RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615579.1

TTC28-AS1_3.1-201, humanhuman

BASIC

Gene TTC28-AS1_3, Length 181 nt, Biotype misc RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa16.85■□□□□ 0.29
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TXNRD2Q9NNW7 524 aa16.85■□□□□ 0.29
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RNF186Q9NXI6 227 aa16.85■□□□□ 0.29
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HOXC10Q9NYD6 342 aa16.85■□□□□ 0.29
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MYPNQ86TC9 1320 aa16.85■□□□□ 0.29
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PLA2G6O60733 806 aa16.84■□□□□ 0.29
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TMEM132BQ14DG7 1078 aa16.84■□□□□ 0.29
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa16.84■□□□□ 0.29
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TRIM22Q8IYM9 498 aa16.84■□□□□ 0.29
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa16.84■□□□□ 0.29
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SNX21Q969T3 373 aa16.84■□□□□ 0.29
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 AGBL1Q96MI9 1066 aa16.84■□□□□ 0.29
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RIOX1Q9H6W3 641 aa16.84■□□□□ 0.29
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa16.84■□□□□ 0.29
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CCPG1Q9ULG6 757 aa16.84■□□□□ 0.29
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 V9GY48 417 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PLXNB2O15031 1838 aa16.84■□□□□ 0.29
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CA12O43570 354 aa16.83■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CNMDO75829 334 aa16.83■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CTDNEP1O95476 244 aa16.83■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ALAS1P13196 640 aa16.83■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 IFNAR1P17181 557 aa16.83■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FUT2Q10981 343 aa16.83■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PPP2R5BQ15173 497 aa16.83■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NTRK3Q16288 839 aa16.83■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 POTEEQ6S8J3 1075 aa16.83■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ADGRA2Q96PE1 1338 aa16.83■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SMCHD1A6NHR9 2005 aa16.82■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZBTB5O15062 677 aa16.82■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TLR2O60603 784 aa16.82■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ERVK-9P63128 1117 aa16.82■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ERVK-24P63145 666 aa16.82■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 BECN1Q14457 450 aa16.82■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LBX2Q6XYB7 198 aa16.82■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NCAPG2Q86XI2 1143 aa16.82■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FBXO11Q86XK2 927 aa16.82■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 IL27Q8NEV9 243 aa16.82■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 REPS2Q8NFH8 660 aa16.82■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 COA7Q96BR5 231 aa16.82■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 AIFM3Q96NN9 605 aa16.82■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RBPJLQ9UBG7 517 aa16.82■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa16.82■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MGAMO43451 1857 aa16.82■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZNF536O15090 1300 aa16.81■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa16.81■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MB21D1Q8N884 522 aa16.81■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa16.81■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TEX13BQ9BXU2 312 aa16.81■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SPATC1LQ9H0A9 340 aa16.81■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PCNTO95613 3336 aa16.81■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ICAM1P05362 532 aa16.8■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 STAT3P40763 770 aa16.8■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NAPAP54920 295 aa16.8■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 Q3C1V9 767 aa16.8■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 WWC2Q6AWC2 1192 aa16.8■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FAM184AQ8NB25 1140 aa16.8■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 AMNQ9BXJ7 453 aa16.8■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 EFCC1Q9HA90 598 aa16.8■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RNF146Q9NTX7 359 aa16.8■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa16.8■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SMC3Q9UQE7 1217 aa16.8■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RIPK3Q9Y572 518 aa16.8■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 STK36Q9NRP7 1315 aa16.79■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DEXIO95424 95 aa16.79■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FDX1P10109 184 aa16.79■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SCG2P13521 617 aa16.79■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GJB2P29033 226 aa16.79■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FAM110CQ1W6H9 321 aa16.79■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MTMR8Q96EF0 704 aa16.79■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PORCNQ9H237 461 aa16.79■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 VPS54Q9P1Q0 977 aa16.79■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa16.79■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 BCRP11274 1271 aa16.78■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ERCC3P19447 782 aa16.78■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SMARCA1P28370 1054 aa16.78■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 OAZ1P54368 228 aa16.78■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GUCY1B3Q02153 619 aa16.78■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CUL4AQ13619 759 aa16.78■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PKN1Q16512 942 aa16.78■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms