RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371786.3

C9orf116-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 116, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf116, Length 612 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf116-201ENST00000371786 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
C9orf116-201ENST00000371786 PCDHA6Q9UN73 950 aa20.43■□□□□ 0.86
C9orf116-201ENST00000371786 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
C9orf116-201ENST00000371786 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa20.43■□□□□ 0.86
C9orf116-201ENST00000371786 SLC10A3P09131 477 aa20.42■□□□□ 0.86
C9orf116-201ENST00000371786 MYSM1Q5VVJ2 828 aa20.42■□□□□ 0.86
C9orf116-201ENST00000371786 LBX2Q6XYB7 198 aa20.42■□□□□ 0.86
C9orf116-201ENST00000371786 ANKRD23Q86SG2 305 aa20.42■□□□□ 0.86
C9orf116-201ENST00000371786 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa20.42■□□□□ 0.86
C9orf116-201ENST00000371786 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
C9orf116-201ENST00000371786 MYH15Q9Y2K3 1946 aa20.41■□□□□ 0.86
C9orf116-201ENST00000371786 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
C9orf116-201ENST00000371786 BTBD19C9JJ37 291 aa20.41■□□□□ 0.86
C9orf116-201ENST00000371786 OPLAHO14841 1288 aa20.41■□□□□ 0.86
C9orf116-201ENST00000371786 ATP2A1O14983 1001 aa20.41■□□□□ 0.86
C9orf116-201ENST00000371786 TMEM132BQ14DG7 1078 aa20.41■□□□□ 0.86
C9orf116-201ENST00000371786 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
C9orf116-201ENST00000371786 POTEEQ6S8J3 1075 aa20.41■□□□□ 0.86
C9orf116-201ENST00000371786 MB21D1Q8N884 522 aa20.41■□□□□ 0.86
C9orf116-201ENST00000371786 RASGRP4Q8TDF6 673 aa20.41■□□□□ 0.86
C9orf116-201ENST00000371786 CCDC102AQ96A19 550 aa20.41■□□□□ 0.86
C9orf116-201ENST00000371786 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
C9orf116-201ENST00000371786 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
C9orf116-201ENST00000371786 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
C9orf116-201ENST00000371786 PDHXO00330 501 aa20.4■□□□□ 0.86
C9orf116-201ENST00000371786 HERVK_113P62684 666 aa20.4■□□□□ 0.86
C9orf116-201ENST00000371786 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
C9orf116-201ENST00000371786 ATL3Q6DD88 541 aa20.4■□□□□ 0.86
C9orf116-201ENST00000371786 TEX2Q8IWB9 1127 aa20.4■□□□□ 0.86
C9orf116-201ENST00000371786 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
C9orf116-201ENST00000371786 PTPN18Q99952 460 aa20.4■□□□□ 0.86
C9orf116-201ENST00000371786 PNMA3Q9UL41 463 aa20.4■□□□□ 0.86
C9orf116-201ENST00000371786 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
C9orf116-201ENST00000371786 SMCHD1A6NHR9 2005 aa20.39■□□□□ 0.86
C9orf116-201ENST00000371786 A0A0G2JMZ2 1700 aa20.39■□□□□ 0.86
C9orf116-201ENST00000371786 FAM205CA6NFA0 338 aa20.39■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 MEIS2O14770 477 aa20.39■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 ALAS1P13196 640 aa20.39■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 CLK2P49760 499 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 KRT85P78386 507 aa20.39■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 UBE2SQ16763 222 aa20.39■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa20.39■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa20.39■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 KRT25Q7Z3Z0 450 aa20.39■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 TMEM260Q9NX78 707 aa20.39■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 CNPY2Q9Y2B0 182 aa20.39■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa20.38■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 NCLP19338 710 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 STAT3P40763 770 aa20.38■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 USP17L6PQ6QN14 398 aa20.38■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 FAM43AQ8N2R8 423 aa20.38■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 CLEC4DQ8WXI8 215 aa20.38■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 TEX13BQ9BXU2 312 aa20.38■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 BTBD7Q9P203 1132 aa20.38■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 CFAP45Q9UL16 551 aa20.38■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 RIPK3Q9Y572 518 aa20.38■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 PIK3CDO00329 1044 aa20.37■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 CNMDO75829 334 aa20.37■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 APLP1P51693 650 aa20.37■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 TKFCQ3LXA3 575 aa20.37■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 RILPL1Q5EBL4 403 aa20.37■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 MUM1L1Q5H9M0 696 aa20.37■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 TBC1D5Q92609 795 aa20.37■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 TRERF1Q96PN7 1200 aa20.37■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 USP28Q96RU2 1077 aa20.37■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 TCHHQ07283 1943 aa20.36■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 CYP2C8P10632 490 aa20.36■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 MCM4P33991 863 aa20.36■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 INHBEP58166 350 aa20.36■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 PLS1Q14651 629 aa20.36■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP20.36■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 MCTP2Q6DN12 878 aa20.36■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 MCF2L2Q86YR7 1114 aa20.36■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 CREBZFQ9NS37 354 aa20.36■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 HOMER2Q9NSB8 354 aa20.36■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 RTEL1Q9NZ71 1219 aa20.36■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 RBPJLQ9UBG7 517 aa20.36■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa20.36■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 NFIBO00712 420 aa20.35■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 PEX10O60683 326 aa20.35■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 CFBP00751 764 aa20.35■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 POLR2MP0CAP2 368 aa20.35■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 TRAPPC10P48553 1259 aa20.35■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 GHRHRQ02643 423 aa20.35■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 AP3B2Q13367 1082 aa20.35■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 ANO1Q5XXA6 986 aa20.35■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 RIOX2Q8IUF8 465 aa20.35■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 SAMD3Q8N6K7 520 aa20.35■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 PAGR1Q9BTK6 254 aa20.35■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP20.35■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 RNF146Q9NTX7 359 aa20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms