201ENST00000458961 ERC2O15083 957 aa3.21□□□□□ -1.9
SNORD109B-201ENST00000458961 CABYRO75952 493 aa3.21□□□□□ -1.9
SNORD109B-201ENST00000458961 ICAM1P05362 532 aa3.21□□□□□ -1.9
SNORD109B-201ENST00000458961 MX1P20591 662 aa3.21□□□□□ -1.9
SNORD109B-201ENST00000458961 COL9A1P20849 921 aa3.21□□□□□ -1.9
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