RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 SMARCA1P28370 1054 aa9.83□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 TECP42680 631 aa9.83□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 LRRC63Q05C16 580 aa9.83□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 GRAPQ13588 217 aa9.83□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 ASIC2Q16515 512 aa9.83□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 CFAP221Q4G0U5 840 aa9.83□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 WDR24Q96S15 920 aa9.83□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 CAPN11Q9UMQ6 739 aa9.83□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa9.82□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 SLC26A4O43511 780 aa9.82□□□□□ -0.84
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HERC3-201ENST00000264345 TBC1D5Q92609 795 aa9.82□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 JAG2Q9Y219 1238 aa9.82□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 GOLGA8KD6RF30 607 aa9.82□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 PRCPP42785 496 aa9.82□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 APBA1Q02410 837 aa9.82□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 PPFIA1Q13136 1202 aa9.82□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 PICALMQ13492 652 aa9.82□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 CLUL1Q15846 466 aa9.82□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 PTPN21Q16825 1174 aa9.82□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 C8orf74Q6P047 294 aa9.82□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 SLFN12Q8IYM2 578 aa9.82□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 USP17L8P0C7I0 530 aa9.82□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP9.82□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 ADSSL1Q8N142 457 aa9.82□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP9.82□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 PLCG1P19174 1290 aa9.82□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 TROAPQ12815 778 aa9.82□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 ZSCAN26Q16670 478 aa9.82□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 C12orf60Q5U649 245 aa9.82□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 SPZ1Q9BXG8 430 aa9.82□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 FAM184BQ9ULE4 1060 aa9.82□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 PCDHA6Q9UN73 950 aa9.82□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa9.82□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 GOLGA6BA6NDN3 693 aa9.81□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 SPDYE3A6NKU9 549 aa9.81□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 RHOBTB3O94955 611 aa9.81□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 NOP2P46087 812 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 PDE4CQ08493 712 aa9.81□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 SLC10A5Q5PT55 438 aa9.81□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 C2CD5Q86YS7 1000 aa9.81□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa9.81□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 DRC1Q96MC2 740 aa9.81□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 PDE11AQ9HCR9 933 aa9.81□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 GPCPD1Q9NPB8 672 aa9.81□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 JRKLQ9Y4A0 524 aa9.81□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
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HERC3-201ENST00000264345 FOXP2O15409 715 aa9.81□□□□□ -0.84
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HERC3-201ENST00000264345 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 TYW1BQ6NUM6 668 aa9.81□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 TRIM65Q6PJ69 517 aa9.81□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 GBP6Q6ZN66 633 aa9.81□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 UNC13DQ70J99 1090 aa9.81□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa9.81□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 RGPD5Q99666 1765 aa9.81□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa9.81□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 PAK2Q13177 524 aa9.81□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 ODF2Q5BJF6 829 aa9.81□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 RRAGAQ7L523 313 aa9.81□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 PROM2Q8N271 834 aa9.81□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 EDEM3Q9BZQ6 932 aa9.81□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 UBA5Q9GZZ9 404 aa9.81□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 GDAQ9Y2T3 454 aa9.81□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa9.81□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa9.81□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 PKN1Q16512 942 aa9.8□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 BARGINQ6ZT62 677 aa9.8□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 C7orf25Q9BPX7 421 aa9.8□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 RASSF4Q9H2L5 321 aa9.8□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 GOLGA6CA6NDK9 693 aa9.8□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 GOLGA6DP0CG33 693 aa9.8□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 GRIN1Q05586 938 aa9.8□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 CFAP58Q5T655 872 aa9.8□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 TCERG1LQ5VWI1 586 aa9.8□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 RASGRP4Q8TDF6 673 aa9.8□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 TMEM47Q9BQJ4 181 aa9.8□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa9.8□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 A0A1W2PQJ5 194 aa9.8□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 CYP2D6P10635 497 aa9.8□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 CDK8P49336 464 aa9.8□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 C10orf76Q5T2E6 689 aa9.8□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 TBCKQ8TEA7 893 aa9.8□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 ABCB6Q9NP58 842 aa9.8□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 PANK4Q9NVE7 773 aa9.8□□□□□ -0.84
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