RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
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CAPNS1-201ENST00000246533 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
CAPNS1-201ENST00000246533 HTTP42858 3142 aa29.99■■■□□ 2.39
CAPNS1-201ENST00000246533 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
CAPNS1-201ENST00000246533 APOBRQ0VD83 1088 aa29.98■■■□□ 2.39
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CAPNS1-201ENST00000246533 YEATS4O95619 227 aa29.98■■■□□ 2.39
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CAPNS1-201ENST00000246533 KLRC3Q07444 240 aa29.98■■■□□ 2.39
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CAPNS1-201ENST00000246533 KRT23Q9C075 422 aa29.96■■■□□ 2.39
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CAPNS1-201ENST00000246533 FAM83BQ5T0W9 1011 aa29.94■■■□□ 2.38
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CAPNS1-201ENST00000246533 SH2D4AQ9H788 454 aa29.94■■■□□ 2.38
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CAPNS1-201ENST00000246533 CCP110O43303 1012 aa29.94■■■□□ 2.38
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CAPNS1-201ENST00000246533 KIAA1468Q9P260 1216 aa29.94■■■□□ 2.38
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CAPNS1-201ENST00000246533 USP17L17D6RBQ6 530 aa29.92■■■□□ 2.38
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CAPNS1-201ENST00000246533 USP17L20D6RJB6 530 aa29.92■■■□□ 2.38
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CAPNS1-201ENST00000246533 USP17L24Q0WX57 530 aa29.92■■■□□ 2.38
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CAPNS1-201ENST00000246533 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa29.92■■■□□ 2.38
CAPNS1-201ENST00000246533 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
CAPNS1-201ENST00000246533 NCOA7Q8NI08 942 aa29.92■■■□□ 2.38
CAPNS1-201ENST00000246533 TXNRD2Q9NNW7 524 aa29.92■■■□□ 2.38
CAPNS1-201ENST00000246533 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
CAPNS1-201ENST00000246533 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa29.92■■■□□ 2.38
CAPNS1-201ENST00000246533 LINC00301Q8NCQ3 95 aa29.92■■■□□ 2.38
CAPNS1-201ENST00000246533 LPAR1Q92633 364 aa29.92■■■□□ 2.38
CAPNS1-201ENST00000246533 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
CAPNS1-201ENST00000246533 TNKSO95271 1327 aa29.92■■■□□ 2.38
CAPNS1-201ENST00000246533 OSBPP22059 807 aa29.91■■■□□ 2.38
CAPNS1-201ENST00000246533 HERVK_113P62684 666 aa29.91■■■□□ 2.38
CAPNS1-201ENST00000246533 SLFN13Q68D06 897 aa29.91■■■□□ 2.38
CAPNS1-201ENST00000246533 WDR19Q8NEZ3 1342 aa29.91■■■□□ 2.38
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CAPNS1-201ENST00000246533 IQCA1Q86XH1 822 aa29.9■■■□□ 2.38
CAPNS1-201ENST00000246533 BCRP11274 1271 aa29.9■■■□□ 2.38
CAPNS1-201ENST00000246533 CTGFP29279 349 aa29.9■■■□□ 2.38
CAPNS1-201ENST00000246533 STK38Q15208 465 aa29.9■■■□□ 2.38
CAPNS1-201ENST00000246533 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
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CAPNS1-201ENST00000246533 KRT222Q8N1A0 295 aa29.9■■■□□ 2.38
CAPNS1-201ENST00000246533 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa29.9■■■□□ 2.38
CAPNS1-201ENST00000246533 PNMA3Q9UL41 463 aa29.9■■■□□ 2.38
CAPNS1-201ENST00000246533 USP27XA6NNY8 438 aa29.89■■■□□ 2.38
CAPNS1-201ENST00000246533 WDR46O15213 610 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.38
CAPNS1-201ENST00000246533 SEC23AQ15436 765 aa29.89■■■□□ 2.38
CAPNS1-201ENST00000246533 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa29.89■■■□□ 2.38
CAPNS1-201ENST00000246533 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP29.89■■■□□ 2.381e-7■■■□□ 14.8
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