RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584328.1

NF1-223, Transcript of neurofibromin 1, human

TSL 2

Gene NF1, Length 566 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NF1-223	ENST00000584328	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		7.57	□□□□□ -1.2
NF1-223	ENST00000584328	CCDC120	Q96HB5	630 aa		7.57	□□□□□ -1.2
NF1-223	ENST00000584328	FERD3L	Q96RJ6	166 aa		7.57	□□□□□ -1.2
NF1-223	ENST00000584328	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	7.57	□□□□□ -1.2
NF1-223	ENST00000584328	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		7.57	□□□□□ -1.2
NF1-223	ENST00000584328	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		7.57	□□□□□ -1.2
NF1-223	ENST00000584328	UNC13B	O14795	1591 aa		7.56	□□□□□ -1.2
NF1-223	ENST00000584328	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		7.56	□□□□□ -1.2
NF1-223	ENST00000584328	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		7.56	□□□□□ -1.2
NF1-223	ENST00000584328	TNFRSF10C	O14798	259 aa		7.56	□□□□□ -1.2
NF1-223	ENST00000584328	IMPDH2	P12268	514 aa		7.56	□□□□□ -1.2
NF1-223	ENST00000584328	AFM	P43652	599 aa		7.56	□□□□□ -1.2
NF1-223	ENST00000584328	PAK2	Q13177	524 aa		7.56	□□□□□ -1.2
NF1-223	ENST00000584328	RALGPS1	Q5JS13	557 aa		7.56	□□□□□ -1.2
NF1-223	ENST00000584328	FBXW10	Q5XX13	1052 aa		7.56	□□□□□ -1.2
NF1-223	ENST00000584328	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		7.56	□□□□□ -1.2
NF1-223	ENST00000584328	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	7.56	□□□□□ -1.2
NF1-223	ENST00000584328	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		7.56	□□□□□ -1.2
NF1-223	ENST00000584328	ABCC3	O15438	1527 aa		7.56	□□□□□ -1.2
NF1-223	ENST00000584328	PTPRM	P28827	1452 aa		7.55	□□□□□ -1.2
NF1-223	ENST00000584328	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		7.55	□□□□□ -1.2
NF1-223	ENST00000584328	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
NF1-223	ENST00000584328	KCNMB1	Q16558	191 aa		7.55	□□□□□ -1.2
NF1-223	ENST00000584328	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		7.55	□□□□□ -1.2
NF1-223	ENST00000584328	FYB2	Q5VWT5	728 aa		7.55	□□□□□ -1.2
NF1-223	ENST00000584328	TTC6	Q86TZ1	520 aa		7.55	□□□□□ -1.2
NF1-223	ENST00000584328	TMEM192	Q8IY95	271 aa		7.55	□□□□□ -1.2
NF1-223	ENST00000584328	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
NF1-223	ENST00000584328	SLC9A7	Q96T83	725 aa		7.55	□□□□□ -1.2
NF1-223	ENST00000584328	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		7.55	□□□□□ -1.2
NF1-223	ENST00000584328	TMEM59L	Q9UK28	342 aa		7.55	□□□□□ -1.2
NF1-223	ENST00000584328	PPT2	Q9UMR5	302 aa		7.55	□□□□□ -1.2
NF1-223	ENST00000584328	EPB41L3	Q9Y2J2	1087 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
NF1-223	ENST00000584328	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		7.55	□□□□□ -1.2
NF1-223	ENST00000584328	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
NF1-223	ENST00000584328	FAM86C2P	A6NEL3	165 aa		7.54	□□□□□ -1.2
NF1-223	ENST00000584328	KIF3B	O15066	747 aa		7.54	□□□□□ -1.2
NF1-223	ENST00000584328	HK2	P52789	917 aa		7.54	□□□□□ -1.2
NF1-223	ENST00000584328	OGFOD2	Q6N063	350 aa		7.54	□□□□□ -1.2
NF1-223	ENST00000584328	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
NF1-223	ENST00000584328	KIRREL1	Q96J84	757 aa		7.54	□□□□□ -1.2
NF1-223	ENST00000584328	SLC6A18	Q96N87	628 aa		7.54	□□□□□ -1.2
NF1-223	ENST00000584328	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		7.54	□□□□□ -1.2
NF1-223	ENST00000584328	MROH2A	A6NES4	1674 aa		7.54	□□□□□ -1.2
NF1-223	ENST00000584328	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
NF1-223	ENST00000584328	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
NF1-223	ENST00000584328	TMC3	Q7Z5M5	1100 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NF1-223	ENST00000584328	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
NF1-223	ENST00000584328	MKRN2	Q9H000	416 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
NF1-223	ENST00000584328	GINM1	Q9NU53	330 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NF1-223	ENST00000584328	PZP	P20742	1482 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NF1-223	ENST00000584328	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.2
NF1-223	ENST00000584328	ZMYM3	Q14202	1370 aa		7.52	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	ACR	P10323	421 aa		7.52	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	RAC2	P15153	192 aa		7.52	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	GPRASP2	Q96D09	838 aa		7.52	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	SPATA32	Q96LK8	384 aa		7.52	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	HDAC8	Q9BY41	377 aa		7.52	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		7.52	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		7.52	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		7.52	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	NPAT	Q14207	1427 aa		7.52	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	COL9A2	Q14055	689 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	GGT6	Q6P531	493 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	CCDC81	Q6ZN84	652 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	DHRS1	Q96LJ7	313 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	TM9SF2	Q99805	663 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	PRDM14	Q9GZV8	571 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	ZNF503-AS2	A6NEH8	195 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	GLI1	P08151	1106 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	ZGLP1	P0C6A0	271 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	SOX9	P48436	509 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	ERVFC1	P60507	584 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	TEK	Q02763	1124 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	TAB3	Q8N5C8	712 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	ZNF655	Q8N720	491 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	TCTN2	Q96GX1	697 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	SUCO	Q9UBS9	1254 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	NOS1	P29475	1434 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	C3	P01024	1663 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	SIGLEC6	O43699	453 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NF1-223	ENST00000584328	PRAMEF1	O95521	474 aa		7.49	□□□□□ -1.21

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