RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 MYH4Q9Y623 1939 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXD12-201ENST00000404162 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
HOXD12-201ENST00000404162 SMPD1P17405 629 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM67Q5HYA8 995 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXD12-201ENST00000404162 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP23.09■■□□□ 1.29
HOXD12-201ENST00000404162 KIF1BPQ96EK5 621 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXD12-201ENST00000404162 AP5M1Q9H0R1 490 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXD12-201ENST00000404162 MKNK2Q9HBH9 465 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXD12-201ENST00000404162 PDGFCQ9NRA1 345 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXD12-201ENST00000404162 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
HOXD12-201ENST00000404162 FEM1BQ9UK73 627 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXD12-201ENST00000404162 LRRC37A2A6NM11 1700 aa23.08■■□□□ 1.29
HOXD12-201ENST00000404162 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa23.08■■□□□ 1.29
HOXD12-201ENST00000404162 OAZ1P54368 228 aa23.08■■□□□ 1.29
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM31Q5JXX7 168 aa23.08■■□□□ 1.29
HOXD12-201ENST00000404162 COG5Q9UP83 839 aa23.08■■□□□ 1.29
HOXD12-201ENST00000404162 MYH7P12883 1935 aa23.08■■□□□ 1.28
HOXD12-201ENST00000404162 ARHGEF15O94989 841 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXD12-201ENST00000404162 ATP5JP18859 108 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXD12-201ENST00000404162 SBK1Q52WX2 424 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXD12-201ENST00000404162 DEFB128Q7Z7B8 93 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXD12-201ENST00000404162 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXD12-201ENST00000404162 ACAD9Q9H845 621 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXD12-201ENST00000404162 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
HOXD12-201ENST00000404162 SCN5AQ14524 2016 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXD12-201ENST00000404162 ZEB2O60315 1214 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXD12-201ENST00000404162 CYP2C9P11712 490 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXD12-201ENST00000404162 TAPT1Q6NXT6 567 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXD12-201ENST00000404162 EEPD1Q7L9B9 569 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXD12-201ENST00000404162 MKL1Q969V6 931 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXD12-201ENST00000404162 HAUS7Q99871 368 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXD12-201ENST00000404162 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
HOXD12-201ENST00000404162 C11orf16Q9NQ32 467 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXD12-201ENST00000404162 ASB14A6NK59 587 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXD12-201ENST00000404162 MINDY4BA8MYZ0 360 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXD12-201ENST00000404162 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
HOXD12-201ENST00000404162 RNF146Q9NTX7 359 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXD12-201ENST00000404162 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
HOXD12-201ENST00000404162 FAM86C2PA6NEL3 165 aa23.04■■□□□ 1.28
HOXD12-201ENST00000404162 GSG1L2A8MUP6 293 aa23.04■■□□□ 1.28
HOXD12-201ENST00000404162 PFKMP08237 780 aa23.04■■□□□ 1.28
HOXD12-201ENST00000404162 IQSEC1Q6DN90 963 aa23.04■■□□□ 1.28
HOXD12-201ENST00000404162 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
HOXD12-201ENST00000404162 ARNTL2Q8WYA1 636 aa23.04■■□□□ 1.28
HOXD12-201ENST00000404162 CEP95Q96GE4 821 aa23.04■■□□□ 1.28
HOXD12-201ENST00000404162 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
HOXD12-201ENST00000404162 COG6Q9Y2V7 657 aa23.04■■□□□ 1.28
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF536O15090 1300 aa23.04■■□□□ 1.28
HOXD12-201ENST00000404162 GPR37L1O60883 481 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXD12-201ENST00000404162 BMP3P12645 472 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXD12-201ENST00000404162 TAP1Q03518 808 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXD12-201ENST00000404162 SLFN13Q68D06 897 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXD12-201ENST00000404162 HLA-CQ95604 372 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXD12-201ENST00000404162 MTMR4Q9NYA4 1195 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXD12-201ENST00000404162 Q9Y3F1 56 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM232C9JQI7 657 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXD12-201ENST00000404162 PRDM1O75626 825 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
HOXD12-201ENST00000404162 TNKSO95271 1327 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXD12-201ENST00000404162 FDX1P10109 184 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXD12-201ENST00000404162 GRB10Q13322 594 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXD12-201ENST00000404162 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXD12-201ENST00000404162 SPRED2Q7Z698 418 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXD12-201ENST00000404162 SIRT2Q8IXJ6 389 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXD12-201ENST00000404162 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXD12-201ENST00000404162 PANK1Q8TE04 598 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXD12-201ENST00000404162 CHMP4CQ96CF2 233 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXD12-201ENST00000404162 TRERF1Q96PN7 1200 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXD12-201ENST00000404162 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
HOXD12-201ENST00000404162 SLC9A7Q96T83 725 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXD12-201ENST00000404162 CD320Q9NPF0 282 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXD12-201ENST00000404162 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa23■■□□□ 1.27
HOXD12-201ENST00000404162 ACTN1P12814 892 aa23■■□□□ 1.27
HOXD12-201ENST00000404162 ALAS1P13196 640 aa23■■□□□ 1.27
HOXD12-201ENST00000404162 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa23■■□□□ 1.27
HOXD12-201ENST00000404162 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
HOXD12-201ENST00000404162 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa23■■□□□ 1.27
HOXD12-201ENST00000404162 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
HOXD12-201ENST00000404162 TTLL1O95922 423 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXD12-201ENST00000404162 SNAP25P60880 206 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXD12-201ENST00000404162 MUM1L1Q5H9M0 696 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXD12-201ENST00000404162 HERC6Q8IVU3 1022 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXD12-201ENST00000404162 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXD12-201ENST00000404162 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXD12-201ENST00000404162 LCTP09848 1927 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXD12-201ENST00000404162 LPXNO60711 386 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXD12-201ENST00000404162 RAB11FIP3O75154 756 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXD12-201ENST00000404162 STAT2P52630 851 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXD12-201ENST00000404162 TKFCQ3LXA3 575 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXD12-201ENST00000404162 GIMAP6Q6P9H5 292 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXD12-201ENST00000404162 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
HOXD12-201ENST00000404162 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
HOXD12-201ENST00000404162 VTA1Q9NP79 307 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXD12-201ENST00000404162 CYP39A1Q9NYL5 469 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXD12-201ENST00000404162 PI4K2BG5E9Z4 385 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXD12-201ENST00000404162 MYL3P08590 195 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXD12-201ENST00000404162 PURAQ00577 322 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
HOXD12-201ENST00000404162 FAM160B2Q86V87 743 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXD12-201ENST00000404162 CHURC1Q8WUH1 139 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXD12-201ENST00000404162 STAG1Q8WVM7 1258 aa22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms