RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 PHIPQ8WWQ0 1821 aa7.06□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa7.06□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC69A6NI79 296 aa7.06□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 GOLGA8AA7E2F4 631 aa7.06□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 JAK2O60674 1132 aa7.06□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 PLEKHA8P1O95397 391 aa7.06□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 CDC27P30260 824 aa7.06□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 SNAP25P60880 206 aa7.06□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 FOXK2Q01167 660 aa7.06□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 MAP3K10Q02779 954 aa7.06□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 ICA1Q05084 483 aa7.06□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 SCRN1Q12765 414 aa7.06□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 VGLL4Q14135 290 aa7.06□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC35G1Q2M3R5 365 aa7.06□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 CST9Q5W186 159 aa7.06□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 DCAF15Q66K64 600 aa7.06□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 TTBK2Q6IQ55 1244 aa7.06□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 APOA5Q6Q788 366 aa7.06□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 HSCBQ8IWL3 235 aa7.06□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF654Q8IZM8 581 aa7.06□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 SPICE1Q8N0Z3 855 aa7.06□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 STAG2Q8N3U4 1231 aa7.06□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC82Q8N4S0 544 aa7.06□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM87BQ96K49 555 aa7.06□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 CABP5Q9NP86 173 aa7.06□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 GPCPD1Q9NPB8 672 aa7.06□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 MTMR4Q9NYA4 1195 aa7.06□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF112Q9UJU3 913 aa7.06□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 WASF2Q9Y6W5 498 aa7.06□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 ERICH2A1L162 156 aa7.05□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 USP17L5A8MUK1 530 aa7.05□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 CTDNEP1O95476 244 aa7.05□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 PCP11498 1178 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 NF2P35240 595 aa7.05□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 ADD1P35611 737 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC16A2P36021 539 aa7.05□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 GJA5P36382 358 aa7.05□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 GSK3AP49840 483 aa7.05□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa7.05□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 USP17L2Q6R6M4 530 aa7.05□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM179Q6ZVK1 233 aa7.05□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 KCTD1Q719H9 257 aa7.05□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 TRIM46Q7Z4K8 759 aa7.05□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 NBPF11Q86T75 865 aa7.05□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 IQCA1Q86XH1 822 aa7.05□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 SCYL3Q8IZE3 742 aa7.05□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 PNMA1Q8ND90 353 aa7.05□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP7.05□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 SNX21Q969T3 373 aa7.05□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 DDX11Q96FC9 970 aa7.05□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC17Q96LX7 622 aa7.05□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 AGXT2Q9BYV1 514 aa7.05□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 KAT14Q9H8E8 782 aa7.05□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF287Q9HBT7 754 aa7.05□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 PRDM9Q9NQV7 894 aa7.05□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa7.05□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa7.05□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 ZHX2Q9Y6X8 837 aa7.05□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 PLIN4Q96Q06 1357 aa7.05□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 TRPM7Q96QT4 1865 aa7.04□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 WDR19Q8NEZ3 1342 aa7.04□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 TRIM75PA6NK02 468 aa7.04□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 ZBTB43O43298 467 aa7.04□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 PEX10O60683 326 aa7.04□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 TTLL1O95922 423 aa7.04□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 TOP1P11387 765 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 PTPRAP18433 802 aa7.04□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 VEGFBP49765 207 aa7.04□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 HTRA3P83110 453 aa7.04□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 SPP2Q13103 211 aa7.04□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 GRM1Q13255 1194 aa7.04□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 MTMR2Q13614 643 aa7.04□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC96Q2M329 555 aa7.04□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 SLFN13Q68D06 897 aa7.04□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 SGMS1Q86VZ5 419 aa7.04□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 ANKS1AQ92625 1134 aa7.04□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 PHKBQ93100 1093 aa7.04□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 GTF3C6Q969F1 213 aa7.04□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 AIFM3Q96NN9 605 aa7.04□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 FEZ1Q99689 392 aa7.04□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 UBA5Q9GZZ9 404 aa7.04□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 KANSL2Q9H9L4 492 aa7.04□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 GJB4Q9NTQ9 266 aa7.04□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC12A7Q9Y666 1083 aa7.04□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 F5H6K3 240 aa7.03□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 PFKFB2O60825 505 aa7.03□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 DXOO77932 396 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
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