RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530727.5

PTPRC-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 1,962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-214ENST00000530727 PRDM14Q9GZV8 571 aa5.71□□□□□ -1.49
PTPRC-214ENST00000530727 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa5.71□□□□□ -1.49
PTPRC-214ENST00000530727 MYO5CQ9NQX4 1742 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-214ENST00000530727 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-214ENST00000530727 HFM1A2PYH4 1435 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-214ENST00000530727 ABCC5O15440 1437 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-214ENST00000530727 AKNAQ7Z591 1439 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-214ENST00000530727 SETD5Q9C0A6 1442 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-214ENST00000530727 HK2P52789 917 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-214ENST00000530727 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
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PTPRC-214ENST00000530727 C19orf73Q9NVV2 129 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-214ENST00000530727 CROCC2H7BZ55 1655 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-214ENST00000530727 WDR7Q9Y4E6 1490 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-214ENST00000530727 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa5.7□□□□□ -1.5
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PTPRC-214ENST00000530727 NAIPQ13075 1403 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-214ENST00000530727 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa5.7□□□□□ -1.5
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PTPRC-214ENST00000530727 ARAP3Q8WWN8 1544 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-214ENST00000530727 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa5.7□□□□□ -1.5
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PTPRC-214ENST00000530727 MBD5Q9P267 1494 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-214ENST00000530727 GCC2Q8IWJ2 1684 aa5.7□□□□□ -1.5
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PTPRC-214ENST00000530727 CAPN10Q9HC96 672 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-214ENST00000530727 FAM86C1Q9NVL1 165 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-214ENST00000530727 GFOD1Q9NXC2 390 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-214ENST00000530727 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
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PTPRC-214ENST00000530727 PLCH2O75038 1416 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-214ENST00000530727 MEIS1O00470 390 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-214ENST00000530727 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
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PTPRC-214ENST00000530727 FMNL2Q96PY5 1086 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-214ENST00000530727 FOXP3Q9BZS1 431 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-214ENST00000530727 CHST7Q9NS84 486 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-214ENST00000530727 SLC12A7Q9Y666 1083 aa5.69□□□□□ -1.5
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PTPRC-214ENST00000530727 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-214ENST00000530727 PPP2R5EQ16537 467 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-214ENST00000530727 BBS9Q3SYG4 887 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-214ENST00000530727 FYB2Q5VWT5 728 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-214ENST00000530727 RNF111Q6ZNA4 994 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-214ENST00000530727 PPFIBP1Q86W92 1011 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-214ENST00000530727 VPS37DQ86XT2 251 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-214ENST00000530727 C7orf61Q8IZ16 206 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-214ENST00000530727 SHDQ96IW2 340 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-214ENST00000530727 DSCC1Q9BVC3 393 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-214ENST00000530727 TCFL5Q9UL49 500 aa5.68□□□□□ -1.5
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PTPRC-214ENST00000530727 MAPKBP1O60336 1514 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-214ENST00000530727 SHANK2Q9UPX8 1470 aa5.68□□□□□ -1.5
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PTPRC-214ENST00000530727 RPL10P27635 214 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
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PTPRC-214ENST00000530727 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-214ENST00000530727 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-214ENST00000530727 FKTNO75072 461 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-214ENST00000530727 SYPP08247 313 aa5.67□□□□□ -1.5
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PTPRC-214ENST00000530727 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-214ENST00000530727 ERVFC1P60507 584 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-214ENST00000530727 DUSP4Q13115 394 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-214ENST00000530727 TMEM67Q5HYA8 995 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-214ENST00000530727 DCAF15Q66K64 600 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-214ENST00000530727 WAPLQ7Z5K2 1190 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-214ENST00000530727 OXR1Q8N573 874 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-214ENST00000530727 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-214ENST00000530727 PDZD8Q8NEN9 1154 aa5.67□□□□□ -1.5
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