RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 FOXK2Q01167 660 aa19.86■□□□□ 0.77
SPCS1-201ENST00000233025 SLF1Q9BQI6 1058 aa19.86■□□□□ 0.77
SPCS1-201ENST00000233025 ANTXR1Q9H6X2 564 aa19.86■□□□□ 0.77
SPCS1-201ENST00000233025 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
SPCS1-201ENST00000233025 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
SPCS1-201ENST00000233025 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa19.86■□□□□ 0.77
SPCS1-201ENST00000233025 TNKSO95271 1327 aa19.85■□□□□ 0.77
SPCS1-201ENST00000233025 ATP2A1O14983 1001 aa19.85■□□□□ 0.77
SPCS1-201ENST00000233025 RFC2P35250 354 aa19.85■□□□□ 0.77
SPCS1-201ENST00000233025 PRSS33Q8NF86 280 aa19.85■□□□□ 0.77
SPCS1-201ENST00000233025 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
SPCS1-201ENST00000233025 GOPCQ9HD26 462 aa19.85■□□□□ 0.77
SPCS1-201ENST00000233025 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa19.84■□□□□ 0.77
SPCS1-201ENST00000233025 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
SPCS1-201ENST00000233025 SDR42E1Q8WUS8 393 aa19.84■□□□□ 0.77
SPCS1-201ENST00000233025 SUGCTQ9HAC7 445 aa19.84■□□□□ 0.77
SPCS1-201ENST00000233025 ZEB2O60315 1214 aa19.83■□□□□ 0.77
SPCS1-201ENST00000233025 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa19.83■□□□□ 0.77
SPCS1-201ENST00000233025 SMPD1P17405 629 aa19.83■□□□□ 0.77
SPCS1-201ENST00000233025 ZP2Q05996 745 aa19.83■□□□□ 0.77
SPCS1-201ENST00000233025 ANKRD35Q8N283 1001 aa19.83■□□□□ 0.77
SPCS1-201ENST00000233025 NEK9Q8TD19 979 aa19.83■□□□□ 0.77
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC17Q96LX7 622 aa19.83■□□□□ 0.77
SPCS1-201ENST00000233025 MFSD14AQ96MC6 490 aa19.83■□□□□ 0.77
SPCS1-201ENST00000233025 CACNA1BQ00975 2339 aa19.82■□□□□ 0.76
SPCS1-201ENST00000233025 DMDP11532 3685 aa19.82■□□□□ 0.76
SPCS1-201ENST00000233025 BAIAP3O94812 1187 aa19.82■□□□□ 0.76
SPCS1-201ENST00000233025 CNTN2Q02246 1040 aa19.82■□□□□ 0.76
SPCS1-201ENST00000233025 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP19.82■□□□□ 0.76
SPCS1-201ENST00000233025 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP19.82■□□□□ 0.76
SPCS1-201ENST00000233025 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP19.82■□□□□ 0.76
SPCS1-201ENST00000233025 AP5M1Q9H0R1 490 aa19.82■□□□□ 0.76
SPCS1-201ENST00000233025 PLXNA3P51805 1871 aa19.82■□□□□ 0.76
SPCS1-201ENST00000233025 C19orf67A6NJJ6 358 aa19.81■□□□□ 0.76
SPCS1-201ENST00000233025 PITPNM1O00562 1244 aa19.81■□□□□ 0.76
SPCS1-201ENST00000233025 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP19.81■□□□□ 0.76
SPCS1-201ENST00000233025 IQCF3P0C7M6 154 aa19.81■□□□□ 0.76
SPCS1-201ENST00000233025 CPXCR1Q8N123 301 aa19.81■□□□□ 0.76
SPCS1-201ENST00000233025 FAM133AQ8N9E0 248 aa19.81■□□□□ 0.76
SPCS1-201ENST00000233025 KANSL2Q9H9L4 492 aa19.81■□□□□ 0.76
SPCS1-201ENST00000233025 NLRC5Q86WI3 1866 aa19.81■□□□□ 0.76
SPCS1-201ENST00000233025 MICAL3Q7RTP6 2002 aa19.81■□□□□ 0.76
SPCS1-201ENST00000233025 GNAI2P04899 355 aa19.8■□□□□ 0.76
SPCS1-201ENST00000233025 SLC4A3P48751 1232 aa19.8■□□□□ 0.76
SPCS1-201ENST00000233025 ERVK-21P61565 698 aa19.8■□□□□ 0.76
SPCS1-201ENST00000233025 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP19.8■□□□□ 0.76
SPCS1-201ENST00000233025 CHST13Q8NET6 341 aa19.8■□□□□ 0.76
SPCS1-201ENST00000233025 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP19.8■□□□□ 0.76
SPCS1-201ENST00000233025 FBXO40Q9UH90 709 aa19.8■□□□□ 0.76
SPCS1-201ENST00000233025 MTUS1Q9ULD2 1270 aa19.8■□□□□ 0.76
SPCS1-201ENST00000233025 Q9Y3F1 56 aa19.8■□□□□ 0.76
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SPCS1-201ENST00000233025 RAD21O60216 631 aa19.79■□□□□ 0.76
SPCS1-201ENST00000233025 CDK8P49336 464 aa19.79■□□□□ 0.76
SPCS1-201ENST00000233025 PTPN5P54829 565 aa19.79■□□□□ 0.76
SPCS1-201ENST00000233025 WDR5P61964 334 aaKnown RBP19.79■□□□□ 0.76
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM63BQ5T3F8 832 aa19.79■□□□□ 0.76
SPCS1-201ENST00000233025 POTEHQ6S545 545 aa19.79■□□□□ 0.76
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SPCS1-201ENST00000233025 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP19.79■□□□□ 0.76
SPCS1-201ENST00000233025 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP19.79■□□□□ 0.76
SPCS1-201ENST00000233025 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP19.79■□□□□ 0.76
SPCS1-201ENST00000233025 PRKAG3Q9UGI9 489 aa19.79■□□□□ 0.76
SPCS1-201ENST00000233025 H3BQ06 376 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
SPCS1-201ENST00000233025 PDE6AP16499 860 aa19.78■□□□□ 0.76
SPCS1-201ENST00000233025 KCNJ6P48051 423 aa19.78■□□□□ 0.76
SPCS1-201ENST00000233025 C16orf86Q6ZW13 317 aa19.78■□□□□ 0.76
SPCS1-201ENST00000233025 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
SPCS1-201ENST00000233025 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa19.78■□□□□ 0.76
SPCS1-201ENST00000233025 PDGFCQ9NRA1 345 aa19.78■□□□□ 0.76
SPCS1-201ENST00000233025 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
SPCS1-201ENST00000233025 LINC01553A4QN01 128 aa19.77■□□□□ 0.76
SPCS1-201ENST00000233025 SOWAHBA6NEL2 793 aa19.77■□□□□ 0.76
SPCS1-201ENST00000233025 DEFB103AP81534 67 aa19.77■□□□□ 0.76
SPCS1-201ENST00000233025 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP19.77■□□□□ 0.76
SPCS1-201ENST00000233025 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
SPCS1-201ENST00000233025 TAPT1Q6NXT6 567 aa19.77■□□□□ 0.76
SPCS1-201ENST00000233025 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP19.77■□□□□ 0.76
SPCS1-201ENST00000233025 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP19.77■□□□□ 0.76
SPCS1-201ENST00000233025 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa19.77■□□□□ 0.76
SPCS1-201ENST00000233025 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa19.76■□□□□ 0.75
SPCS1-201ENST00000233025 ASB14A6NK59 587 aa19.76■□□□□ 0.75
SPCS1-201ENST00000233025 IRS1P35568 1242 aa19.76■□□□□ 0.75
SPCS1-201ENST00000233025 PURAQ00577 322 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
SPCS1-201ENST00000233025 TCF15Q12870 199 aa19.76■□□□□ 0.75
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SPCS1-201ENST00000233025 ADHFE1Q8IWW8 467 aa19.76■□□□□ 0.75
SPCS1-201ENST00000233025 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
SPCS1-201ENST00000233025 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa19.75■□□□□ 0.75
SPCS1-201ENST00000233025 GFRA3O60609 400 aa19.75■□□□□ 0.75
SPCS1-201ENST00000233025 ZBED4O75132 1171 aa19.75■□□□□ 0.75
SPCS1-201ENST00000233025 GJB5O95377 273 aa19.75■□□□□ 0.75
SPCS1-201ENST00000233025 NDUFB10O96000 172 aa19.75■□□□□ 0.75
SPCS1-201ENST00000233025 OAZ1P54368 228 aa19.75■□□□□ 0.75
SPCS1-201ENST00000233025 COL19A1Q14993 1142 aa19.75■□□□□ 0.75
SPCS1-201ENST00000233025 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
SPCS1-201ENST00000233025 C12orf60Q5U649 245 aa19.75■□□□□ 0.75
SPCS1-201ENST00000233025 IQSEC1Q6DN90 963 aa19.75■□□□□ 0.75
SPCS1-201ENST00000233025 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
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