RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511362.5

ATXN3-211, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 3

Gene ATXN3, Length 591 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-211ENST00000511362 GPATCH2Q9NW75 528 aa4.79□□□□□ -1.64
ATXN3-211ENST00000511362 GRIN2AQ12879 1464 aa4.79□□□□□ -1.64
ATXN3-211ENST00000511362 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
ATXN3-211ENST00000511362 FGD5Q6ZNL6 1462 aa4.78□□□□□ -1.64
ATXN3-211ENST00000511362 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa4.78□□□□□ -1.64
ATXN3-211ENST00000511362 DNAJA2O60884 412 aa4.78□□□□□ -1.64
ATXN3-211ENST00000511362 SDHBP21912 280 aa4.78□□□□□ -1.64
ATXN3-211ENST00000511362 GARTP22102 1010 aa4.78□□□□□ -1.64
ATXN3-211ENST00000511362 ETV3P41162 512 aa4.78□□□□□ -1.64
ATXN3-211ENST00000511362 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
ATXN3-211ENST00000511362 TMEM201Q5SNT2 666 aa4.78□□□□□ -1.64
ATXN3-211ENST00000511362 SNAP47Q5SQN1 464 aa4.78□□□□□ -1.64
ATXN3-211ENST00000511362 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
ATXN3-211ENST00000511362 KBTBD4Q9NVX7 518 aa4.78□□□□□ -1.64
ATXN3-211ENST00000511362 REV1Q9UBZ9 1251 aa4.78□□□□□ -1.64
ATXN3-211ENST00000511362 PRR36Q9H6K5 1346 aa4.77□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 KIF21BO75037 1637 aa4.77□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 TLR3O15455 904 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 HTR3BO95264 441 aa4.77□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 ERCC3P19447 782 aa4.77□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 OLFML2BQ68BL8 750 aa4.77□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 LDHDQ86WU2 507 aa4.77□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 HOMEZQ8IX15 550 aa4.77□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa4.77□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 BCL2L13Q9BXK5 485 aa4.77□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 GPR62Q9BZJ7 368 aa4.77□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 KLHL3Q9UH77 587 aa4.77□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 YARSP54577 528 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 CAP1Q01518 475 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 NUP160Q12769 1436 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 PWP1Q13610 501 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 FBXL19Q6PCT2 694 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 CRIP3Q6Q6R5 217 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 ERMP1Q7Z2K6 904 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 DTWD2Q8NBA8 298 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 GIPC2Q8TF65 315 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 LINC01599Q8WXQ3 324 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 C8orf49Q96NF6 230 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 CRTAC1Q9NQ79 661 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 DUSP10Q9Y6W6 482 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 PTPRMP28827 1452 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 ADAMTS12P58397 1594 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 CNR2P34972 360 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 TNNI2P48788 182 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 MPP2Q14168 576 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 FAM196AQ6ZSG2 479 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 REC114Q7Z4M0 266 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 SPRED1Q7Z699 444 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 SLFN12Q8IYM2 578 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 KIF2CQ99661 725 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 G6PC3Q9BUM1 346 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 PCED1AQ9H1Q7 454 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 TEX14Q8IWB6 1497 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 ABLIM1O14639 778 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 FZD7O75084 574 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 NCKAP1LP55160 1127 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 TEKQ02763 1124 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 USP51Q70EK9 711 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 PHACTR4Q8IZ21 702 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 TTC9BQ8N6N2 239 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 LOXL4Q96JB6 756 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 CCDC74BQ96LY2 380 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 KREMEN1Q96MU8 473 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 SPATA25Q9BR10 227 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 BRMS1Q9HCU9 246 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 A0A1B0GTL3 188 aa4.73□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 SHISA3A0PJX4 238 aa4.73□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 GREM1O60565 184 aa4.73□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 CRKP46108 304 aa4.73□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 RNF141Q8WVD5 230 aa4.73□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 SAMD11Q96NU1 681 aa4.73□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa4.73□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 GGT7Q9UJ14 662 aa4.73□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 KCNH3Q9ULD8 1083 aa4.73□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa4.73□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 GLI2P10070 1586 aa4.73□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 NRDCO43847 1150 aa4.72□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 USP2O75604 605 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 GBP1P32455 592 aa4.72□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 ARSHQ5FYA8 562 aa4.72□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 LDLRAD1Q5T700 205 aa4.72□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 LIPIQ6XZB0 460 aa4.72□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 TMC6Q7Z403 805 aa4.72□□□□□ -1.65
ATXN3-211ENST00000511362 NLGN1Q8N2Q7 840 aa4.72□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.1 ms