RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521038.5

PHF20L1-217, Transcript of PHD finger protein 20 like 1, human

TSL 5

Gene PHF20L1, Length 427 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PHF20L1-217	ENST00000521038	LAMB3	Q13751	1172 aa		6.53	□□□□□ -1.36
PHF20L1-217	ENST00000521038	BLMH	Q13867	455 aa		6.53	□□□□□ -1.36
PHF20L1-217	ENST00000521038	NR1I3	Q14994	352 aa		6.53	□□□□□ -1.36
PHF20L1-217	ENST00000521038	SLC39A14	Q15043	492 aa		6.53	□□□□□ -1.36
PHF20L1-217	ENST00000521038	PPP2R5E	Q16537	467 aa		6.53	□□□□□ -1.36
PHF20L1-217	ENST00000521038	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
PHF20L1-217	ENST00000521038	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		6.53	□□□□□ -1.36
PHF20L1-217	ENST00000521038	FOXR1	Q6PIV2	292 aa		6.53	□□□□□ -1.36
PHF20L1-217	ENST00000521038	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
PHF20L1-217	ENST00000521038	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		6.53	□□□□□ -1.36
PHF20L1-217	ENST00000521038	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
PHF20L1-217	ENST00000521038	SPATA21	Q7Z572	469 aa		6.53	□□□□□ -1.36
PHF20L1-217	ENST00000521038	ARHGAP22	Q7Z5H3	698 aa		6.53	□□□□□ -1.36
PHF20L1-217	ENST00000521038	NLRP14	Q86W24	1093 aa		6.53	□□□□□ -1.36
PHF20L1-217	ENST00000521038	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
PHF20L1-217	ENST00000521038	PDILT	Q8N807	584 aa		6.53	□□□□□ -1.36
PHF20L1-217	ENST00000521038	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		6.53	□□□□□ -1.36
PHF20L1-217	ENST00000521038	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
PHF20L1-217	ENST00000521038	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		6.53	□□□□□ -1.36
PHF20L1-217	ENST00000521038	WASF1	Q92558	559 aa		6.53	□□□□□ -1.36
PHF20L1-217	ENST00000521038	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		6.53	□□□□□ -1.36
PHF20L1-217	ENST00000521038	RAB3IP	Q96QF0	476 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
PHF20L1-217	ENST00000521038	RHOXF2	Q9BQY4	288 aa		6.53	□□□□□ -1.36
PHF20L1-217	ENST00000521038	MIS12	Q9H081	205 aa		6.53	□□□□□ -1.36
PHF20L1-217	ENST00000521038	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
PHF20L1-217	ENST00000521038	WDR70	Q9NW82	654 aa		6.53	□□□□□ -1.36
PHF20L1-217	ENST00000521038	CTTNBP2NL	Q9P2B4	639 aa		6.53	□□□□□ -1.36
PHF20L1-217	ENST00000521038	TMCO1	Q9UM00	188 aa		6.53	□□□□□ -1.36
PHF20L1-217	ENST00000521038	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		6.53	□□□□□ -1.36
PHF20L1-217	ENST00000521038	HPSE	Q9Y251	543 aa		6.53	□□□□□ -1.36
PHF20L1-217	ENST00000521038	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		6.53	□□□□□ -1.36
PHF20L1-217	ENST00000521038	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		6.53	□□□□□ -1.36
PHF20L1-217	ENST00000521038	MRC1	P22897	1456 aa		6.53	□□□□□ -1.36
PHF20L1-217	ENST00000521038	PTPRM	P28827	1452 aa		6.53	□□□□□ -1.36
PHF20L1-217	ENST00000521038	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	6.52	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	6.52	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	CPS1	P31327	1500 aa		6.52	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	GRID2IP	A4D2P6	1211 aa		6.52	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038		B4DLN1	442 aa		6.52	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	TMEM232	C9JQI7	657 aa		6.52	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	CES2	O00748	559 aa		6.52	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	CREB3	O43889	395 aa		6.52	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	6.52	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	6.52	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	PHACTR2	O75167	634 aa		6.52	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	6.52	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	LARGE1	O95461	756 aa		6.52	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	ALAD	P13716	330 aa		6.52	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	MLLT3	P42568	568 aa	Predicted RBP	6.52	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	PLCD1	P51178	756 aa		6.52	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	CLCN2	P51788	898 aa		6.52	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	RAB15	P59190	212 aa		6.52	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	ATP11A	P98196	1134 aa		6.52	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	6.52	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	6.52	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	6.52	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	DBN1	Q16643	649 aa		6.52	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	TSNAXIP1	Q2TAA8	658 aa		6.52	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	6.52	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	ANKRD20A8P	Q5CZ79	823 aa		6.52	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	AGBL2	Q5U5Z8	902 aa		6.52	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	SPATA1	Q5VX52	437 aa		6.52	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		6.52	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		6.52	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		6.52	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	6.52	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	HDAC7	Q8WUI4	952 aa		6.52	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		6.52	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	ATP6V1G3	Q96LB4	118 aa		6.52	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	USP28	Q96RU2	1077 aa		6.52	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	CCT8L2	Q96SF2	557 aa		6.52	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		6.52	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	6.52	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		6.52	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		6.52	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	6.52	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		6.52	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		6.52	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	ZMYM6	O95789	1325 aa		6.51	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038		A0A1W2PQC6	194 aa		6.51	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		6.51	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		6.51	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	MYO1F	O00160	1098 aa		6.51	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	APBB1	O00213	710 aa		6.51	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038		O00370	1275 aa		6.51	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	BIN1	O00499	593 aa		6.51	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	ASAP2	O43150	1006 aa		6.51	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	CEP104	O60308	925 aa		6.51	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	TACC1	O75410	805 aa		6.51	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	6.51	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	ATP6V1G2	O95670	118 aa		6.51	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	BAG3	O95817	575 aa		6.51	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	6.51	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	DES	P17661	470 aa		6.51	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	ABCD1	P33897	745 aa		6.51	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	PSMC4	P43686	418 aa		6.51	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	CCNH	P51946	323 aa	Predicted RBP	6.51	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	NDUFA8	P51970	172 aa		6.51	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	DEUP1	Q05D60	604 aa		6.51	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	ST3GAL1	Q11201	340 aa		6.51	□□□□□ -1.37

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.4 ms