RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dlg1Q811D0 905 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.13
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hirip3Q8BLH7 601 aa14.21□□□□□ -0.13
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zc3h6Q8BYK8 1177 aa14.21□□□□□ -0.13
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Adssl1P28650 457 aa14.19□□□□□ -0.14
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cap1P40124 474 aa14.19□□□□□ -0.14
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gdf10P97737 476 aa14.19□□□□□ -0.14
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rhpn1Q61085 643 aa14.19□□□□□ -0.14
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tor1aip2Q8BYU6 502 aa14.19□□□□□ -0.14
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prc1Q99K43 603 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MicalclQ9D5U9 680 aa14.19□□□□□ -0.14
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SelenooQ9DBC0 667 aa14.19□□□□□ -0.14
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pde4aO89084 844 aa14.19□□□□□ -0.14
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nr5a1P33242 462 aa14.18□□□□□ -0.14
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GmpsQ3THK7 693 aa14.18□□□□□ -0.14
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lgr6Q3UVD5 967 aa14.18□□□□□ -0.14
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tom1l2Q5SRX1 507 aa14.18□□□□□ -0.14
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hexim1Q8R409 356 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Glt1d1A4FUP9 346 aa14.17□□□□□ -0.14
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Acad12D3Z7X0 555 aa14.17□□□□□ -0.14
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 IkbkbO88351 757 aa14.17□□□□□ -0.14
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ms4a5Q810P8 197 aa14.17□□□□□ -0.14
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm5114W4VSN8 858 aa14.17□□□□□ -0.14
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Znf697Q569E7 569 aa14.17□□□□□ -0.14
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PRAG1Q571I4 1179 aa14.17□□□□□ -0.14
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ctnna3Q65CL1 895 aa14.17□□□□□ -0.14
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Senp6Q6P7W0 1132 aa14.17□□□□□ -0.14
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Armc6Q8BNU0 468 aa14.17□□□□□ -0.14
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kiaa1024Q8K3V7 917 aa14.17□□□□□ -0.14
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dact1Q8R4A3 778 aa14.17□□□□□ -0.14
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Inpp4aQ9EPW0 939 aa14.17□□□□□ -0.14
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem191cQ9JJB1 302 aa14.17□□□□□ -0.14
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pdcd6ipQ9WU78 869 aaKnown RBP14.17□□□□□ -0.14
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Traf1P39428 409 aa14.16□□□□□ -0.14
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ift88Q61371 824 aa14.16□□□□□ -0.14
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