RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514813.6

RRN3P1-201, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor pseudogene 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RRN3P1, Length 3,645 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1-201ENST00000514813 GIMAP6Q6P9H5 292 aa7.61□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 DPF3Q92784 378 aa7.61□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 SLF1Q9BQI6 1058 aa7.61□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 TMEM47Q9BQJ4 181 aa7.61□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 EHD4Q9H223 541 aa7.61□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa7.61□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 NEDD4P46934 1319 aa7.61□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 MCM5P33992 734 aa7.61□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 SERPINB4P48594 390 aa7.61□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 UBXN2AP68543 259 aa7.61□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 Q3C1V9 767 aa7.61□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 CREB3L3Q68CJ9 461 aa7.61□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 ANKRD23Q86SG2 305 aa7.61□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 UIMC1Q96RL1 719 aa7.61□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 OSBPL3Q9H4L5 887 aa7.61□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF112Q9UJU3 913 aa7.61□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 ANKRD62A6NC57 917 aa7.6□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 E7EWF7 191 aa7.6□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 PITPNM1O00562 1244 aa7.6□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 MAP3K7O43318 606 aa7.6□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 TOP1P11387 765 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 ERVK-9P63128 1117 aa7.6□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 ERVK-24P63145 666 aa7.6□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 NEDD1Q8NHV4 660 aa7.6□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 DEFB118Q96PH6 123 aa7.6□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 NEK1Q96PY6 1258 aa7.6□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 CENPFP49454 3210 aa7.6□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 FCER1AP12319 257 aa7.6□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 GRK4P32298 578 aa7.6□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 CYP2C19P33261 490 aa7.6□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 SBK1Q52WX2 424 aa7.6□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 TATDN1Q6P1N9 297 aa7.6□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa7.6□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 TXNRD2Q9NNW7 524 aa7.6□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 GABRQQ9UN88 632 aa7.6□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 TAF6LQ9Y6J9 622 aa7.6□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 C2orf72A6NCS6 295 aa7.6□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 BRF1Q92994 677 aa7.6□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 TRIM47Q96LD4 638 aa7.6□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 WDR18Q9BV38 432 aa7.6□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 DSCC1Q9BVC3 393 aa7.6□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 SLC5A4Q9NY91 659 aa7.6□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 TMX2Q9Y320 296 aa7.6□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 POTEB2H3BUK9 544 aa7.59□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa7.59□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 PLEKHH3Q7Z736 793 aa7.59□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 LPAR1Q92633 364 aa7.59□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 AGBL1Q96MI9 1066 aa7.59□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 PKD2L1Q9P0L9 805 aa7.59□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 KCNH4Q9UQ05 1017 aa7.59□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 CNPY2Q9Y2B0 182 aa7.59□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa7.59□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 KLRF2D3W0D1 207 aa7.59□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 SLC27A2O14975 620 aa7.59□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 WDR46O15213 610 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 ATP2B1P20020 1258 aa7.59□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 GABPAQ06546 454 aa7.59□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa7.59□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF662Q6ZS27 426 aa7.59□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 MMP19Q99542 508 aa7.59□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 GOLGA8BA8MQT2 603 aa7.59□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 MARCH6O60337 910 aa7.59□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 NEK4P51957 841 aa7.59□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 MTFR1Q15390 333 aa7.59□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa7.59□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 SPATC1LQ9H0A9 340 aa7.59□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 RNF146Q9NTX7 359 aa7.59□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
RRN3P1-201ENST00000514813 ATRNL1Q5VV63 1379 aa7.59□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 LRRC37AA6NMS7 1700 aa7.58□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 GUCY1A2P33402 732 aa7.58□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa7.58□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa7.58□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF710Q8N1W2 664 aa7.58□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 FERMT2Q96AC1 680 aa7.58□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 PRDM10Q9NQV6 1147 aa7.58□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa7.58□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 SSC5DA1L4H1 1573 aa7.58□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 GOLGA8AA7E2F4 631 aa7.58□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 PSMA5P28066 241 aa7.58□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 TMEM164Q5U3C3 297 aa7.58□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.1 ms