RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-222ENST00000592408 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 LEMD3Q9Y2U8 911 aa10.49□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 TACC3Q9Y6A5 838 aa10.49□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 COL4A1P02462 1669 aa10.49□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 ROBO3Q96MS0 1386 aa10.49□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa10.49□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 LY75O60449 1722 aa10.48□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 TSPY2A6NKD2 308 aa10.48□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 GUCY1A2P33402 732 aa10.48□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 RBM10P98175 930 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 NCAPHQ15003 741 aa10.48□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 CFAP100Q494V2 611 aa10.48□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 NT5DC1Q5TFE4 455 aa10.48□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 FCHSD1Q86WN1 690 aa10.48□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 SPIRE2Q8WWL2 714 aa10.48□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 CLIC6Q96NY7 704 aa10.48□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 KAT14Q9H8E8 782 aa10.48□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 SH3GLB2Q9NR46 395 aa10.48□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 XDHP47989 1333 aa10.48□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa10.48□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 MYH6P13533 1939 aa10.47□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa10.47□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 USP17L12C9JPN9 530 aa10.47□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 USP17L21D6R901 530 aa10.47□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 CTIFO43310 598 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 LDHBP07195 334 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 FDX1P10109 184 aa10.47□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 TOP1P11387 765 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 SCG2P13521 617 aa10.47□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 RFC4P35249 363 aa10.47□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 TXLNAP40222 546 aa10.47□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 USP5P45974 858 aa10.47□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 PLCD1P51178 756 aa10.47□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 UBASH3AP57075 661 aa10.47□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 TROAPQ12815 778 aa10.47□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 NR5A1Q13285 461 aa10.47□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 GRAPQ13588 217 aa10.47□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 LONRF3Q496Y0 759 aa10.47□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 TTC38Q5R3I4 469 aa10.47□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 CNBD1Q8NA66 436 aa10.47□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 CCDC148Q8NFR7 591 aa10.47□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 KIF18AQ8NI77 898 aa10.47□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 CABP5Q9NP86 173 aa10.47□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 VPS54Q9P1Q0 977 aa10.47□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 MAN1B1Q9UKM7 699 aa10.47□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa10.47□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 NAV1Q8NEY1 1877 aa10.47□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 A0A087WWV3 80 aa10.46□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 PLEKHA8P1O95397 391 aa10.46□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 MORC3Q14149 939 aa10.46□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 GALNT17Q6IS24 598 aa10.46□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 DGKHQ86XP1 1220 aa10.46□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 VSTM4Q8IW00 320 aa10.46□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 LZTS2Q9BRK4 669 aa10.46□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 CSRNP2Q9H175 543 aa10.46□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa10.46□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa10.46□□□□□ -0.73
EFTUD2-222ENST00000592408 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.74
EFTUD2-222ENST00000592408 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa10.45□□□□□ -0.74
EFTUD2-222ENST00000592408 MOXD2PA6NHM9 499 aa10.45□□□□□ -0.74
EFTUD2-222ENST00000592408 ZSCAN12O43309 604 aa10.45□□□□□ -0.74
EFTUD2-222ENST00000592408 PRDM1O75626 825 aa10.45□□□□□ -0.74
EFTUD2-222ENST00000592408 SLFN14P0C7P3 912 aa10.45□□□□□ -0.74
EFTUD2-222ENST00000592408 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
EFTUD2-222ENST00000592408 NLRP5P59047 1200 aa10.45□□□□□ -0.74
EFTUD2-222ENST00000592408 ST5P78524 1137 aa10.45□□□□□ -0.74
EFTUD2-222ENST00000592408 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
EFTUD2-222ENST00000592408 PKN1Q16512 942 aa10.45□□□□□ -0.74
EFTUD2-222ENST00000592408 TRAPPC3LQ5T215 181 aa10.45□□□□□ -0.74
EFTUD2-222ENST00000592408 LCE2CQ5TA81 110 aa10.45□□□□□ -0.74
EFTUD2-222ENST00000592408 RETREG3Q86VR2 466 aa10.45□□□□□ -0.74
EFTUD2-222ENST00000592408 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
EFTUD2-222ENST00000592408 ANKS1AQ92625 1134 aa10.45□□□□□ -0.74
EFTUD2-222ENST00000592408 GSDMAQ96QA5 445 aa10.45□□□□□ -0.74
EFTUD2-222ENST00000592408 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa10.45□□□□□ -0.74
EFTUD2-222ENST00000592408 RMND1Q9NWS8 449 aa10.45□□□□□ -0.74
EFTUD2-222ENST00000592408 MCM9Q9NXL9 1143 aa10.45□□□□□ -0.74
EFTUD2-222ENST00000592408 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa10.45□□□□□ -0.74
EFTUD2-222ENST00000592408 SERTAD1Q9UHV2 236 aa10.45□□□□□ -0.74
EFTUD2-222ENST00000592408 TAF1LQ8IZX4 1826 aa10.44□□□□□ -0.74
EFTUD2-222ENST00000592408 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa10.44□□□□□ -0.74
EFTUD2-222ENST00000592408 UBE2Q2LH0YL09 131 aa10.44□□□□□ -0.74
EFTUD2-222ENST00000592408 ATP2B1P20020 1258 aa10.44□□□□□ -0.74
EFTUD2-222ENST00000592408 ATP2B4P23634 1241 aa10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms