RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF536O15090 1300 aa31.44■■■□□ 2.62
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CTDNEP1-201ENST00000318988 PLS1Q14651 629 aa31.44■■■□□ 2.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP31.44■■■□□ 2.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 ALAS1P13196 640 aa31.43■■■□□ 2.62
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP31.43■■■□□ 2.62
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TEX13BQ9BXU2 312 aa31.42■■■□□ 2.62
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP31.41■■■□□ 2.62
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CTDNEP1-201ENST00000318988 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa31.41■■■□□ 2.62
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CTDNEP1-201ENST00000318988 KRT25Q7Z3Z0 450 aa31.4■■■□□ 2.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 TEX2Q8IWB9 1127 aa31.4■■■□□ 2.62
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CTDNEP1-201ENST00000318988 PAGR1Q9BTK6 254 aa31.39■■■□□ 2.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 HOMER2Q9NSB8 354 aa31.39■■■□□ 2.62
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CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM43AQ8N2R8 423 aa31.39■■■□□ 2.61
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CYP2C8P10632 490 aa31.37■■■□□ 2.61
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CTDNEP1-201ENST00000318988 RNF146Q9NTX7 359 aa31.37■■■□□ 2.61
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CTDNEP1-201ENST00000318988 MUM1L1Q5H9M0 696 aa31.33■■■□□ 2.61
CTDNEP1-201ENST00000318988 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP31.33■■■□□ 2.61
CTDNEP1-201ENST00000318988 ACAD9Q9H845 621 aa31.33■■■□□ 2.61
CTDNEP1-201ENST00000318988 RBPJLQ9UBG7 517 aa31.33■■■□□ 2.61
CTDNEP1-201ENST00000318988 CNPY2Q9Y2B0 182 aa31.33■■■□□ 2.61
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM205CA6NFA0 338 aa31.32■■■□□ 2.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 NFIBO00712 420 aa31.32■■■□□ 2.6
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