RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564966.5

PPP4C-208, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 2

Gene PPP4C, Length 1,122 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-208ENST00000564966 RNF146Q9NTX7 359 aa29.94■■■□□ 2.38
PPP4C-208ENST00000564966 TACC3Q9Y6A5 838 aa29.94■■■□□ 2.38
PPP4C-208ENST00000564966 SMCHD1A6NHR9 2005 aa29.94■■■□□ 2.38
PPP4C-208ENST00000564966 SZT2Q5T011 3432 aa29.94■■■□□ 2.38
PPP4C-208ENST00000564966 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa29.93■■■□□ 2.38
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PPP4C-208ENST00000564966 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
PPP4C-208ENST00000564966 RASGRP2Q7LDG7 609 aa29.93■■■□□ 2.38
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PPP4C-208ENST00000564966 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
PPP4C-208ENST00000564966 TICAM2Q86XR7 235 aa29.92■■■□□ 2.38
PPP4C-208ENST00000564966 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
PPP4C-208ENST00000564966 PHF24Q9UPV7 400 aa29.92■■■□□ 2.38
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PPP4C-208ENST00000564966 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
PPP4C-208ENST00000564966 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa29.91■■■□□ 2.38
PPP4C-208ENST00000564966 TRERF1Q96PN7 1200 aa29.91■■■□□ 2.38
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PPP4C-208ENST00000564966 DCAF4Q8WV16 495 aa29.9■■■□□ 2.38
PPP4C-208ENST00000564966 PRR12Q9ULL5 1215 aa29.9■■■□□ 2.38
PPP4C-208ENST00000564966 DNAH12Q6ZR08 3092 aa29.9■■■□□ 2.38
PPP4C-208ENST00000564966 TKFCQ3LXA3 575 aa29.89■■■□□ 2.38
PPP4C-208ENST00000564966 ARMCX2Q7L311 632 aa29.89■■■□□ 2.38
PPP4C-208ENST00000564966 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa29.89■■■□□ 2.38
PPP4C-208ENST00000564966 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa29.89■■■□□ 2.38
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PPP4C-208ENST00000564966 LRIT3Q3SXY7 679 aa29.88■■■□□ 2.37
PPP4C-208ENST00000564966 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
PPP4C-208ENST00000564966 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa29.88■■■□□ 2.37
PPP4C-208ENST00000564966 CCPG1Q9ULG6 757 aa29.88■■■□□ 2.37
PPP4C-208ENST00000564966 ZNF536O15090 1300 aa29.88■■■□□ 2.37
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PPP4C-208ENST00000564966 A0A1W2PQY0 241 aa29.87■■■□□ 2.37
PPP4C-208ENST00000564966 FGRP09769 529 aa29.87■■■□□ 2.37
PPP4C-208ENST00000564966 SLC16A2P36021 539 aa29.87■■■□□ 2.37
PPP4C-208ENST00000564966 TLE2Q04725 743 aa29.87■■■□□ 2.37
PPP4C-208ENST00000564966 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP29.87■■■□□ 2.37
PPP4C-208ENST00000564966 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP29.87■■■□□ 2.37
PPP4C-208ENST00000564966 TMEM47Q9BQJ4 181 aa29.87■■■□□ 2.37
PPP4C-208ENST00000564966 SPC25Q9HBM1 224 aa29.87■■■□□ 2.37
PPP4C-208ENST00000564966 GPCPD1Q9NPB8 672 aa29.87■■■□□ 2.37
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PPP4C-208ENST00000564966 ZMYM6O95789 1325 aa29.87■■■□□ 2.37
PPP4C-208ENST00000564966 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
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PPP4C-208ENST00000564966 SNX17Q15036 470 aa29.86■■■□□ 2.37
PPP4C-208ENST00000564966 CCDC144BQ3MJ40 725 aa29.86■■■□□ 2.37
PPP4C-208ENST00000564966 AKNAD1Q5T1N1 836 aa29.86■■■□□ 2.37
PPP4C-208ENST00000564966 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP29.86■■■□□ 2.37
PPP4C-208ENST00000564966 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
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PPP4C-208ENST00000564966 VTI1AQ96AJ9 217 aa29.85■■■□□ 2.37
PPP4C-208ENST00000564966 OSBPL3Q9H4L5 887 aa29.85■■■□□ 2.37
PPP4C-208ENST00000564966 STARD7Q9NQZ5 370 aa29.85■■■□□ 2.37
PPP4C-208ENST00000564966 PDLIM7Q9NR12 457 aa29.85■■■□□ 2.37
PPP4C-208ENST00000564966 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
PPP4C-208ENST00000564966 ZNF213O14771 459 aa29.84■■■□□ 2.37
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PPP4C-208ENST00000564966 SYDE2Q5VT97 1194 aa29.84■■■□□ 2.37
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PPP4C-208ENST00000564966 DEFB123Q8N688 67 aa29.84■■■□□ 2.37
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PPP4C-208ENST00000564966 HIP1O00291 1037 aa29.83■■■□□ 2.37
PPP4C-208ENST00000564966 MUM1L1Q5H9M0 696 aa29.83■■■□□ 2.37
PPP4C-208ENST00000564966 C1orf53Q5VUE5 145 aa29.83■■■□□ 2.37
PPP4C-208ENST00000564966 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa29.83■■■□□ 2.37
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PPP4C-208ENST00000564966 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa29.83■■■□□ 2.37
PPP4C-208ENST00000564966 MCM3APO60318 1980 aa29.83■■■□□ 2.37
PPP4C-208ENST00000564966 MOXD2PA6NHM9 499 aa29.82■■■□□ 2.36
PPP4C-208ENST00000564966 CLTBP09497 229 aa29.82■■■□□ 2.36
PPP4C-208ENST00000564966 PCP11498 1178 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
PPP4C-208ENST00000564966 Q7L0L9 218 aa29.82■■■□□ 2.36
PPP4C-208ENST00000564966 ESR2Q92731 530 aa29.82■■■□□ 2.36
PPP4C-208ENST00000564966 MYADML2A6NDP7 307 aa29.81■■■□□ 2.36
PPP4C-208ENST00000564966 ICAM1P05362 532 aa29.81■■■□□ 2.36
PPP4C-208ENST00000564966 NOVP48745 357 aa29.81■■■□□ 2.36
PPP4C-208ENST00000564966 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
PPP4C-208ENST00000564966 GLT1D1Q96MS3 346 aa29.81■■■□□ 2.36
PPP4C-208ENST00000564966 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa29.81■■■□□ 2.36
PPP4C-208ENST00000564966 TRIM43BA6NCK2 446 aa29.8■■■□□ 2.36
PPP4C-208ENST00000564966 SOWAHBA6NEL2 793 aa29.8■■■□□ 2.36
PPP4C-208ENST00000564966 GNASQ5JWF2 1037 aa29.8■■■□□ 2.36
PPP4C-208ENST00000564966 GPR153Q6NV75 609 aa29.8■■■□□ 2.36
PPP4C-208ENST00000564966 KLHDC9Q8NEP7 349 aa29.8■■■□□ 2.36
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