RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441222.7

USP46-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP46, Length 7,954 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-201ENST00000441222 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 TMCO4Q5TGY1 634 aa7.27□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 KLC3Q6P597 504 aa7.27□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa7.27□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 CNPY4Q8N129 248 aa7.27□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 TBC1D7Q9P0N9 293 aa7.27□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 SMCO2A6NFE2 343 aa7.27□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 MED7O43513 233 aa7.27□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 ATP8B1O43520 1251 aa7.27□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 FOSP01100 380 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 CLTAP09496 248 aa7.27□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 H2AFZP0C0S5 128 aa7.27□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 H2AFVQ71UI9 128 aa7.27□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 CCDC197Q8NCU1 140 aa7.27□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 CCDC87Q9NVE4 849 aa7.27□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 KIF24Q5T7B8 1368 aa7.27□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 PDE1BQ01064 536 aa7.27□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 ZNF790Q6PG37 636 aa7.27□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 NSMFQ6X4W1 530 aa7.27□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 NME8Q8N427 588 aa7.27□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 PSMB7Q99436 277 aa7.27□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 TXLNGQ9NUQ3 528 aa7.27□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 MCF2LO15068 1137 aa7.27□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 SGSM2O43147 1006 aa7.27□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 ABL1P00519 1130 aa7.27□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 PIK3CAP42336 1068 aa7.27□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 GNGT1P63211 74 aa7.27□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 FAM102BQ5T8I3 360 aa7.27□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 NDUFAF2Q8N183 169 aa7.27□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 BCAS4Q8TDM0 211 aa7.27□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 ATP6V1E2Q96A05 226 aa7.27□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 ANO3Q9BYT9 981 aa7.27□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 PSTPIP2Q9H939 334 aa7.27□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 NLRC4Q9NPP4 1024 aa7.27□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 NRBP2Q9NSY0 501 aa7.27□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa7.27□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 H7C0C1 242 aa7.27□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 ATP5OP48047 213 aa7.27□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 CYP2J2P51589 502 aa7.27□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 C8orf34Q49A92 452 aa7.27□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 ATG16L1Q676U5 607 aa7.27□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 METTL23Q86XA0 190 aa7.27□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 CHMP6Q96FZ7 201 aa7.27□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa7.27□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 RIMS2Q9UQ26 1411 aa7.27□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 LONP1P36776 959 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 ABI1Q8IZP0 508 aa7.27□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 FLAD1Q8NFF5 587 aa7.27□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 ATP6V0A1Q93050 837 aa7.27□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 TEKT3Q9BXF9 490 aa7.27□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa7.27□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 POLR2MP0CAP2 368 aa7.26□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 ABCB4P21439 1286 aa7.26□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 GUCY2FP51841 1108 aa7.26□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 ARHGDIAP52565 204 aa7.26□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 ARMCX5Q6P1M9 558 aa7.26□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 PODNQ7Z5L7 613 aa7.26□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 SPATA5Q8NB90 893 aa7.26□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 AK8Q96MA6 479 aa7.26□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa7.26□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 GSTA4O15217 222 aa7.26□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 EFCAB14O75071 495 aa7.26□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 CHEK2O96017 543 aa7.26□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 MYL1P05976 194 aa7.26□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 TIMM10P62072 90 aa7.26□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa7.26□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 GIPC2Q8TF65 315 aa7.26□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa7.26□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 GAP43P17677 238 aa7.26□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 MFAP3P55082 362 aa7.26□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 ART3Q13508 389 aa7.26□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 KRT40Q6A162 431 aa7.26□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 BLIDQ8IZY5 108 aa7.26□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 CDHR1Q96JP9 859 aa7.26□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 K7ENM7 598 aa7.26□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 SGK1O00141 431 aa7.26□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 SKIP12755 728 aa7.26□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 SURF1Q15526 300 aa7.26□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 EXOC3L4Q17RC7 722 aa7.26□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 DPY19L2Q6NUT2 758 aa7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.9 ms