RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-202ENST00000370826 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-202ENST00000370826 SP110Q9HB58 689 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-202ENST00000370826 FADS2P1A8MWK0 482 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-202ENST00000370826 HPXP02790 462 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-202ENST00000370826 SCG5P05408 212 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-202ENST00000370826 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM153BP0C7A2 387 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-202ENST00000370826 SEPHS1P49903 392 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-202ENST00000370826 GFRA1P56159 465 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-202ENST00000370826 ERVFC1P60507 584 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-202ENST00000370826 JMYQ8N9B5 988 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-202ENST00000370826 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-202ENST00000370826 PDZD8Q8NEN9 1154 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-202ENST00000370826 CCDC140Q96MF4 163 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-202ENST00000370826 PTCHD1Q96NR3 888 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-202ENST00000370826 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-202ENST00000370826 GPRC5CQ9NQ84 441 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-202ENST00000370826 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-202ENST00000370826 TRAV20A0A0B4J274 112 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGGTB-202ENST00000370826 CPP00450 1065 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGGTB-202ENST00000370826 FGFR1P11362 822 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGGTB-202ENST00000370826 ECI1P42126 302 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGGTB-202ENST00000370826 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
RABGGTB-202ENST00000370826 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
RABGGTB-202ENST00000370826 KCNJ6P48051 423 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGGTB-202ENST00000370826 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
RABGGTB-202ENST00000370826 SPPL2CQ8IUH8 684 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGGTB-202ENST00000370826 OXR1Q8N573 874 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGGTB-202ENST00000370826 NAT16Q8N8M0 369 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGGTB-202ENST00000370826 ANKS4BQ8N8V4 417 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGGTB-202ENST00000370826 FRS2Q8WU20 508 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGGTB-202ENST00000370826 IER2Q9BTL4 223 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGGTB-202ENST00000370826 FITM1A5D6W6 292 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGGTB-202ENST00000370826 NOTOA8MTQ0 251 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGGTB-202ENST00000370826 PRODHO43272 600 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGGTB-202ENST00000370826 DLX3O60479 287 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGGTB-202ENST00000370826 USP2O75604 605 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
RABGGTB-202ENST00000370826 TBC1D8O95759 1140 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGGTB-202ENST00000370826 THBDP07204 575 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGGTB-202ENST00000370826 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
RABGGTB-202ENST00000370826 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
RABGGTB-202ENST00000370826 RTP1P59025 263 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGGTB-202ENST00000370826 CHRNEQ04844 493 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGGTB-202ENST00000370826 NR0B2Q15466 257 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGGTB-202ENST00000370826 LONRF2Q1L5Z9 754 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGGTB-202ENST00000370826 PRSS53Q2L4Q9 553 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGGTB-202ENST00000370826 FOXB2Q5VYV0 432 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGGTB-202ENST00000370826 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGGTB-202ENST00000370826 CYP2R1Q6VVX0 501 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGGTB-202ENST00000370826 KSR1Q8IVT5 923 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM145Q8NBT3 493 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGGTB-202ENST00000370826 KREMEN2Q8NCW0 462 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGGTB-202ENST00000370826 FLAD1Q8NFF5 587 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGGTB-202ENST00000370826 NPLOC4Q8TAT6 608 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGGTB-202ENST00000370826 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
RABGGTB-202ENST00000370826 OSBP2Q969R2 916 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGGTB-202ENST00000370826 C19orf44Q9H6X5 657 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGGTB-202ENST00000370826 CLEC1BQ9P126 229 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGGTB-202ENST00000370826 ARNTLO00327 626 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGGTB-202ENST00000370826 PLS3P13797 630 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGGTB-202ENST00000370826 PAMP19021 973 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGGTB-202ENST00000370826 AFMP43652 599 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGGTB-202ENST00000370826 MAP4K2Q12851 820 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC14A2Q15849 920 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGGTB-202ENST00000370826 C2orf27AQ580R0 203 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGGTB-202ENST00000370826 FYB2Q5VWT5 728 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGGTB-202ENST00000370826 DENND5AQ6IQ26 1287 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGGTB-202ENST00000370826 NSMFQ6X4W1 530 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGGTB-202ENST00000370826 CEP128Q6ZU80 1094 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGGTB-202ENST00000370826 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
RABGGTB-202ENST00000370826 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
RABGGTB-202ENST00000370826 SLCO6A1Q86UG4 719 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGGTB-202ENST00000370826 SCUBE1Q8IWY4 988 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGGTB-202ENST00000370826 MYLIPQ8WY64 445 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGGTB-202ENST00000370826 KCTD13Q8WZ19 329 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGGTB-202ENST00000370826 C1orf159Q96HA4 380 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGGTB-202ENST00000370826 KANSL2Q9H9L4 492 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
RABGGTB-202ENST00000370826 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGGTB-202ENST00000370826 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGGTB-202ENST00000370826 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
RABGGTB-202ENST00000370826 A0A1W2PQY0 241 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGGTB-202ENST00000370826 NRDCO43847 1150 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGGTB-202ENST00000370826 EFEMP2O95967 443 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGGTB-202ENST00000370826 RAC2P15153 192 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGGTB-202ENST00000370826 TIGD5Q53EQ6 642 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM209AQ5JX71 171 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGGTB-202ENST00000370826 CPNE8Q86YQ8 564 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGGTB-202ENST00000370826 SH3TC2Q8TF17 1288 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGGTB-202ENST00000370826 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
RABGGTB-202ENST00000370826 JMJD8Q96S16 334 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGGTB-202ENST00000370826 MMP19Q99542 508 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGGTB-202ENST00000370826 CDC6Q99741 560 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGGTB-202ENST00000370826 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGGTB-202ENST00000370826 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
RABGGTB-202ENST00000370826 PSPNO60542 156 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGGTB-202ENST00000370826 L1CAMP32004 1257 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGGTB-202ENST00000370826 LAPTM5Q13571 262 aa5.81□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms