RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562199.1

CAPN3-211, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 5

Gene CAPN3, Length 385 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-211ENST00000562199 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 NLRP1Q9C000 1473 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 CCDC66A2RUB6 948 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 USP17L3A6NCW0 530 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 USP17L4A6NCW7 530 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 EML1O00423 815 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 EFSO43281 561 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 SNX2O60749 519 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 RHOBTB3O94955 611 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 EPB42P16452 691 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 GUCY2CP25092 1073 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 ZNF76P36508 570 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 PRPHP41219 470 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 CHRNA4P43681 627 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 EPHB1P54762 984 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 CLDN10P78369 228 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 SERINC3Q13530 473 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 KIF22Q14807 665 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 ARMC4Q5T2S8 1044 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 SAMD5Q5TGI4 173 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 ANO1Q5XXA6 986 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 FAAH2Q6GMR7 532 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 USP17L2Q6R6M4 530 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 USP17L1Q7RTZ2 530 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 TRIM50Q86XT4 487 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 RHPN1Q8TCX5 695 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 DCAF11Q8TEB1 546 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 TESK2Q96S53 571 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 NACA2Q9H009 215 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 IRAK4Q9NWZ3 460 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 ETAA1Q9NY74 926 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 SQORQ9Y6N5 450 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 ATP10BO94823 1461 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 A0A0B4J203 849 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 ALDH1L1O75891 902 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 SCGB1D2O95969 90 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 HARSP12081 509 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 IMPDH2P12268 514 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 ALAS2P22557 587 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 MAPK1P28482 360 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 CAP2P40123 477 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 KCNJ4P48050 445 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 MASP1P48740 699 aa6.29□□□□□ -1.4
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CAPN3-211ENST00000562199 TMF1P82094 1093 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 ROR1Q01973 937 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 TRAF1Q13077 416 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 CCDC178Q5BJE1 867 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 PLBD1Q6P4A8 553 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 TTC37Q6PGP7 1564 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 ERC1Q8IUD2 1116 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 LILRB2Q8N423 598 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 GSDMBQ8TAX9 411 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 C7orf43Q8WVR3 580 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 MAML1Q92585 1016 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 CEP95Q96GE4 821 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 DHRS1Q96LJ7 313 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 SLC30A3Q99726 388 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 TCHPQ9BT92 498 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 SCAPERQ9BY12 1400 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 EPS15L1Q9UBC2 864 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 SYCP2Q9BX26 1530 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 CEP152O94986 1710 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 NEURL4Q96JN8 1562 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 SFI1A8K8P3 1242 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 MYO1BO43795 1136 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 CDC45O75419 566 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 FGRP09769 529 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 TSPY4P0CV99 314 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 TSPY10P0CW01 314 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 TNFAIP3P21580 790 aa6.28□□□□□ -1.4
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