RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000339298.2

SOCS4-201, Transcript of suppressor of cytokine signaling 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOCS4, Length 6,667 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS4-201ENST00000339298 SPAG5Q96R06 1193 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 NACA2Q9H009 215 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 HPS5Q9UPZ3 1129 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 TACC1O75410 805 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 CPA3P15088 417 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 PAX7P23759 505 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 ARF1P84077 181 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 STK38Q15208 465 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 CCDC57Q2TAC2 916 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 USP37Q86T82 979 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 MCUQ8NE86 351 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 ARMC2Q8NEN0 867 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 SIPA1Q96FS4 1042 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 WNK4Q96J92 1243 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 TTC1Q99614 292 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 OGFRQ9NZT2 677 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 ATG7O95352 703 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 PYGLP06737 847 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 HMOX1P09601 288 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 TNFAIP3P21580 790 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 ETFBP38117 255 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 KRT17Q04695 432 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 ALG1LQ6GMV1 187 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 VHLLQ6RSH7 139 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 GADL1Q6ZQY3 521 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 FAM186BQ8IYM0 893 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 FAM76AQ8TAV0 307 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 AKT1S1Q96B36 256 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 BRMS1Q9HCU9 246 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 KLF15Q9UIH9 416 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 ROCK1Q13464 1354 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 CFAP99D6REC4 459 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 TAF4O00268 1085 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 KCNH1O95259 989 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 CAPN1P07384 714 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 IL4RP24394 825 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 PTGS2P35354 604 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 LONP1P36776 959 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 MRE11P49959 708 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 PPP2R3AQ06190 1150 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 TRAF1Q13077 416 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 CAMK2DQ13557 499 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 AKNAD1Q5T1N1 836 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 PIK3R6Q5UE93 754 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 RAPH1Q70E73 1250 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 TREML1Q86YW5 311 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 SLC9A9Q8IVB4 645 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 CDADC1Q9BWV3 514 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 CCDC113Q9H0I3 377 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 DPH5Q9H2P9 285 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 FKBPLQ9UIM3 349 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 FAN1Q9Y2M0 1017 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 USP1O94782 785 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 MOCS3O95396 460 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 TOP1P11387 765 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 BMP2P12643 396 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 P4HA1P13674 534 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 CCNCP24863 283 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 PCYT1AP49585 367 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 LAMB3Q13751 1172 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 CAMK4Q16566 473 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 IFI44LQ53G44 452 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 ODF2Q5BJF6 829 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 CCDC158Q5M9N0 1113 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 AGAP9Q5VTM2 703 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 GRAMD4Q6IC98 578 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 NEK5Q6P3R8 708 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 LURAP1LQ8IV03 231 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 TAF4BQ92750 862 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 PGBD1Q96JS3 809 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 B3GALT6Q96L58 329 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 SLC39A3Q9BRY0 314 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 APOL6Q9BWW8 343 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 EDEM3Q9BZQ6 932 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 SLC5A4Q9NY91 659 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 ABCF2Q9UG63 623 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 USP18Q9UMW8 372 aa3.55□□□□□ -1.84
SOCS4-201ENST00000339298 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms