RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572172.5

GPS2-208, Transcript of G protein pathway suppressor 2, human

TSL 5

Gene GPS2, Length 1,534 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS2-208	ENST00000572172	AMN	Q9BXJ7	453 aa		28.96	■■■□□ 2.23
GPS2-208	ENST00000572172	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	28.96	■■■□□ 2.23
GPS2-208	ENST00000572172	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		28.96	■■■□□ 2.23
GPS2-208	ENST00000572172	PNMA2	Q9UL42	364 aa		28.96	■■■□□ 2.23
GPS2-208	ENST00000572172	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	28.96	■■■□□ 2.23
GPS2-208	ENST00000572172	BTBD19	C9JJ37	291 aa		28.95	■■■□□ 2.23
GPS2-208	ENST00000572172		H3BQV1	296 aa		28.95	■■■□□ 2.23
GPS2-208	ENST00000572172	VWA5A	O00534	786 aa		28.95	■■■□□ 2.23
GPS2-208	ENST00000572172	SNAP25	P60880	206 aa		28.95	■■■□□ 2.23
GPS2-208	ENST00000572172	IFFO2	Q5TF58	517 aa		28.95	■■■□□ 2.23
GPS2-208	ENST00000572172	FBXO11	Q86XK2	927 aa		28.95	■■■□□ 2.23
GPS2-208	ENST00000572172	ATG4C	Q96DT6	458 aa		28.95	■■■□□ 2.23
GPS2-208	ENST00000572172	BARHL2	Q9NY43	387 aa		28.95	■■■□□ 2.23
GPS2-208	ENST00000572172	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		28.95	■■■□□ 2.23
GPS2-208	ENST00000572172	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		28.94	■■■□□ 2.22
GPS2-208	ENST00000572172	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	28.94	■■■□□ 2.22
GPS2-208	ENST00000572172	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	28.94	■■■□□ 2.22
GPS2-208	ENST00000572172	PDHX	O00330	501 aa		28.94	■■■□□ 2.22
GPS2-208	ENST00000572172	STX6	O43752	255 aa		28.94	■■■□□ 2.22
GPS2-208	ENST00000572172	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		28.94	■■■□□ 2.22
GPS2-208	ENST00000572172	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		28.94	■■■□□ 2.22
GPS2-208	ENST00000572172	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	28.93	■■■□□ 2.22
GPS2-208	ENST00000572172	NUCB2	P80303	420 aa		28.93	■■■□□ 2.22
GPS2-208	ENST00000572172	SREBF2	Q12772	1141 aa		28.93	■■■□□ 2.22
GPS2-208	ENST00000572172	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		28.93	■■■□□ 2.22
GPS2-208	ENST00000572172	CCDC174	Q6PII3	467 aa		28.93	■■■□□ 2.22
GPS2-208	ENST00000572172	MB21D1	Q8N884	522 aa		28.93	■■■□□ 2.22
GPS2-208	ENST00000572172	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		28.93	■■■□□ 2.22
GPS2-208	ENST00000572172	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	28.93	■■■□□ 2.22
GPS2-208	ENST00000572172	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		28.93	■■■□□ 2.22
GPS2-208	ENST00000572172	FOSB	P53539	338 aa		28.92	■■■□□ 2.22
GPS2-208	ENST00000572172	NOG	Q13253	232 aa		28.92	■■■□□ 2.22
GPS2-208	ENST00000572172	LBX2	Q6XYB7	198 aa		28.92	■■■□□ 2.22
GPS2-208	ENST00000572172	PTPN18	Q99952	460 aa		28.92	■■■□□ 2.22
GPS2-208	ENST00000572172	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	28.92	■■■□□ 2.22
GPS2-208	ENST00000572172	STXBP3	O00186	592 aa		28.91	■■■□□ 2.22
GPS2-208	ENST00000572172	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	28.91	■■■□□ 2.22
GPS2-208	ENST00000572172	ICAM1	P05362	532 aa		28.91	■■■□□ 2.22
GPS2-208	ENST00000572172	OAZ1	P54368	228 aa		28.91	■■■□□ 2.22
GPS2-208	ENST00000572172	NAPA	P54920	295 aa		28.91	■■■□□ 2.22
GPS2-208	ENST00000572172	HERVK_113	P62684	666 aa		28.91	■■■□□ 2.22
GPS2-208	ENST00000572172	GRM1	Q13255	1194 aa		28.91	■■■□□ 2.22
GPS2-208	ENST00000572172	KRT40	Q6A162	431 aa		28.91	■■■□□ 2.22
GPS2-208	ENST00000572172	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		28.91	■■■□□ 2.22
GPS2-208	ENST00000572172	COA7	Q96BR5	231 aa		28.91	■■■□□ 2.22
GPS2-208	ENST00000572172	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		28.91	■■■□□ 2.22
GPS2-208	ENST00000572172	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		28.9	■■■□□ 2.22
GPS2-208	ENST00000572172	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	28.9	■■■□□ 2.22
GPS2-208	ENST00000572172	CAPNS2	Q96L46	248 aa		28.9	■■■□□ 2.22
GPS2-208	ENST00000572172	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		28.9	■■■□□ 2.22
GPS2-208	ENST00000572172	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	28.9	■■■□□ 2.22
GPS2-208	ENST00000572172	MYH6	P13533	1939 aa		28.9	■■■□□ 2.22
GPS2-208	ENST00000572172	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	28.89	■■■□□ 2.22
GPS2-208	ENST00000572172	CALML3	P27482	149 aa		28.89	■■■□□ 2.22
GPS2-208	ENST00000572172	NLRP5	P59047	1200 aa		28.89	■■■□□ 2.22
GPS2-208	ENST00000572172	GUCY1B3	Q02153	619 aa		28.89	■■■□□ 2.22
GPS2-208	ENST00000572172	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	28.89	■■■□□ 2.22
GPS2-208	ENST00000572172	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		28.89	■■■□□ 2.22
GPS2-208	ENST00000572172	CPXCR1	Q8N123	301 aa		28.89	■■■□□ 2.22
GPS2-208	ENST00000572172	ATP2A1	O14983	1001 aa		28.89	■■■□□ 2.21
GPS2-208	ENST00000572172	GALNT17	Q6IS24	598 aa		28.89	■■■□□ 2.21
GPS2-208	ENST00000572172	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	28.89	■■■□□ 2.21
GPS2-208	ENST00000572172	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		28.89	■■■□□ 2.21
GPS2-208	ENST00000572172	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	28.89	■■■□□ 2.21
GPS2-208	ENST00000572172	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		28.89	■■■□□ 2.21
GPS2-208	ENST00000572172	ZNF536	O15090	1300 aa		28.88	■■■□□ 2.21
GPS2-208	ENST00000572172	TM4SF4	P48230	202 aa		28.88	■■■□□ 2.21
GPS2-208	ENST00000572172	C1QTNF8	P60827	252 aa		28.88	■■■□□ 2.21
GPS2-208	ENST00000572172	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	28.88	■■■□□ 2.21
GPS2-208	ENST00000572172	USH1G	Q495M9	461 aa		28.88	■■■□□ 2.21
GPS2-208	ENST00000572172	REPS2	Q8NFH8	660 aa		28.88	■■■□□ 2.21
GPS2-208	ENST00000572172	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	28.88	■■■□□ 2.21
GPS2-208	ENST00000572172	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	28.88	■■■□□ 2.21
GPS2-208	ENST00000572172	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		28.88	■■■□□ 2.21
GPS2-208	ENST00000572172	MTMR6	Q9Y217	621 aa		28.88	■■■□□ 2.21
GPS2-208	ENST00000572172	MMP1	P03956	469 aa		28.87	■■■□□ 2.21
GPS2-208	ENST00000572172	GNA11	P29992	359 aa		28.87	■■■□□ 2.21
GPS2-208	ENST00000572172	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		28.87	■■■□□ 2.21
GPS2-208	ENST00000572172	IFNL1	Q8IU54	200 aa		28.87	■■■□□ 2.21
GPS2-208	ENST00000572172	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		28.87	■■■□□ 2.21
GPS2-208	ENST00000572172	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		28.87	■■■□□ 2.21
GPS2-208	ENST00000572172	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		28.87	■■■□□ 2.21
GPS2-208	ENST00000572172	C6orf50	Q9HD87	102 aa		28.87	■■■□□ 2.21
GPS2-208	ENST00000572172	MRPL11	Q9Y3B7	192 aa	Known RBP	28.87	■■■□□ 2.21
GPS2-208	ENST00000572172	ABCB11	O95342	1321 aa		28.87	■■■□□ 2.21
GPS2-208	ENST00000572172	ESYT2	A0FGR8	921 aa		28.86	■■■□□ 2.21
GPS2-208	ENST00000572172	SMCO2	A6NFE2	343 aa		28.86	■■■□□ 2.21
GPS2-208	ENST00000572172	CYP2C8	P10632	490 aa		28.86	■■■□□ 2.21
GPS2-208	ENST00000572172	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		28.86	■■■□□ 2.21
GPS2-208	ENST00000572172	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		28.86	■■■□□ 2.21
GPS2-208	ENST00000572172	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		28.86	■■■□□ 2.21
GPS2-208	ENST00000572172	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		28.86	■■■□□ 2.21
GPS2-208	ENST00000572172	RLF	Q13129	1914 aa		28.86	■■■□□ 2.21
GPS2-208	ENST00000572172	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	28.85	■■■□□ 2.21
GPS2-208	ENST00000572172	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	28.85	■■■□□ 2.21
GPS2-208	ENST00000572172	PKP1	Q13835	747 aa		28.85	■■■□□ 2.21
GPS2-208	ENST00000572172	SHISA4	Q96DD7	197 aa		28.85	■■■□□ 2.21
GPS2-208	ENST00000572172	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	28.85	■■■□□ 2.21
GPS2-208	ENST00000572172	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	28.84	■■■□□ 2.21
GPS2-208	ENST00000572172	BRD1	O95696	1058 aa		28.84	■■■□□ 2.21

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.9 ms