RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557657.5

TMEM260-216, Transcript of transmembrane protein 260, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TMEM260, Length 2,572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260-216ENST00000557657 TFRCP02786 760 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
TMEM260-216ENST00000557657 TXNRD1Q16881 649 aa23.91■■□□□ 1.42
TMEM260-216ENST00000557657 SEPT12Q8IYM1 358 aa23.91■■□□□ 1.42
TMEM260-216ENST00000557657 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
TMEM260-216ENST00000557657 MNS1Q8NEH6 495 aa23.91■■□□□ 1.42
TMEM260-216ENST00000557657 ST7Q9NRC1 585 aa23.91■■□□□ 1.42
TMEM260-216ENST00000557657 KLRC4O43908 158 aa23.91■■□□□ 1.42
TMEM260-216ENST00000557657 CCDC148Q8NFR7 591 aa23.91■■□□□ 1.42
TMEM260-216ENST00000557657 NEDD1Q8NHV4 660 aa23.91■■□□□ 1.42
TMEM260-216ENST00000557657 HPS3Q969F9 1004 aa23.91■■□□□ 1.42
TMEM260-216ENST00000557657 PLCG1P19174 1290 aa23.9■■□□□ 1.42
TMEM260-216ENST00000557657 CLCN6P51797 869 aa23.9■■□□□ 1.42
TMEM260-216ENST00000557657 CTAGE1Q96RT6 745 aa23.9■■□□□ 1.42
TMEM260-216ENST00000557657 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa23.9■■□□□ 1.42
TMEM260-216ENST00000557657 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
TMEM260-216ENST00000557657 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa23.9■■□□□ 1.42
TMEM260-216ENST00000557657 PES1O00541 588 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
TMEM260-216ENST00000557657 TADA3O75528 432 aa23.9■■□□□ 1.42
TMEM260-216ENST00000557657 ATP2B4P23634 1241 aa23.9■■□□□ 1.42
TMEM260-216ENST00000557657 ERVK-24P63145 666 aa23.9■■□□□ 1.42
TMEM260-216ENST00000557657 ST5P78524 1137 aa23.9■■□□□ 1.42
TMEM260-216ENST00000557657 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
TMEM260-216ENST00000557657 ZMYND12Q9H0C1 365 aa23.9■■□□□ 1.42
TMEM260-216ENST00000557657 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa23.89■■□□□ 1.42
TMEM260-216ENST00000557657 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP23.89■■□□□ 1.42
TMEM260-216ENST00000557657 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.42
TMEM260-216ENST00000557657 TECP42680 631 aa23.89■■□□□ 1.42
TMEM260-216ENST00000557657 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.42
TMEM260-216ENST00000557657 UBXN4Q92575 508 aa23.89■■□□□ 1.42
TMEM260-216ENST00000557657 COA7Q96BR5 231 aa23.89■■□□□ 1.42
TMEM260-216ENST00000557657 LY75O60449 1722 aa23.89■■□□□ 1.41
TMEM260-216ENST00000557657 CCDC175P0C221 793 aa23.89■■□□□ 1.41
TMEM260-216ENST00000557657 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
TMEM260-216ENST00000557657 DAGLBQ8NCG7 672 aa23.89■■□□□ 1.41
TMEM260-216ENST00000557657 CERKQ8TCT0 537 aa23.89■■□□□ 1.41
TMEM260-216ENST00000557657 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
TMEM260-216ENST00000557657 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
TMEM260-216ENST00000557657 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa23.89■■□□□ 1.41
TMEM260-216ENST00000557657 ADSSL1Q8N142 457 aa23.88■■□□□ 1.41
TMEM260-216ENST00000557657 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
TMEM260-216ENST00000557657 TUBB4AP04350 444 aa23.88■■□□□ 1.41
TMEM260-216ENST00000557657 UBXN1Q04323 297 aa23.88■■□□□ 1.41
TMEM260-216ENST00000557657 TBCKQ8TEA7 893 aa23.88■■□□□ 1.41
TMEM260-216ENST00000557657 UIMC1Q96RL1 719 aa23.88■■□□□ 1.41
TMEM260-216ENST00000557657 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
TMEM260-216ENST00000557657 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
TMEM260-216ENST00000557657 POTEDQ86YR6 584 aa23.87■■□□□ 1.41
TMEM260-216ENST00000557657 SPZ1Q9BXG8 430 aa23.87■■□□□ 1.41
TMEM260-216ENST00000557657 MYH8P13535 1937 aa23.87■■□□□ 1.41
TMEM260-216ENST00000557657 LRRC10BA6NIK2 292 aa23.87■■□□□ 1.41
TMEM260-216ENST00000557657 AKR1B1P15121 316 aa23.87■■□□□ 1.41
TMEM260-216ENST00000557657 MAP3K9P80192 1104 aa23.87■■□□□ 1.41
TMEM260-216ENST00000557657 CABP7Q86V35 215 aa23.87■■□□□ 1.41
TMEM260-216ENST00000557657 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
TMEM260-216ENST00000557657 KBTBD4Q9NVX7 518 aa23.87■■□□□ 1.41
TMEM260-216ENST00000557657 RMND1Q9NWS8 449 aa23.87■■□□□ 1.41
TMEM260-216ENST00000557657 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
TMEM260-216ENST00000557657 SCNN1DP51172 638 aa23.86■■□□□ 1.41
TMEM260-216ENST00000557657 CCDC178Q5BJE1 867 aa23.86■■□□□ 1.41
TMEM260-216ENST00000557657 CERS5Q8N5B7 392 aa23.86■■□□□ 1.41
TMEM260-216ENST00000557657 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
TMEM260-216ENST00000557657 CHP1Q99653 195 aa23.86■■□□□ 1.41
TMEM260-216ENST00000557657 GPCPD1Q9NPB8 672 aa23.86■■□□□ 1.41
TMEM260-216ENST00000557657 MRFAP1Q9Y605 127 aa23.86■■□□□ 1.41
TMEM260-216ENST00000557657 OR52Z1P0C646 297 aa23.86■■□□□ 1.41
TMEM260-216ENST00000557657 FCER1AP12319 257 aa23.86■■□□□ 1.41
TMEM260-216ENST00000557657 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP23.86■■□□□ 1.41
TMEM260-216ENST00000557657 ABHD10Q9NUJ1 306 aa23.86■■□□□ 1.41
TMEM260-216ENST00000557657 AFF2P51816 1311 aa23.85■■□□□ 1.41
TMEM260-216ENST00000557657 DOK7Q18PE1 504 aa23.85■■□□□ 1.41
TMEM260-216ENST00000557657 GJA10Q969M2 543 aa23.85■■□□□ 1.41
TMEM260-216ENST00000557657 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
TMEM260-216ENST00000557657 TFR2Q9UP52 801 aa23.85■■□□□ 1.41
TMEM260-216ENST00000557657 PDHBP11177 359 aa23.85■■□□□ 1.41
TMEM260-216ENST00000557657 TXKP42681 527 aa23.85■■□□□ 1.41
TMEM260-216ENST00000557657 PPP2R3AQ06190 1150 aa23.85■■□□□ 1.41
TMEM260-216ENST00000557657 TEX35Q5T0J7 233 aa23.85■■□□□ 1.41
TMEM260-216ENST00000557657 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
TMEM260-216ENST00000557657 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
TMEM260-216ENST00000557657 STK4Q13043 487 aa23.84■■□□□ 1.41
TMEM260-216ENST00000557657 TRIM47Q96LD4 638 aa23.84■■□□□ 1.41
TMEM260-216ENST00000557657 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
TMEM260-216ENST00000557657 CCSER1Q9C0I3 900 aa23.84■■□□□ 1.41
TMEM260-216ENST00000557657 ZNF287Q9HBT7 754 aa23.84■■□□□ 1.41
TMEM260-216ENST00000557657 KRT9P35527 623 aa23.84■■□□□ 1.41
TMEM260-216ENST00000557657 KLK7P49862 253 aa23.84■■□□□ 1.41
TMEM260-216ENST00000557657 NEK8Q86SG6 692 aa23.84■■□□□ 1.41
TMEM260-216ENST00000557657 CNGA4Q8IV77 575 aa23.84■■□□□ 1.41
TMEM260-216ENST00000557657 SLF1Q9BQI6 1058 aa23.84■■□□□ 1.41
TMEM260-216ENST00000557657 C6orf50Q9HD87 102 aa23.84■■□□□ 1.41
TMEM260-216ENST00000557657 GAKO14976 1311 aa23.83■■□□□ 1.41
TMEM260-216ENST00000557657 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa23.83■■□□□ 1.41
TMEM260-216ENST00000557657 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
TMEM260-216ENST00000557657 EDIL3O43854 480 aa23.83■■□□□ 1.41
TMEM260-216ENST00000557657 TRIM37O94972 964 aa23.83■■□□□ 1.41
TMEM260-216ENST00000557657 ZNF569Q5MCW4 686 aa23.83■■□□□ 1.41
TMEM260-216ENST00000557657 ZBTB9Q96C00 473 aa23.83■■□□□ 1.41
TMEM260-216ENST00000557657 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
TMEM260-216ENST00000557657 ZBTB22O15209 634 aa23.83■■□□□ 1.4
TMEM260-216ENST00000557657 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms