RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		20.7	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	20.7	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		20.7	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		20.7	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	20.7	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		20.7	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	20.7	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	STX8	Q9UNK0	236 aa		20.7	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	CYTH3	O43739	400 aa		20.69	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	COBL	O75128	1261 aa		20.69	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	PPP1R2	P41236	205 aa		20.69	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	20.69	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		20.69	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	DHTKD1	Q96HY7	919 aa	Predicted RBP	20.69	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		20.69	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		20.69	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		20.69	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	GNA11	P29992	359 aa		20.69	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	SMIM5	Q71RC9	77 aa		20.69	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	IRF2BP1	Q8IU81	584 aa		20.69	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	MB21D1	Q8N884	522 aa		20.69	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	OR8K1	Q8NGG5	319 aa		20.69	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	NAPG	Q99747	312 aa	Predicted RBP	20.69	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	TBC1D8	O95759	1140 aa		20.68	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	RASA1	P20936	1047 aa		20.68	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	SMARCA1	P28370	1054 aa		20.68	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	PIP4K2B	P78356	416 aa		20.68	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	20.68	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	WHAMMP3	Q1A5X7	153 aa		20.68	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	TAF3	Q5VWG9	929 aa		20.68	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		20.68	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		20.68	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	20.68	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		20.68	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	KLRF2	D3W0D1	207 aa		20.68	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	KLRC4	O43908	158 aa		20.68	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	20.68	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	20.68	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	TRIM47	Q96LD4	638 aa		20.68	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	C6orf50	Q9HD87	102 aa		20.68	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	BICDL2	A1A5D9	508 aa		20.67	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	TUBB	P07437	444 aa		20.67	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	PLCG2	P16885	1265 aa		20.67	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	DNM2	P50570	870 aa		20.67	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		20.67	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	VPS72	Q15906	364 aa		20.67	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		20.67	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	SLC35F6	Q8N357	371 aa		20.67	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	DNAJC7	Q99615	494 aa		20.67	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	20.67	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	20.67	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	OR52Z1	P0C646	297 aa		20.66	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	NAPA	P54920	295 aa		20.66	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	20.66	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		20.66	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	20.66	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		20.66	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	EPC1	Q9H2F5	836 aa		20.66	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	ST7	Q9NRC1	585 aa		20.66	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		20.66	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	PP2D1	A8MPX8	630 aa		20.66	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	RNF225	M0QZC1	329 aa	Predicted RBP	20.66	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	AMPD3	Q01432	767 aa		20.66	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		20.66	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	CABP7	Q86V35	215 aa		20.66	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	RETREG2	Q8NC44	543 aa		20.66	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		20.66	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		20.66	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	20.66	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	NUP58	Q9BVL2	599 aa		20.66	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559		A0A0U1RQJ8	604 aa		20.65	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	TRIM49B	A6NDI0	452 aa		20.65	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	NDUFA10	O95299	355 aa		20.65	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	ARHGAP25	P42331	645 aa		20.65	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	TTI2	Q6NXR4	508 aa		20.65	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		20.65	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	EYA3	Q99504	573 aa		20.65	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		20.65	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	20.65	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	20.65	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	TTC26	A0AVF1	554 aa		20.65	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	ERLIN1	O75477	346 aa		20.65	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	RFC4	P35249	363 aa		20.65	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	SOGA3	Q5TF21	947 aa		20.65	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		20.65	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	SLF2	Q8IX21	1173 aa		20.65	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		20.65	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		20.65	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	SBF2	Q86WG5	1849 aa		20.64	■□□□□ 0.9
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC66	A2RUB6	948 aa		20.64	■□□□□ 0.89
RRN3-205	ENST00000563559	NEK8	Q86SG6	692 aa		20.64	■□□□□ 0.89
RRN3-205	ENST00000563559	MSANTD4	Q8NCY6	345 aa		20.64	■□□□□ 0.89
RRN3-205	ENST00000563559	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		20.64	■□□□□ 0.89
RRN3-205	ENST00000563559	EXOC1	Q9NV70	894 aa		20.64	■□□□□ 0.89
RRN3-205	ENST00000563559	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	20.64	■□□□□ 0.89
RRN3-205	ENST00000563559	RAB21	Q9UL25	225 aa		20.64	■□□□□ 0.89
RRN3-205	ENST00000563559	FLT1	P17948	1338 aa		20.63	■□□□□ 0.89
RRN3-205	ENST00000563559	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		20.63	■□□□□ 0.89
RRN3-205	ENST00000563559	CTAGE15	A4D2H0	777 aa		20.63	■□□□□ 0.89
RRN3-205	ENST00000563559	SMCO2	A6NFE2	343 aa		20.63	■□□□□ 0.89

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