RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 DEXIO95424 95 aa26.29■■□□□ 1.8
TSNARE1-208ENST00000524325 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
TSNARE1-208ENST00000524325 USH1GQ495M9 461 aa26.29■■□□□ 1.8
TSNARE1-208ENST00000524325 WWC2Q6AWC2 1192 aa26.29■■□□□ 1.8
TSNARE1-208ENST00000524325 TYW1BQ6NUM6 668 aa26.29■■□□□ 1.8
TSNARE1-208ENST00000524325 AGBL1Q96MI9 1066 aa26.29■■□□□ 1.8
TSNARE1-208ENST00000524325 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
TSNARE1-208ENST00000524325 SCG2P13521 617 aa26.28■■□□□ 1.8
TSNARE1-208ENST00000524325 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
TSNARE1-208ENST00000524325 ANKRD23Q86SG2 305 aa26.28■■□□□ 1.8
TSNARE1-208ENST00000524325 HOXC10Q9NYD6 342 aa26.28■■□□□ 1.8
TSNARE1-208ENST00000524325 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa26.27■■□□□ 1.8
TSNARE1-208ENST00000524325 HERVK_113P62684 666 aa26.27■■□□□ 1.8
TSNARE1-208ENST00000524325 PAGR1Q9BTK6 254 aa26.27■■□□□ 1.8
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa26.27■■□□□ 1.8
TSNARE1-208ENST00000524325 STK36Q9NRP7 1315 aa26.27■■□□□ 1.8
TSNARE1-208ENST00000524325 OSBPP22059 807 aa26.27■■□□□ 1.8
TSNARE1-208ENST00000524325 PKP1Q13835 747 aa26.27■■□□□ 1.8
TSNARE1-208ENST00000524325 IFNL1Q8IU54 200 aa26.27■■□□□ 1.8
TSNARE1-208ENST00000524325 KCNJ14Q9UNX9 436 aa26.27■■□□□ 1.8
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF536O15090 1300 aa26.26■■□□□ 1.8
TSNARE1-208ENST00000524325 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.8
TSNARE1-208ENST00000524325 CEP350Q5VT06 3117 aa26.26■■□□□ 1.79
TSNARE1-208ENST00000524325 NOGQ13253 232 aa26.26■■□□□ 1.79
TSNARE1-208ENST00000524325 TMEM132BQ14DG7 1078 aa26.26■■□□□ 1.79
TSNARE1-208ENST00000524325 TXNRD2Q9NNW7 524 aa26.26■■□□□ 1.79
TSNARE1-208ENST00000524325 BTBD7Q9P203 1132 aa26.26■■□□□ 1.79
TSNARE1-208ENST00000524325 LOC285556D6RIA3 1793 aa26.26■■□□□ 1.79
TSNARE1-208ENST00000524325 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP26.26■■□□□ 1.79
TSNARE1-208ENST00000524325 PLS1Q14651 629 aa26.26■■□□□ 1.79
TSNARE1-208ENST00000524325 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa26.26■■□□□ 1.79
TSNARE1-208ENST00000524325 ADAMTS3O15072 1205 aa26.25■■□□□ 1.79
TSNARE1-208ENST00000524325 ZBED4O75132 1171 aa26.25■■□□□ 1.79
TSNARE1-208ENST00000524325 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
TSNARE1-208ENST00000524325 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
TSNARE1-208ENST00000524325 REPS2Q8NFH8 660 aa26.25■■□□□ 1.79
TSNARE1-208ENST00000524325 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
TSNARE1-208ENST00000524325 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
TSNARE1-208ENST00000524325 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
TSNARE1-208ENST00000524325 FBXO11Q86XK2 927 aa26.24■■□□□ 1.79
TSNARE1-208ENST00000524325 HOMER2Q9NSB8 354 aa26.24■■□□□ 1.79
TSNARE1-208ENST00000524325 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa26.24■■□□□ 1.79
TSNARE1-208ENST00000524325 STXBP3O00186 592 aa26.24■■□□□ 1.79
TSNARE1-208ENST00000524325 HSPA6P17066 643 aa26.24■■□□□ 1.79
TSNARE1-208ENST00000524325 SYT1P21579 422 aa26.24■■□□□ 1.79
TSNARE1-208ENST00000524325 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa26.24■■□□□ 1.79
TSNARE1-208ENST00000524325 RBPJLQ9UBG7 517 aa26.24■■□□□ 1.79
TSNARE1-208ENST00000524325 RIPK3Q9Y572 518 aa26.24■■□□□ 1.79
TSNARE1-208ENST00000524325 SREBF2Q12772 1141 aa26.23■■□□□ 1.79
TSNARE1-208ENST00000524325 C8orf76Q96K31 380 aa26.23■■□□□ 1.79
TSNARE1-208ENST00000524325 CCPG1Q9ULG6 757 aa26.23■■□□□ 1.79
TSNARE1-208ENST00000524325 CNMDO75829 334 aa26.22■■□□□ 1.79
TSNARE1-208ENST00000524325 LBX2Q6XYB7 198 aa26.22■■□□□ 1.79
TSNARE1-208ENST00000524325 AMNQ9BXJ7 453 aa26.22■■□□□ 1.79
TSNARE1-208ENST00000524325 BARHL2Q9NY43 387 aa26.22■■□□□ 1.79
TSNARE1-208ENST00000524325 PNMA3Q9UL41 463 aa26.22■■□□□ 1.79
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
TSNARE1-208ENST00000524325 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
TSNARE1-208ENST00000524325 TM4SF4P48230 202 aa26.22■■□□□ 1.79
TSNARE1-208ENST00000524325 NAPAP54920 295 aa26.22■■□□□ 1.79
TSNARE1-208ENST00000524325 Q3C1V9 767 aa26.22■■□□□ 1.79
TSNARE1-208ENST00000524325 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa26.22■■□□□ 1.79
TSNARE1-208ENST00000524325 ICAM1P05362 532 aa26.21■■□□□ 1.79
TSNARE1-208ENST00000524325 INHBEP58166 350 aa26.21■■□□□ 1.79
TSNARE1-208ENST00000524325 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
TSNARE1-208ENST00000524325 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa26.21■■□□□ 1.79
TSNARE1-208ENST00000524325 WASF1Q92558 559 aa26.21■■□□□ 1.79
TSNARE1-208ENST00000524325 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.79
TSNARE1-208ENST00000524325 ALAS1P13196 640 aa26.2■■□□□ 1.79
TSNARE1-208ENST00000524325 KRT40Q6A162 431 aa26.2■■□□□ 1.79
TSNARE1-208ENST00000524325 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.79
TSNARE1-208ENST00000524325 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.79
TSNARE1-208ENST00000524325 MYPNQ86TC9 1320 aa26.2■■□□□ 1.79
TSNARE1-208ENST00000524325 RLFQ13129 1914 aa26.2■■□□□ 1.78
TSNARE1-208ENST00000524325 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
TSNARE1-208ENST00000524325 CPA4Q9UI42 421 aa26.2■■□□□ 1.78
TSNARE1-208ENST00000524325 DDIT3P35638 169 aa26.19■■□□□ 1.78
TSNARE1-208ENST00000524325 H3BQV1 296 aa26.18■■□□□ 1.78
TSNARE1-208ENST00000524325 STAT3P40763 770 aa26.18■■□□□ 1.78
TSNARE1-208ENST00000524325 NLRP5P59047 1200 aa26.18■■□□□ 1.78
TSNARE1-208ENST00000524325 MUM1L1Q5H9M0 696 aa26.18■■□□□ 1.78
TSNARE1-208ENST00000524325 IFFO2Q5TF58 517 aa26.18■■□□□ 1.78
TSNARE1-208ENST00000524325 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa26.18■■□□□ 1.78
TSNARE1-208ENST00000524325 TBC1D5Q92609 795 aa26.18■■□□□ 1.78
TSNARE1-208ENST00000524325 OXER1Q8TDS5 423 aa26.18■■□□□ 1.78
TSNARE1-208ENST00000524325 KIF3AQ9Y496 699 aa26.18■■□□□ 1.78
TSNARE1-208ENST00000524325 SMCO2A6NFE2 343 aa26.17■■□□□ 1.78
TSNARE1-208ENST00000524325 OPLAHO14841 1288 aa26.17■■□□□ 1.78
TSNARE1-208ENST00000524325 STX6O43752 255 aa26.17■■□□□ 1.78
TSNARE1-208ENST00000524325 CRHR2Q13324 411 aa26.17■■□□□ 1.78
TSNARE1-208ENST00000524325 TRIM29Q14134 588 aa26.17■■□□□ 1.78
TSNARE1-208ENST00000524325 SPATC1LQ9H0A9 340 aa26.17■■□□□ 1.78
TSNARE1-208ENST00000524325 NFIBO00712 420 aa26.16■■□□□ 1.78
TSNARE1-208ENST00000524325 NPY5RQ15761 445 aa26.16■■□□□ 1.78
TSNARE1-208ENST00000524325 FERMT3Q86UX7 667 aa26.16■■□□□ 1.78
TSNARE1-208ENST00000524325 RASGRP4Q8TDF6 673 aa26.16■■□□□ 1.78
TSNARE1-208ENST00000524325 PHF20Q9BVI0 1012 aa26.16■■□□□ 1.78
TSNARE1-208ENST00000524325 TEX13BQ9BXU2 312 aa26.16■■□□□ 1.78
TSNARE1-208ENST00000524325 MTMR6Q9Y217 621 aa26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms