RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000211687.1

Sorcs1-208, Transcript of VPS10 domain-containing receptor SorCS1, mouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sorcs1, Length 7,080 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Apol11a	E9PZG0	334 aa		11.19	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Rad51b	O35719	350 aa		11.19	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Ccdc57	Q6PHN1	1016 aa		11.19	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Tekt2	Q922G7	430 aa		11.19	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Tnni1	Q9WUZ5	187 aa		11.19	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Btnl4	A2CG29	586 aa		11.18	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Ncapg	E9PWG6	1004 aa		11.18	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Ube4a	E9Q735	1028 aa		11.18	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Cyp2e1	Q05421	493 aa		11.18	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Lrrc41	Q8K1C9	807 aa		11.18	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Ubxn1	Q922Y1	297 aa		11.18	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Taf4	E9QAP7	1042 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Pou5f1	P20263	352 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Sin3b	Q62141	1098 aa		11.18	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Polrmt	Q8BKF1	1207 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Cfap36	Q8C6E0	343 aa		11.18	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Pspc1	Q8R326	523 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Lpxn	Q99N69	386 aa		11.18	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Rcan3	Q9JKK0	239 aa		11.18	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Zkscan16	A2ALW2	728 aa		11.18	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	2610008E11Rik	G3X964	669 aa		11.18	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Atp2a2	O55143	1044 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Sstr3	P30935	428 aa		11.18	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Smad1	P70340	465 aa		11.18	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687		Q3TTJ4	293 aa		11.18	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Kat14	Q8CID0	779 aa		11.18	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Trim68	Q8K243	485 aa		11.18	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Taf1d	Q9D4V4	322 aa		11.18	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Gm16486	A0A1D5RMD1	1434 aa		11.18	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687		A0A1W2P6Q8	802 aa		11.18	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Gm9048	A0A1W2P7H4	802 aa		11.18	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687		A0A1W2P7Z8	802 aa		11.18	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Gm9046	A0A1W2P855	802 aa		11.18	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Esr2	O08537	530 aa		11.18	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Alppl2	P24823	529 aa		11.18	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Sesn2	P58043	480 aa		11.18	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Gse1	Q3U3C9	1213 aa		11.18	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Szrd1	Q6NXN1	152 aa		11.18	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Rpf1	Q7TND5	349 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Phf20	Q8BLG0	1010 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Terb1	Q8C0V1	768 aa		11.18	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Fam160b1	Q8CDM8	764 aa		11.18	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Akap8	Q9DBR0	687 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Cnbd1	B1AWM0	430 aa		11.18	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	P2rx5	Q3UYI1	455 aa		11.18	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Smc5	Q8CG46	1101 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	1700003F12Rik	A2AKE5	210 aa		11.17	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Lsp1	P19973	330 aa		11.17	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Hmgb1	P63158	215 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Dennd1b	Q3U1T9	766 aa		11.17	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Gbp7	Q91Z40	638 aa		11.17	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Llph	Q9D945	130 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Kcnh3	Q9WVJ0	1095 aa		11.17	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Iqsec2	Q5DU25	1478 aa		11.17	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	P4hb	P09103	509 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Atp11b	Q6DFW5	1175 aa		11.17	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Usp50	Q6P8X6	390 aa		11.17	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Ppp1r14c	Q8R4S0	164 aa		11.17	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Cep83	Q9D5R3	692 aa		11.17	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Mug2	P28666	1451 aa		11.17	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Camk4	P08414	469 aa		11.17	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Lamc2	Q61092	1191 aa		11.17	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Prpf40b	Q80W14	870 aa		11.17	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Ccny	Q8BGU5	341 aa		11.17	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Apol10a	Q8CCA5	318 aa		11.17	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Olfr390	Q8VEZ7	311 aa		11.17	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Hgs	Q99LI8	775 aa		11.17	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Abcg3	Q99P81	650 aa		11.17	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Ccdc97	Q9DBT3	340 aa		11.17	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Lztfl1	Q9JHQ5	299 aa		11.17	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Ncapd2	Q8K2Z4	1392 aa		11.17	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Arhgef26	D3YYY8	869 aa		11.17	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Slc12a2	P55012	1205 aa		11.17	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Entpd7	Q3TCT4	606 aa		11.17	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Scfd1	Q8BRF7	639 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Ephb1	Q8CBF3	984 aa		11.17	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Plcd1	Q8R3B1	756 aa		11.17	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Sdf4	Q61112	361 aa		11.17	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Pank4	Q80YV4	820 aa		11.17	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Tmem39b	Q810L4	492 aa		11.17	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Ano10	Q8BH79	659 aa		11.17	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Kcns3	Q8BQZ8	491 aa		11.17	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Apbb1ip	Q8R5A3	670 aa		11.17	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Cfap57	Q9D180	1249 aa		11.17	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Flii	Q9JJ28	1271 aa		11.17	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Kif14	L0N7N1	1674 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Akap12	Q9WTQ5	1684 aa		11.17	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Scaf11	E9PZM7	1456 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Pak1	O88643	545 aa		11.17	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Atoh1	P48985	351 aa		11.17	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Acap2	Q6ZQK5	770 aa		11.17	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Asap2	Q7SIG6	958 aa		11.17	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Klhl20	Q8VCK5	604 aa		11.17	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Cenpk	Q9ESN5	271 aa		11.17	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Spata31	E9QAF0	1014 aa		11.16	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Psmc5	P62196	406 aa		11.16	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Fmnl3	Q6ZPF4	1028 aa		11.16	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Bicdl2	Q8CHW5	507 aa		11.16	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Ndufa8	Q9DCJ5	172 aa		11.16	□□□□□ -0.62
Sorcs1-208	ENSMUST00000211687	Arhgap4	B1AUY3	965 aa		11.16	□□□□□ -0.62

Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 53.3 ms